「llExtractWithLayerSeparationCtrlFileCreate」の版間の差分
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<td>-i</td> | <td>-i</td> | ||
<td>選択</td> | <td>選択</td> | ||
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<td>NULL</td> | <td>NULL</td> | ||
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<td>-o</td> | <td>-o</td> | ||
<td>選択</td> | <td>選択</td> | ||
| − | <td>出力ファイル</td> | + | <td>出力ファイル: [[ASCII]]</td> |
<td>stdout</td> | <td>stdout</td> | ||
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<tr> | <tr> | ||
<td>-truePitch</td> | <td>-truePitch</td> | ||
| − | <td> | + | <td>必須</td> |
<td>truePitch: [A]</td> | <td>truePitch: [A]</td> | ||
<td>770</td> | <td>770</td> | ||
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<tr> | <tr> | ||
<td>-rMax</td> | <td>-rMax</td> | ||
| − | <td> | + | <td>必須</td> |
<td>rMax: [A]</td> | <td>rMax: [A]</td> | ||
<td>50</td> | <td>50</td> | ||
| 行89: | 行89: | ||
<td> </td> | <td> </td> | ||
</tr> | </tr> | ||
| − | </table> | + | </table> |
===モードの詳細=== | ===モードの詳細=== | ||
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== 実行例 == | == 実行例 == | ||
| + | ===[[:Media:1ATOMFil.fft|入力ファイル]]の画像=== | ||
| + | <div>[[mrcFFTExpression]](m=1)にて表示</div> | ||
| + | <table> | ||
| + | <tr> | ||
| + | <td><p align="Center">[[画像:1ATOMFil-FFT.png]]<br> | ||
| + | 全体<br></p> | ||
| + | </td> | ||
| + | <td><p align="Center">[[画像:1ATOMFil-FFT1.png]]<br> | ||
| + | 中心付近<br></p> | ||
| + | </td> | ||
| + | <td><p align="left">サイズ<br> | ||
| + | モード<br> | ||
| + | Length<br> | ||
| + | 最小<br> | ||
| + | 最大<br> | ||
| + | 平均値<br> | ||
| + | 標準偏差<br> | ||
| + | 標準誤差<br></p> | ||
| + | </td> | ||
| + | <td><p align="left">( 512, 1146, 1)<br> | ||
| + | mrcComplexFloatFT <br> | ||
| + | ( 2.000, 2.000, 0.000)<br> | ||
| + | 4.08519e-10 (257, 572, 0)<br> | ||
| + | 0.109661 (0, 0, 0)<br> | ||
| + | 0.00909953<br> | ||
| + | 0.00776913<br> | ||
| + | 1.01425e-05<br></p> | ||
| + | </td> | ||
| + | </tr> | ||
| + | </table> | ||
| + | <br> | ||
| + | |||
| + | ===オプション必須項目のみの場合=== | ||
| + | ====t=-13, u=28, truePitch=364, rMax=50で実行==== | ||
| + | <pre> | ||
| + | LengthY 2292.000000 [A] = LengthY 1146 [Pixel] x PixelSize 2.000000 [A/Pixel] | ||
| + | Final CalculatedY 6.296703 | ||
| + | CalculatedY 6 | ||
| + | Error[Pixel] -54 | ||
| + | 36 50.000000 0.100000 0.500000 | ||
| + | 0 0 3 0 28 -28 | ||
| + | 1 6 2 -13 15 | ||
| + | 2 12 3 2 -26 30 | ||
