「mrcRadon2Dto3D」の版間の差分

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(同じ利用者による、間の7版が非表示)
行14: 行14:
 
<td>-I</td>  
 
<td>-I</td>  
 
<td>必須</td>  
 
<td>必須</td>  
−
<td>入力ファイルリスト設定</td>  
+
<td>入力ファイルリスト設定: [[ASCII]]</td>  
 
<td>NULL</td>  
 
<td>NULL</td>  
 
</tr>  
 
</tr>  
行38: 行38:
 
<td>-o</td>  
 
<td>-o</td>  
 
<td>必須</td>  
 
<td>必須</td>  
−
<td>出力ファイル設定(radon3D)</td>  
+
<td>出力ファイル設定: [[mrcImage]](radon3D)</td>  
 
<td>NULL</td>  
 
<td>NULL</td>  
 
</tr>  
 
</tr>  
行44: 行44:
 
<td>-ow</td>  
 
<td>-ow</td>  
 
<td>必須</td>  
 
<td>必須</td>  
−
<td>出力ファイル設定(weight)</td>  
+
<td>出力ファイル設定: [[mrcImage]](weight)</td>  
 
<td>NULL</td>  
 
<td>NULL</td>  
 
</tr>  
 
</tr>  
行74: 行74:
 
<td>-InterpolationMode</td>  
 
<td>-InterpolationMode</td>  
 
<td>選択</td>  
 
<td>選択</td>  
−
<td>InterpolationMode</td>  
+
<td>[[補間]]のモード</td>  
 
<td>0</td>  
 
<td>0</td>  
 
</tr>  
 
</tr>  
行90: 行90:
 
</tr>  
 
</tr>  
 
</table>  
 
</table>  
 +
<br>
 +
 +
===-InterpolationMode の詳細===
 +
[[補間]]の仕方を指定する。
 +
<table border="1">
 +
<div align="left">
 +
<tr>
 +
<th>モード</th>
 +
<th>説明</th>
 +
</tr>
 +
<tr>
 +
<td>0</td>
 +
<td>最近傍法</td>
 +
</tr>
 +
<tr>
 +
<td>1</td>
 +
<td>線形補間法</td>
 +
</tr>
 +
<tr>
 +
<td>2</td>
 +
<td>３次補間法</td>
 +
</tr>
 +
<tr>
 +
<td>3</td>
 +
<td>２次曲面補間法</td>
 +
</tr>
 +
</div>
 +
</table>
 +
<br>
  
 
===-m の詳細===
 
===-m の詳細===
行109: 行138:
 
===-I のフォーマット===
 
===-I のフォーマット===
 
<pre>
 
<pre>
−
ファイル名 回転モード Rot1 Rot2 Rot3
+
2Dラドンファイル名 回転モード Rot1 Rot2 Rot3
−
      .                 .          .      .      .
+
              .                     .          .      .      .
−
      .                 .          .      .      .
+
              .                     .          .      .      .
−
      .                 .          .      .      .
+
              .                     .          .      .      .
  
 
</pre>
 
</pre>
−
 
  
 
== 実行例 ==
 
== 実行例 ==
−
===入力ファイルのデータ===
+
===[[Media:Input-2DRadonSet0.zip | 入力ファイル]]のデータ===
 
<pre>
 
<pre>
−
/Eos/2DRadonSet0/Set0.mrc XOYS 0 0 0
+
/Eos/2DRadonSet0/Set0.mrc ZOYS 0 0 0
−
/Eos/2DRadonSet0/Set4.mrc XOYS 1 0 0
+
/Eos/2DRadonSet0/Set1.mrc ZOYS 0 45 0
−
/Eos/2DRadonSet0/Set8.mrc XOYS 2 0 0
+
/Eos/2DRadonSet0/Set2.mrc ZOYS 0 90 0
−
/Eos/2DRadonSet0/Set12.mrc XOYS 3 0 0
+
−
/Eos/2DRadonSet0/Set16.mrc XOYS 4 0 0
+
  
