「mrcImageOrientationSearchByHybridization」の版間の差分
提供: Eospedia
細 (Kinoshita がページ「MrcImageOrientationSearchByHybridization」を「mrcImageOrientationSearchByHybridization」に移動しました) |
|||
| (同じ利用者による、間の1版が非表示) | |||
| 行14: | 行14: | ||
<td>-I</td> | <td>-I</td> | ||
<td>必須</td> | <td>必須</td> | ||
| − | <td> | + | <td>入力ファイルリスト: [[ASCII]]</td> |
<td>NULL</td> | <td>NULL</td> | ||
</tr> | </tr> | ||
| 行72: | 行72: | ||
</tr> | </tr> | ||
</table> | </table> | ||
| + | <br> | ||
===モードの詳細=== | ===モードの詳細=== | ||
| 行88: | 行89: | ||
</tr> | </tr> | ||
</table> | </table> | ||
| + | <br> | ||
===-ir の詳細=== | ===-ir の詳細=== | ||
| 行105: | 行107: | ||
</tr> | </tr> | ||
</table> | </table> | ||
| + | <br> | ||
===-ms の詳細=== | ===-ms の詳細=== | ||
| 行121: | 行124: | ||
</tr> | </tr> | ||
</table> | </table> | ||
| + | <br> | ||
| + | ===-I のフォーマット=== | ||
| + | <pre> | ||
| + | childrenfile0 | ||
| + | childrenfile1 | ||
| + | . | ||
| + | . | ||
| + | . | ||
| + | |||
| + | </pre> | ||
| + | |||
| + | <div>childrenfileのフォーマット</div> | ||
| + | <pre> | ||
| + | filename RotMode phi theta psi | ||
| + | . . . . . | ||
| + | . . . . . | ||
| + | . . . . . | ||
| + | |||
| + | </pre> | ||
| + | <br> | ||
== 実行例 == | == 実行例 == | ||
| + | ===入力ファイルのデータ=== | ||
| + | <pre> | ||
| + | /Eos/Input-file0.txt | ||
| + | /Eos/Input-file1.txt | ||
| + | |||
| + | </pre> | ||
| + | <br> | ||
| + | |||
| + | <div>Input-file0.txtのデータ</div> | ||
| + | <pre> | ||
| + | /Eos/img/Input0 ZONS 0 0 0 | ||
| + | /Eos/img/Input1 ZONS 0 45 0 | ||
| + | /Eos/img/Input2 ZONS 0 0 45 | ||
| + | |||
| + | </pre> | ||
| + | <br> | ||
| + | |||
| + | <div>Input-file1.txtのデータ</div> | ||
| + | <pre> | ||
| + | /Eos/img/Input3 ZONS 90 0 0 | ||
| + | /Eos/img/Input4 ZONS 90 30 0 | ||
| + | /Eos/img/Input5 ZONS 90 60 0 | ||
| + | |||
| + | </pre> | ||
| + | <br> | ||
| + | |||
| + | ===オプション必須項目のみの場合=== | ||
| + | <div>出力結果</div> | ||
| + | <pre> | ||
| + | 1.000000 0.000000 0.000000 | ||
| + | 0.000000 1.000000 0.000000 | ||
| + | 0.000000 0.000000 1.000000 | ||
| + | 0.000000 0.000000 0.000000 | ||
| + | 0.707107 0.000000 0.707107 | ||
| + | 0.000000 1.000000 0.000000 | ||
| + | -0.707107 0.000000 0.707107 | ||
| + | 0.000000 0.000000 0.000000 | ||
| + | 0.707107 -0.707107 0.000000 | ||
| + | 0.707107 0.707107 0.000000 | ||
| + | 0.000000 0.000000 1.000000 | ||
| + | 0.000000 0.000000 0.000000 | ||
| + | 1.000000 0.000000 0.000000 | ||
| + | 0.000000 1.000000 0.000000 | ||
| + | 0.000000 0.000000 1.000000 | ||
| + | 0.000000 0.000000 0.000000 | ||
| + | 1.000000 -0.000000 -0.000000 | ||
| + | -0.000000 0.866025 -0.500000 | ||
| + | 0.000000 0.500000 0.866025 | ||
| + | 0.000000 0.000000 0.000000 | ||
| + | 1.000000 -0.000000 -0.000000 | ||
| + | -0.000000 0.500000 -0.866025 | ||
| + | 0.000000 0.866025 0.500000 | ||
| + | 0.000000 0.000000 0.000000 | ||
| + | HybridizationPoint = 1 FileNum = 1 | ||
| + | </pre> | ||
| + | <br> | ||
| + | |||
| + | <div>o=/Eos/Outdata, e=txtで実行すると以下のファイル名で出力される</div> | ||
| + | <pre> | ||
| + | /Eos/Outdata-0.txt | ||
| + | /Eos/Outdata-1.txt | ||
| + | /Eos/Outdata-2.txt | ||
| + | </pre> | ||
| + | <br> | ||
| + | |||
