「mrcImageAutoFilamentExtractResultAnalysis」の版間の差分
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<td>-i</td> | <td>-i</td> | ||
<td>必須</td> | <td>必須</td> | ||
| − | <td>入力ファイル</td> | + | <td>入力ファイル: [[mrcImage]]</td> |
<td>NULL</td> | <td>NULL</td> | ||
</tr> | </tr> | ||
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<td>-o</td> | <td>-o</td> | ||
<td>選択</td> | <td>選択</td> | ||
| − | <td>出力ファイル</td> | + | <td>出力ファイル: [[mrcImage]]</td> |
<td>NULL</td> | <td>NULL</td> | ||
</tr> | </tr> | ||
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</tr> | </tr> | ||
</table> | </table> | ||
| + | <div>-i, -o のファイル名は合わせて半角100文字程度まで入力可能</div> | ||
| + | <div>-deltadY は未実装</div> | ||
| + | <br> | ||
===モードの詳細=== | ===モードの詳細=== | ||
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</tr> | </tr> | ||
</table> | </table> | ||
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== 実行例 == | == 実行例 == | ||
| + | ===[[Media:Input-AutoFilament.mrc | 入力ファイル]]の画像=== | ||
| + | <table> | ||
| + | <tr> | ||
| + | <td>[[画像:Input-AutoFilament.png]]</td> | ||
| + | <td><p align="left">最小<br> | ||
| + | 最大<br> | ||
| + | 平均値<br> | ||
| + | 標準偏差<br> | ||
| + | 標準誤差<br></p> | ||
| + | </td> | ||
| + | <td><p align="left">0 (65, 0, 0)<br> | ||
| + | 10.8167 (60, 12, 0)<br> | ||
| + | 0.752281<br> | ||
| + | 1.80953<br> | ||
| + | 0.0207349<br></p> | ||
| + | </td> | ||
| + | </tr> | ||
| + | </table> | ||
| + | <br> | ||
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| + | ===オプション -y=== | ||
| + | <div>-y はデフォルトが0であるので、設定する必要がある。</div> | ||
| + | |||
| + | ====y=30で実行==== | ||
| + | <table> | ||
| + | <tr> | ||
| + | <td><p align="left">最小<br> | ||
| + | 最大<br> | ||
| + | 平均値<br> | ||
| + | 標準偏差<br> | ||
| + | 標準誤差<br></p> | ||
| + | </td> | ||
| + | <td><p align="left">0 (0, 0, 0)<br> | ||
| + | 0 (0, 0, 0)<br> | ||
| + | 0<br> | ||
| + | 0<br> | ||
| + | 0<br></p> | ||
| + | </td> | ||
| + | </tr> | ||
| + | </table> | ||
| + | <br> | ||
| + | |||
| + | <div>以降はy=30で実行</div> | ||
| + | ===オプション -truePitch=== | ||
| + | ====truePitch=250で実行==== | ||
| + | <table> | ||
| + | <tr> | ||
| + | <td>[[画像:Outdata-truePitch-mrcImageAutoFilamentExtractResultAnalysis.png]]</td> | ||
| + | <td><p align="left">最小<br> | ||
| + | 最大<br> | ||
| + | 平均値<br> | ||
| + | 標準偏差<br> | ||
| + | 標準誤差<br></p> | ||
| + | </td> | ||
| + | <td><p align="left">-2.19053 (114, 47, 0)<br> | ||
| + | 10.5375 (52, 43, 0)<br> | ||
| + | 0.600831<br> | ||
| + | 1.53525<br> | ||
| + | 0.0200725<br></p> | ||
| + | </td> | ||
| + | </tr> | ||
| + | </table> | ||
| + | <br> | ||
| + | |||
| + | ===オプション -PixelSize=== | ||
| + | ====PixelSize=10で実行==== | ||
| + | <table> | ||
| + | <tr> | ||
| + | <td>[[画像:Outdata-mrcImageAutoFilamentExtractResultAnalysis.png]]</td> | ||
| + | <td><p align="left">最小<br> | ||
| + | 最大<br> | ||
| + | 平均値<br> | ||
| + | 標準偏差<br> | ||
| + | 標準誤差<br></p> | ||
| + | </td> | ||
| + | <td><p align="left">-1.92139 (25, 13, 0)<br> | ||
| + | 10.8001 (99, 37, 0)<br> | ||
| + | 0.601505<br> | ||
| + | 1.53942<br> | ||
| + | 0.0233594<br></p> | ||
| + | </td> | ||
| + | </tr> | ||
| + | </table> | ||
| + | <br> | ||
| + | |||
| + | ===オプション -Mag=== | ||
| + | ====Mag=0.4で実行==== | ||
| + | <table> | ||
| + | <tr> | ||
| + | <td>[[画像:Outdata-Mag-mrcImageAutoFilamentExtractResultAnalysis.png]]</td> | ||
| + | <td><p align="left">最小<br> | ||
| + | 最大<br> | ||
| + | 平均値<br> | ||
| + | 標準偏差<br> | ||
| + | 標準誤差<br></p> | ||
| + | </td> | ||
| + | <td><p align="left">-2.30451 (198, 81, 0)<br> | ||
| + | 11.0425 (198, 75, 0)<br> | ||
| + | 0.601022<br> | ||
| + | 1.53561<br> | ||
| + | 0.0116508<br></p> | ||
| + | </td> | ||
| + | </tr> | ||
| + | </table> | ||
| + | <br> | ||
2014年2月24日 (月) 01:17時点における最新版
mrcImageAutoFilamentExtractResultAnalysisとはEosのコマンドである。
目次
オプション一覧
メインオプション
| オプション | 必須項目/選択項目 | 説明 | デフォルト |
|---|---|---|---|
| -i | 必須 | 入力ファイル: mrcImage | NULL |
| -o | 選択 | 出力ファイル: mrcImage | NULL |
| -truePitch | 選択 | True Pitch | 430 |
| -PixelSize | 選択 | Pixel Size [A] | 5 |
| -deltadY | 選択 | A range of deltadY to determine dY. | 0.5 |
| -y | 選択 | y [pixel] for final extraction | 0 |
| -Mag | 選択 | magnification ratio | 1.1 |
| -c | 選択 | コンフィグファイル設定 | NULL |
| -m | 選択 | モードを設定 | 0 |
| -h | 選択 | ヘルプを表示 |
-i, -o のファイル名は合わせて半角100文字程度まで入力可能
-deltadY は未実装
モードの詳細
| モード | 説明 |
|---|---|
| 0 |
実行例
入力ファイルの画像
 |
最小 最大 |
0 (65, 0, 0) 10.8167 (60, 12, 0) |
オプション -y
-y はデフォルトが0であるので、設定する必要がある。
y=30で実行
最小 最大 |
0 (0, 0, 0) 0 (0, 0, 0) |
以降はy=30で実行
オプション -truePitch
truePitch=250で実行
 |
最小 最大 |
-2.19053 (114, 47, 0) 10.5375 (52, 43, 0) |
オプション -PixelSize
PixelSize=10で実行
 |
最小 最大 |
-1.92139 (25, 13, 0) 10.8001 (99, 37, 0) |
オプション -Mag
Mag=0.4で実行
 |
最小 最大 |
-2.30451 (198, 81, 0) 11.0425 (198, 75, 0) |