 
-中略-
 
-中略-
  
−
/Eos/2DRadonSet0/Set340.mrc XOYS 85 0 0
+
/Eos/2DRadonSet0/Set8.mrc ZOYS 0 360 0
−
/Eos/2DRadonSet0/Set344.mrc XOYS 86 0 0
+
/Eos/2DRadonSet0/Set9.mrc ZOYS 45 0 0
−
/Eos/2DRadonSet0/Set348.mrc XOYS 87 0 0
+
/Eos/2DRadonSet0/Set10.mrc ZOYS 45 90 0
−
/Eos/2DRadonSet0/Set352.mrc XOYS 88 0 0
+
−
/Eos/2DRadonSet0/Set356.mrc XOYS 89 0 0
+
  
−
</pre>
+
-中略-
  
−
[[Media:Input-2DRadonSet0.zip | 入力ファイル]]
+
/Eos/2DRadonSet0/Set17.mrc ZOYS 45 360 0
 +
/Eos/2DRadonSet0/Set18.mrc ZOYS 90 0 0
 +
/Eos/2DRadonSet0/Set19.mrc ZOYS 90 90 0
 +
 
 +
-中略-
 +
 
 +
/Eos/2DRadonSet0/Set78.mrc ZOYS 360 270 0
 +
/Eos/2DRadonSet0/Set79.mrc ZOYS 360 315 0
 +
/Eos/2DRadonSet0/Set80.mrc ZOYS 360 360 0
 +
</pre>
  
  
 
===オプション必須項目のみの場合===
 
===オプション必須項目のみの場合===
−
====-o の画像====
+
====dp=2, dtheta=1, dphi=1で実行====
 +
<div>-o の画像</div>
 
<table>  
 
<table>  
 
<tr>  
 
<tr>  
行155: 行189:
 
標準誤差<br></p>  
 
標準誤差<br></p>  
 
</td>  
 
</td>  
−
<td><p align="left">0 (0, 0, 0)<br>  
+
<td><p align="left">-2.57165 (24, 86, 135)<br>  
−
3.46292e+07 (49, 89, 45)<br>  
+
2746.57 (15, 90, 6)<br>  
−
58859<br>  
+
82.8658<br>  
−
349587<br>  
+
360.577<br>  
−
137.331<br></p>  
+
0.283296<br></p>  
 
</td>  
 
</td>  
 
</tr>  
 
</tr>  
 
</table>  
 
</table>  
  
−
====-ow の画像====
+
<div>-ow の画像</div>
 
<table>  
 
<table>  
 
<tr>  
 
<tr>  
 
<td><p align="Center">[[画像:Outdata2-mrcRadon2Dto3D.png]]<br>
 
<td><p align="Center">[[画像:Outdata2-mrcRadon2Dto3D.png]]<br>
 +
yz平面<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="left">最小<br>
 +
最大<br>
 +
平均値<br>
 +
標準偏差<br>
 +
標準誤差<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="left">0 (0, 2, 1)<br>
 +
180 (0, 0, 90)<br>
 +
2.79444<br>
 +
16.1952<br>
 +
0.0127241<br></p>
 +
</td>
 +
</tr>
 +
</table>
 +
 +
====dp=4, dtheta=2, dphi=2で実行====
 +
<div>-o の画像</div>
 +
<table>
 +
<tr>
 +
<td><p align="Center">[[画像:Outdata3-mrcRadon2Dto3D.png]]<br>
 
