「mrcImage1dShiftByCorrelation」の版間の差分

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(同じ利用者による、間の3版が非表示)
行14: 行14:
 
<td>-i</td>  
 
<td>-i</td>  
 
<td>必須</td>  
 
<td>必須</td>  
−
<td>入力ファイル</td>  
+
<td>入力ファイル: [[mrcImage]]</td>  
 
<td>NULL</td>  
 
<td>NULL</td>  
 
</tr>  
 
</tr>  
行20: 行20:
 
<td>-r</td>  
 
<td>-r</td>  
 
<td>必須</td>  
 
<td>必須</td>  
−
<td>参照ファイル</td>  
+
<td>参照ファイル: [[mrcImage]]</td>  
 
<td>NULL</td>  
 
<td>NULL</td>  
 
</tr>  
 
</tr>  
行26: 行26:
 
<td>-range</td>  
 
<td>-range</td>  
 
<td>選択</td>  
 
<td>選択</td>  
−
<td>Search range of shift.Default:Nx</td>  
+
<td>Search range of shift.</td>  
 
<td>0</td>  
 
<td>0</td>  
 
</tr>  
 
</tr>  
行32: 行32:
 
<td>-s</td>  
 
<td>-s</td>  
 
<td>必須</td>  
 
<td>必須</td>  
−
<td>File to define position of signal</td>  
+
<td>File to define position of signal: [[ASCII]]</td>  
 
<td>NULL</td>  
 
<td>NULL</td>  
 
</tr>  
 
</tr>  
行66: 行66:
 
</tr>  
 
</tr>  
 
</table>  
 
</table>  
 +
<br>
  
 
===モードの詳細===
 
===モードの詳細===
行82: 行83:
 
</tr>  
 
</tr>  
 
</table>  
 
</table>  
 +
<br>
  
 +
===-s のフォーマット===
 +
<pre>
 +
sigpos0  sigval0
 +
sigpos1  sigval1
 +
.
 +
.
 +
 +
</pre>
 +
<br>
  
 
== 実行例 ==
 
== 実行例 ==
 +
===[[:Media:Input-1VOM-N-1D.mrc|入力ファイル]]の画像===
 +
<table>
 +
<tr>
 +
<td>[[画像:Input-1VOM-N-1D.png]]</td>
 +
<td><p align="left">最小<br>
 +
最大<br>
 +
平均値<br>
 +
標準偏差<br>
 +
標準誤差<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="left">-24564.9 (1, 0, 0)<br>
 +
1.12206e+06 (40, 0, 0)<br>
 +
577190<br>
 +
290698<br>
 +
22981.7<br></p>
 +
</td>
 +
</tr>
 +
</table>
 +
<br>
 +
 +
===[[:Media:Input-1VOM-1D.mrc|参照ファイル]]の画像===
 +
<table>
 +
<tr>
 +
<td>[[画像:Input-1VOM-1D.png]]</td>
 +
<td><p align="left">最小<br>
 +
最大<br>
 +
平均値<br>
 +
標準偏差<br>
 +
標準誤差<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="left">9528.98 (1, 0, 0)<br>
 +
1.05166e+06 (41, 0, 0)<br>
 +
577032<br>
 +
281935<br>
 +
22288.9<br></p>
 +
</td>
 +
</tr>
 +
</table>
 +
<br>
 +
 +
===-s のデータ===
 +
<pre>
 +
0 1
 +
1 1
 +
 +
</pre>
 +
<br>
 +
 +
===オプション必須項目のみの場合===
 +
<div>出力結果</div>
 +
<pre>
 +
start1
 +
corstart
 +
0 -0.0184223
 +
1 -0.0573648
 +
2 -0.0963073
 +
3 -0.13525
 +
4 -0.174192
 +
 +
-中略-
 +
 +
35 -1.38141
 +
36 -1.42035
 +
37 -1.45929
 +
38 -1.49824
 +
39 -1.53718
 +
 +
-中略-
 +
 +
75 -0.17629
 +
76 -0.137348
 +
77 -0.0984052
 +
78 -0.0594627
 +
79 -0.0205202
 +
Input-1VOM-N-1D.mrc Input-1VOM-1D.mrc 0.000000 -0.0184223
 +
</pre>
 +
<br>
 +
 +
===オプション　-range===
 +
====range=40で実行====
 +
<div>出力結果</div>
 +
<pre>
 +
start1
 +
corstart
 +
0 -0.0184223
 +
1 -0.0573648
 +
2 -0.0963073
 +
3 -0.13525
 +
4 -0.174192 
 +
 +
-中略-
 +
 +
35 -1.38141
 +
36 -1.42035
 +
37 -1.45929
 +
38 -1.49824
 +
39 -1.53718
 +
Input-1VOM-N-1D.mrc Input-1VOM-1D.mrc 0.000000 -0.0184223
 +
</pre>
 +
<br>
 +
 +
===オプション　-d===
 +
====d=0.5で実行====
 +
<div>出力結果</div>
 +
<pre>
 +
start1
 +
corstart
 +
0 -0.0184223
 +
0.5 -0.0378935
 +
1 -0.0573648
 +
1.5 -0.076836
 +
2 -0.0963073
 +
2.5 -0.115779
 +
3 -0.13525
 +
3.5 -0.154721
 +
4 -0.174192
 +
 +
-中略-
 +
 +
35 -1.38141
 +
35.5 -1.40088
 +
36 -1.42035
 +
36.5 -1.43982
 +
37 -1.45929
 +
37.5 -1.47877
 +
38 -1.49824
 +
38.5 -1.51771
 +
39 -1.53718
 +
39.5 -1.55665
 +
Input-1VOM-N-1D.mrc Input-1VOM-1D.mrc 0.000000 -0.0184223
 +
</pre>
 +
<br>
 +
 +
===オプション　-norm===
 +
<div>出力結果</div>
 +
<pre>
 +
0 -0.0371553
 +
1 -0.115694
 +
2 -0.194234
 +
3 -0.272774
 +
4 -0.351314
 +
 +
-中略-
 +
 +
75 -0.355545
 +
76 -0.277005
 +
77 -0.198465
 +
78 -0.119926
 +
79 -0.0413864
 +
Input-1VOM-N-1D.mrc Input-1VOM-1D.mrc 0.000000 -0.0371553
 +
</pre>
 +
<br>
 +
 +
===オプション　-m===
 +
====m=1で実行====
 +
<div>出力結果</div>
 +
<pre>
 +
start1
 +
corstart
 +
0 0.999919
 +
1 0.999344
 +
2 0.998179
 +
3 0.996434
 +
4 0.994119
 +
 +
-中略-
 +
 +
75 0.993978
 +
76 0.996324
 +
77 0.9981
 +
78 0.999296
 +
79 0.999903
 +
Input-1VOM-N-1D.mrc Input-1VOM-1D.mrc 0.000000 0.999919
 +
</pre>
 +
<br>

