「pdbFileMerge」の版間の差分
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| − | '''pdbFileMerge''' | + | '''pdbFileMerge'''とは2つの[[PDB]]ファイルを1つの[[PDB]]ファイルにマージする[[Eos]]の[[コマンド]]である。 |
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<td>-i1</td> | <td>-i1</td> | ||
<td>必須</td> | <td>必須</td> | ||
| − | <td>入力ファイル1</td> | + | <td>入力ファイル1: [[PDB]]</td> |
<td>NULL</td> | <td>NULL</td> | ||
</tr> | </tr> | ||
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<td>-i2</td> | <td>-i2</td> | ||
<td>必須</td> | <td>必須</td> | ||
| − | <td>入力ファイル2</td> | + | <td>入力ファイル2: [[PDB]]</td> |
<td>NULL</td> | <td>NULL</td> | ||
</tr> | </tr> | ||
| 行26: | 行26: | ||
<td>-o</td> | <td>-o</td> | ||
<td>必須</td> | <td>必須</td> | ||
| − | <td>出力ファイル</td> | + | <td>出力ファイル: [[PDB]]</td> |
<td>NULL</td> | <td>NULL</td> | ||
</tr> | </tr> | ||
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== 実行例 == | == 実行例 == | ||
| − | === | + | ===[[:Media:Input-121P-T2.pdb.zip|入力ファイル1]]の画像=== |
<table> | <table> | ||
<tr> | <tr> | ||
| − | <td>[[画像:Input-121P- | + | <td>[[画像:Input-121P-PDB2.png]]</td> |
<td><p align="left">重心<br> | <td><p align="left">重心<br> | ||
最大半径<br> | 最大半径<br> | ||
| 行79: | 行79: | ||
<td><p align="left">6.053012e+00 2.519590e+01 1.189075e+01<br> | <td><p align="left">6.053012e+00 2.519590e+01 1.189075e+01<br> | ||
3.286664e+01 <br> | 3.286664e+01 <br> | ||
| − | 24.77 23.85 28.04<br></p> | + | 24.77 23.85 28.04 <br></p> |
</td> | </td> | ||
</tr> | </tr> | ||
| 行85: | 行85: | ||
<br> | <br> | ||
| − | === | + | ===[[:Media:Input-121P-T3.pdb.zip|入力ファイル2]]の画像=== |
<table> | <table> | ||
<tr> | <tr> | ||
| − | <td>[[画像:Input- | + | <td>[[画像:Input-121P-T3.png]]</td> |
<td><p align="left">重心<br> | <td><p align="left">重心<br> | ||
最大半径<br> | 最大半径<br> | ||
最大半径(座標)<br> </p> | 最大半径(座標)<br> </p> | ||
</td> | </td> | ||
| − | <td><p align="left"> | + | <td><p align="left">5.097651e-01 1.932045e+01 1.188975e+01<br> |
| − | + | 3.286711e+01 <br> | |
| − | + | 23.93 24.14 28.04<br> </p> | |
</td> | </td> | ||
</tr> | </tr> | ||
| 行109: | 行109: | ||
最大半径(座標)<br> </p> | 最大半径(座標)<br> </p> | ||
</td> | </td> | ||
| − | <td><p align="left"> | + | <td><p align="left">3.281389e+00 2.225817e+01 -4.999687e-04<br> |
| − | + | 3.798185e+01<br> | |
| − | 27. | + | 27.38 27.08 34.08<br></p> |
</td> | </td> | ||
</table> | </table> | ||
<br> | <br> | ||
2014年1月28日 (火) 00:57時点における最新版
pdbFileMergeとは2つのPDBファイルを1つのPDBファイルにマージするEosのコマンドである。
オプション一覧
メインオプション
| オプション | 必須項目/選択項目 | 説明 | デフォルト |
|---|---|---|---|
| -i1 | 必須 | 入力ファイル1: PDB | NULL |
| -i2 | 必須 | 入力ファイル2: PDB | NULL |
| -o | 必須 | 出力ファイル: PDB | NULL |
| -startC | 選択 | start chain ID | A |
| -c | 選択 | コンフィグファイル設定 | NULL |
| -m | 選択 | モードを設定 | 0 |
| -h | 選択 | ヘルプを表示 |
モードの詳細
| モード | 説明 |
|---|---|
| 0 |
実行例
入力ファイル1の画像
 |
重心 最大半径 |
6.053012e+00 2.519590e+01 1.189075e+01 3.286664e+01 |
入力ファイル2の画像
 |
重心 最大半径 |
5.097651e-01 1.932045e+01 1.188975e+01 3.286711e+01 |
オプション必須項目のみの場合
 |
重心 最大半径 |
3.281389e+00 2.225817e+01 -4.999687e-04 3.798185e+01 |