xy平面<br></p>  
 
xy平面<br></p>  
 +
</td>
 +
<td><p align="Center">[[画像:Outdata4-mrcRadon2Dto3D.png]]<br>
 +
yz平面<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="left">最小<br>
 +
最大<br>
 +
平均値<br>
 +
標準偏差<br>
 +
標準誤差<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="left">-0.158943 (0, 66, 169)<br>
 +
2536.8 (5, 59, 0)<br>
 +
217.308<br>
 +
556.358<br>
 +
1.26184<br></p>
 +
</td>
 +
</tr>
 +
</table>
 +
 +
<div>-ow の画像</div>
 +
<table>
 +
<tr>
 +
<td><p align="Center">[[画像:Outdata5-mrcRadon2Dto3D.png]]<br>
 +
yz平面<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="left">最小<br>
 +
最大<br>
 +
平均値<br>
 +
標準偏差<br>
 +
標準誤差<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="left">0 (0, 2, 1)<br>
 +
1260 (11, 0, 0)<br>
 +
19.1204<br>
 +
66.4953<br>
 +
0.150814<br></p>
 +
</td>
 +
</tr>
 +
</table>
 +
 +
 +
===オプション　-m===
 +
====m=1, dp=2, dtheta=1, dphi=1で実行====
 +
=====その他のオプション設定なし=====
 +
<div>-oの画像</div>
 +
<table>
 +
<tr>
 +
<td><p align="Center">[[画像:Outdata-m-mrcRadon2Dto3D.png]]<br>
 +
xy平面<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="Center">[[画像:Outdata1-m-mrcRadon2Dto3D.png]]<br>
 +
yz平面<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="left">最小<br>
 +
最大<br>
 +
平均値<br>
 +
標準偏差<br>
 +
標準誤差<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="left">-2.57166 (24, 86, 136)<br>
 +
2746.57 (15, 91, 6)<br>
 +
172.326<br>
 +
504.539<br>
 +
0.396404<br></p>
 +
</td>
 +
</tr>
 +
</table>
 +
 +
<div>-ow の画像</div>
 +
<table>
 +
<tr>
 +
<td><p align="Center">[[画像:Outdata2-m-mrcRadon2Dto3D.png]]<br>
 +
yz平面<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="left">最小<br>
 +
最大<br>
 +
平均値<br>
 +
標準偏差<br>
 +
標準誤差<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="left">0 (0, 3, 1)<br>
 +
156 (0, 0, 0)<br>
 +
2.98641<br>
 +
10.0724<br>
 +
0.0079136<br></p>
 +
</td>
 +
</tr>
 +
</table>
 +
 +
=====T=0.3で実行=====
 +
<div>-oの画像</div>
 +
<table>
 +
<tr>
 +
<td><p align="Center">[[画像:Outdata-T-mrcRadon2Dto3D.png]]<br>
 +
xy平面<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="Center">[[画像:Outdata1-T-mrcRadon2Dto3D.png]]<br>
 +
yz平面<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="left">最小<br>
 +
最大<br>
 +
平均値<br>
 +
標準偏差<br>
 +
標準誤差<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="left">-2.57165 (24, 86, 135)<br>
 +
2746.57 (15, 91, 6)<br>
 +
68.1399<br>
 +
327.812<br>
 +
0.257553<br></p>
 +
</td>
 +
</tr>
 +
</table>
 +
 +
<div>-ow の画像</div>
 +
<table>
 +
<tr>
 +
<td><p align="Center">[[画像:Outdata2-T-mrcRadon2Dto3D.png]]<br>
 +
yz平面<br></p>
 
</td>  
 
</td>  
 
<td><p align="left">最小<br>  
 
<td><p align="left">最小<br>  
行176: 行351:
 
標準誤差<br></p>  
 
標準誤差<br></p>  
 
</td>  
 
</td>  
−
<td><p align="left">0 (1, 0, 0)<br>  
+
<td><p align="left">0 (0, 90, 0)<br>  
−
90 (0, 0, 0)<br>  
+
156 (0, 0, 0)<br>  
−
0.20221<br>  
+
1.5178<br>  
−
0.814809<br>  
+
9.05289<br>  
−
0.000320087<br></p>  
+
0.00711262<br></p>  
 
</td>  
 
</td>  
 
</tr>  
 
</tr>  
 
</table>
 
</table>

2014年8月6日 (水) 00:19時点における最新版

mrcRadon2Dto3Dとは２次元ラドン空間の画像セットから３次元ラドン空間の画像を求めるEosのコマンドである。


オプション一覧

メインオプション

オプション 必須項目/選択項目 説明 デフォルト
-I 必須 入力ファイルリスト設定: ASCII NULL
-Ib 選択 InputDataFileListBefore NULL
-ib 選択 InputDataFileBeforeData: mrcImageRadon3D NULL
-iwb 選択 InputWeightDataFileBeforeData: mrcImageRadon3D NULL
-o 必須 出力ファイル設定: mrcImage(radon3D) NULL
-ow 必須 出力ファイル設定: mrcImage(weight) NULL
-dp 必須 Input: deltaP 2.0
-dtheta 必須 Input: deltaTheta 1
-dphi 必須 Input: deltaPhi 1
-T 選択 Threshold 1.0
-InterpolationMode 選択 補間のモード 0
-m 選択 Radon2Dto3D Intepolation Mode 0
-h 選択 ヘルプを表示 　