2014年3月25日 (火) 06:40時点における最新版

mrcImage1dShiftByCorrelationとはEosのコマンドである。


オプション一覧

メインオプション

オプション 必須項目/選択項目 説明 デフォルト
-i 必須 入力ファイル: mrcImage NULL
-r 必須 参照ファイル: mrcImage NULL
-range 選択 Search range of shift. 0
-s 必須 File to define position of signal: ASCII NULL
-d 選択 Spacing of molecule(Pixel) 1.0
-norm 選択 Normalize before correlation
-c 選択 コンフィグファイル設定 NULL
-m 選択 モードを設定 0
-h 選択 ヘルプを表示 　


モードの詳細

モード 説明
0 Phase residual
1 Normal correlation


-s のフォーマット

sigpos0  sigval0
sigpos1  sigval1
.
.


実行例

入力ファイルの画像

Input-1VOM-N-1D.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

-24564.9 (1, 0, 0)

1.12206e+06 (40, 0, 0)
577190
290698

22981.7


参照ファイルの画像

Input-1VOM-1D.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

9528.98 (1, 0, 0)

1.05166e+06 (41, 0, 0)
577032
281935

22288.9


-s のデータ

0	1
1	1


オプション必須項目のみの場合

出力結果
start1 
corstart
0 -0.0184223 
1 -0.0573648 
2 -0.0963073 
3 -0.13525 
4 -0.174192 

-中略-

35 -1.38141 
36 -1.42035 
37 -1.45929 
38 -1.49824 
39 -1.53718 

-中略-

75 -0.17629 
76 -0.137348 
77 -0.0984052 
78 -0.0594627 
79 -0.0205202 
Input-1VOM-N-1D.mrc Input-1VOM-1D.mrc 0.000000 -0.0184223


オプション　-range

range=40で実行

出力結果
start1 
corstart
0 -0.0184223 
1 -0.0573648 
2 -0.0963073 
3 -0.13525 
4 -0.174192  

-中略-

35 -1.38141 
36 -1.42035 
37 -1.45929 
38 -1.49824 
39 -1.53718 
Input-1VOM-N-1D.mrc Input-1VOM-1D.mrc 0.000000 -0.0184223


オプション　-d

d=0.5で実行

出力結果
start1 
corstart
0 -0.0184223 
0.5 -0.0378935 
1 -0.0573648 
1.5 -0.076836 
2 -0.0963073 
2.5 -0.115779 
3 -0.13525 
3.5 -0.154721 
4 -0.174192 

-中略-

35 -1.38141 
35.5 -1.40088 
36 -1.42035 
36.5 -1.43982 
37 -1.45929 
37.5 -1.47877 
38 -1.49824 
38.5 -1.51771 
39 -1.53718 
39.5 -1.55665 
Input-1VOM-N-1D.mrc Input-1VOM-1D.mrc 0.000000 -0.0184223


オプション　-norm

出力結果
0 -0.0371553 
1 -0.115694 
2 -0.194234 
3 -0.272774 
4 -0.351314 

-中略-

75 -0.355545 
76 -0.277005 
77 -0.198465 
78 -0.119926 
79 -0.0413864 
Input-1VOM-N-1D.mrc Input-1VOM-1D.mrc 0.000000 -0.0371553


オプション　-m

m=1で実行

出力結果
start1 
corstart
0 0.999919 
1 0.999344 
2 0.998179 
3 0.996434 
4 0.994119 

-中略-

75 0.993978 
76 0.996324 
77 0.9981 
78 0.999296 
79 0.999903 
Input-1VOM-N-1D.mrc Input-1VOM-1D.mrc 0.000000 0.999919



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