| + | 3 18 2 -11 17 | ||
| + | 4 24 3 4 -24 32 | ||
| + | 5 30 2 -9 19 | ||
| + | 6 36 2 6 -22 | ||
| + | 7 42 2 -7 21 | ||
| + | 8 48 2 8 -20 | ||
| + | 9 54 3 -5 23 -33 | ||
| + | 10 60 2 10 -18 | ||
| + | 11 66 3 -3 25 -31 | ||
| + | 12 72 2 12 -16 | ||
| + | 13 78 3 -1 27 -29 | ||
| + | 14 84 2 14 -14 | ||
| + | 15 90 3 1 -27 29 | ||
| + | 16 96 2 -12 16 | ||
| + | 17 102 3 3 -25 31 | ||
| + | 18 108 2 -10 18 | ||
| + | 19 114 3 5 -23 33 | ||
| + | 20 120 2 -8 20 | ||
| + | 21 126 2 7 -21 | ||
| + | 22 132 2 -6 22 | ||
| + | 23 138 2 9 -19 | ||
| + | 24 144 3 -4 24 -32 | ||
| + | 25 150 2 11 -17 | ||
| + | 26 156 3 -2 26 -30 | ||
| + | 27 162 2 13 -15 | ||
| + | 28 168 3 0 28 -28 | ||
| + | 29 174 2 -13 15 | ||
| + | 30 180 3 2 -26 30 | ||
| + | 31 186 2 -11 17 | ||
| + | 32 192 3 4 -24 32 | ||
| + | 33 198 2 -9 19 | ||
| + | 34 204 2 6 -22 | ||
| + | 35 210 2 -7 21 | ||
| + | </pre> | ||
2014年8月25日 (月) 01:48時点における最新版
llExtractWithLayerSeparationCtrlFileCreateとはEosのコマンドである。
目次
オプション一覧
メインオプション
| オプション | 必須項目/選択項目 | 説明 | デフォルト |
|---|---|---|---|
| -i | 選択 | 入力ファイル: llData | NULL |
| -o | 選択 | 出力ファイル: ASCII | stdout |
| -t | 必須 | Turn | -13 |
| -u | 必須 | Unit | 28 |
| -N | 選択 | Helix | 1 |
| -dY | 選択 | Position of the 1st layer line: [ピクセル] | 3 |
| -truePitch | 必須 | truePitch: [A] | 770 |
| -rMax | 必須 | rMax: [A] | 50 |
| -RMax | 選択 | RMax: [A] | 0.1 |
| -RZMax | 選択 | RZMax: [A] | 0.1 |
| -c | 選択 | コンフィグファイル設定 | NULL |
| -m | 選択 | モードを設定 | 0 |
| -h | 選択 | ヘルプを表示 |
モードの詳細
| モード | 説明 |
|---|---|
| 0 |
実行例
入力ファイルの画像
mrcFFTExpression(m=1)にて表示
サイズ モード |
( 512, 1146, 1) mrcComplexFloatFT |
オプション必須項目のみの場合
t=-13, u=28, truePitch=364, rMax=50で実行
LengthY 2292.000000 [A] = LengthY 1146 [Pixel] x PixelSize 2.000000 [A/Pixel]
Final CalculatedY 6.296703
CalculatedY 6
Error[Pixel] -54
36 50.000000 0.100000 0.500000
0 0 3 0 28 -28
1 6 2 -13 15
2 12 3 2 -26 30
3 18 2 -11 17
4 24 3 4 -24 32
5 30 2 -9 19
6 36 2 6 -22
7 42 2 -7 21
8 48 2 8 -20
9 54 3 -5 23 -33
10 60 2 10 -18
11 66 3 -3 25 -31
12 72 2 12 -16
13 78 3 -1 27 -29
14 84 2 14 -14
15 90 3 1 -27 29
16 96 2 -12 16
17 102 3 3 -25 31
18 108 2 -10 18
19 114 3 5 -23 33
20 120 2 -8 20
21 126 2 7 -21
22 132 2 -6 22
23 138 2 9 -19
24 144 3 -4 24 -32
25 150 2 11 -17
26 156 3 -2 26 -30
27 162 2 13 -15
28 168 3 0 28 -28
29 174 2 -13 15
30 180 3 2 -26 30
31 186 2 -11 17
32 192 3 4 -24 32
33 198 2 -9 19
34 204 2 6 -22
35 210 2 -7 21