-InterpolationMode の詳細

補間の仕方を指定する。

モード 説明
0 最近傍法
1 線形補間法
2 ３次補間法
3 ２次曲面補間法


-m の詳細

モード 説明
0 NearestNeighbor
1 HigherOrder (-T)

-I のフォーマット

2Dラドンファイル名 回転モード Rot1 Rot2 Rot3
               .                      .           .       .       .
               .                      .           .       .       .
               .                      .           .       .       .

実行例

入力ファイルのデータ

/Eos/2DRadonSet0/Set0.mrc ZOYS 0 0 0
/Eos/2DRadonSet0/Set1.mrc ZOYS 0 45 0
/Eos/2DRadonSet0/Set2.mrc ZOYS 0 90 0

-中略-

/Eos/2DRadonSet0/Set8.mrc ZOYS 0 360 0
/Eos/2DRadonSet0/Set9.mrc ZOYS 45 0 0
/Eos/2DRadonSet0/Set10.mrc ZOYS 45 90 0

-中略-

/Eos/2DRadonSet0/Set17.mrc ZOYS 45 360 0
/Eos/2DRadonSet0/Set18.mrc ZOYS 90 0 0
/Eos/2DRadonSet0/Set19.mrc ZOYS 90 90 0

-中略-

/Eos/2DRadonSet0/Set78.mrc ZOYS 360 270 0
/Eos/2DRadonSet0/Set79.mrc ZOYS 360 315 0
/Eos/2DRadonSet0/Set80.mrc ZOYS 360 360 0


オプション必須項目のみの場合

dp=2, dtheta=1, dphi=1で実行

-o の画像

Outdata-mrcRadon2Dto3D.png
xy平面

Outdata1-mrcRadon2Dto3D.png
yz平面

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

-2.57165 (24, 86, 135)

2746.57 (15, 90, 6)
82.8658
360.577

0.283296
-ow の画像

Outdata2-mrcRadon2Dto3D.png
yz平面

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

0 (0, 2, 1)

180 (0, 0, 90)
2.79444
16.1952

0.0127241

dp=4, dtheta=2, dphi=2で実行

-o の画像

Outdata3-mrcRadon2Dto3D.png
xy平面

Outdata4-mrcRadon2Dto3D.png
yz平面

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

-0.158943 (0, 66, 169)

2536.8 (5, 59, 0)
217.308
556.358

1.26184
-ow の画像

Outdata5-mrcRadon2Dto3D.png
yz平面

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

0 (0, 2, 1)

1260 (11, 0, 0)
19.1204
66.4953

0.150814


オプション　-m

m=1, dp=2, dtheta=1, dphi=1で実行

その他のオプション設定なし
-oの画像

Outdata-m-mrcRadon2Dto3D.png
xy平面

Outdata1-m-mrcRadon2Dto3D.png
yz平面

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

-2.57166 (24, 86, 136)

2746.57 (15, 91, 6)
172.326
504.539

0.396404
-ow の画像

Outdata2-m-mrcRadon2Dto3D.png
yz平面

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

0 (0, 3, 1)

156 (0, 0, 0)
2.98641
10.0724

0.0079136
T=0.3で実行
-oの画像

Outdata-T-mrcRadon2Dto3D.png
xy平面

Outdata1-T-mrcRadon2Dto3D.png
yz平面

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

-2.57165 (24, 86, 135)

2746.57 (15, 91, 6)
68.1399
327.812

0.257553
-ow の画像

Outdata2-T-mrcRadon2Dto3D.png
yz平面

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

0 (0, 90, 0)

156 (0, 0, 0)
1.5178
9.05289

0.00711262

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