| + | <div>Outdata-0.txtのデータ</div> | ||
| + | <pre> | ||
| + | /Eos/img/Input3 ZONS 0.0 0.0 0.0 | ||
| + | /Eos/img/Input1 ZONS 0.0 45.0 0.0 | ||
| + | /Eos/img/Input2 ZONS 45.0 0.0 0.0 | ||
| + | </pre> | ||
| + | <br> | ||
| + | |||
| + | <div>Outdata-1.txtのデータ</div> | ||
| + | <pre> | ||
| + | /Eos/img/Input0 ZONS 0.0 0.0 0.0 | ||
| + | /Eos/img/Input1 ZONS 0.0 45.0 0.0 | ||
| + | /Eos/img/Input2 ZONS 45.0 0.0 0.0 | ||
| + | </pre> | ||
| + | <br> | ||
| + | |||
| + | <div>Outdata-2.txtのデータ</div> | ||
| + | <pre> | ||
| + | /Eos/img/Input3 ZONS 0.0 0.0 0.0 | ||
| + | /Eos/img/Input4 ZONS 90.0 30.0 270.0 | ||
| + | /Eos/img/Input5 ZONS 90.0 60.0 270.0 | ||
| + | </pre> | ||
| + | <br> | ||
| + | |||
| + | <br> | ||
2014年3月31日 (月) 06:56時点における最新版
mrcImageOrientationSearchByHybridizationとはEosのコマンドである。
目次
オプション一覧
メインオプション
| オプション | 必須項目/選択項目 | 説明 | デフォルト |
|---|---|---|---|
| -I | 必須 | 入力ファイルリスト: ASCII | NULL |
| -o | 必須 | 出力ファイル設定(ヘッダ) | NULL |
| -e | 必須 | 出力ファイル設定(拡張子) | NULL |
| -ir | 選択 | IncreaseRate | 1 |
| -hpn | 選択 | HybridizationPointNumber(The number of hybridization points) | 1 |
| -ms | 選択 | ModeOfSelection | 0 |
| -ird | 選択 | InitialRandomData | 0 |
| -c | 選択 | コンフィグファイル設定 | NULL |
| -m | 選択 | モードを設定 | 0 |
| -h | 選択 | ヘルプを表示 |
モードの詳細
| モード | 説明 |
|---|---|
| 0 | create children angle file |
| 1 | do not create children angle file , create match angle file |
-ir の詳細
| モード | 説明 |
|---|---|
| 1 | Increase number is 45 (filenum = 10) |
| 2 | Increase number is 90 (filenum = 10) |
-ms の詳細
| モード | 説明 |
|---|---|
| 0 | random |
| 1 | myself (-ird) |
-I のフォーマット
childrenfile0 childrenfile1 . . .
childrenfileのフォーマット
filename RotMode phi theta psi
. . . . .
. . . . .
. . . . .
実行例
入力ファイルのデータ
/Eos/Input-file0.txt /Eos/Input-file1.txt
Input-file0.txtのデータ
/Eos/img/Input0 ZONS 0 0 0 /Eos/img/Input1 ZONS 0 45 0 /Eos/img/Input2 ZONS 0 0 45
Input-file1.txtのデータ
/Eos/img/Input3 ZONS 90 0 0 /Eos/img/Input4 ZONS 90 30 0 /Eos/img/Input5 ZONS 90 60 0
オプション必須項目のみの場合
出力結果
1.000000 0.000000 0.000000
0.000000 1.000000 0.000000
0.000000 0.000000 1.000000
0.000000 0.000000 0.000000
0.707107 0.000000 0.707107
0.000000 1.000000 0.000000
-0.707107 0.000000 0.707107
0.000000 0.000000 0.000000
0.707107 -0.707107 0.000000
0.707107 0.707107 0.000000
0.000000 0.000000 1.000000
0.000000 0.000000 0.000000
1.000000 0.000000 0.000000
0.000000 1.000000 0.000000
0.000000 0.000000 1.000000
0.000000 0.000000 0.000000
1.000000 -0.000000 -0.000000
-0.000000 0.866025 -0.500000
0.000000 0.500000 0.866025
0.000000 0.000000 0.000000
1.000000 -0.000000 -0.000000
-0.000000 0.500000 -0.866025
0.000000 0.866025 0.500000
0.000000 0.000000 0.000000
HybridizationPoint = 1 FileNum = 1
o=/Eos/Outdata, e=txtで実行すると以下のファイル名で出力される
/Eos/Outdata-0.txt /Eos/Outdata-1.txt /Eos/Outdata-2.txt
Outdata-0.txtのデータ
/Eos/img/Input3 ZONS 0.0 0.0 0.0 /Eos/img/Input1 ZONS 0.0 45.0 0.0 /Eos/img/Input2 ZONS 45.0 0.0 0.0
Outdata-1.txtのデータ
/Eos/img/Input0 ZONS 0.0 0.0 0.0 /Eos/img/Input1 ZONS 0.0 45.0 0.0 /Eos/img/Input2 ZONS 45.0 0.0 0.0
Outdata-2.txtのデータ
/Eos/img/Input3 ZONS 0.0 0.0 0.0 /Eos/img/Input4 ZONS 90.0 30.0 270.0 /Eos/img/Input5 ZONS 90.0 60.0 270.0