「mrcImagePrint」の版間の差分

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行86: 行86:
 
<td>-C</td>  
 
<td>-C</td>  
 
<td>選択</td>  
 
<td>選択</td>  
−
<td>ContourLevel</td>  
+
<td>コンターレベル</td>  
 
<td>1.0</td>  
 
<td>1.0</td>  
 
</tr>  
 
</tr>  
行92: 行92:
 
<td>-I</td>  
 
<td>-I</td>  
 
<td>選択</td>  
 
<td>選択</td>  
−
<td>Black is High Density</td>  
+
<td>反転</td>  
 
<td></td>  
 
<td></td>  
 
</tr>  
 
</tr>  
行122: 行122:
 
<td>-Y</td>  
 
<td>-Y</td>  
 
<td>選択</td>  
 
<td>選択</td>  
−
<td>Y-axis expanding</td>  
+
<td>y軸の拡大率</td>  
 
<td>1</td>  
 
<td>1</td>  
 
</tr>  
 
</tr>  
行194: 行194:
 
<td>-ReverseOrder</td>  
 
<td>-ReverseOrder</td>  
 
<td>選択</td>  
 
<td>選択</td>  
−
<td>Reverse Print Order</td>  
+
<td>ページを逆順にする</td>  
 
<td></td>  
 
<td></td>  
 
</tr>  
 
</tr>  
行324: 行324:
 
<tr>  
 
<tr>  
 
<th>39/69ページ</th>  
 
<th>39/69ページ</th>  
 +
</tr>
 +
<tr>
 +
<th>[[画像:Outdata2-mrcImagePrint.png]]</th>
 +
</tr>
 +
<tr>
 +
<th>サムネイル</th>
 
</tr>  
 
</tr>  
 
</table>  
 
</table>  
行426: 行432:
 
</table>
 
</table>
  
−
===オプション　-===
+
===オプション　-Y===
−
====, S=2で実行====  
+
====Y=2で実行====  
 
<table>  
 
<table>  
 
<tr>  
 
<tr>  
−
<th>[[画像:Outdata--mrcImagePrint.png]]</th>  
+
<th>[[画像:Outdata-Y-mrcImagePrint.png]]</th>  
 
</tr>  
 
</tr>  
 
<tr>  
 
<tr>  
 
<th>39/69ページ</th>  
 
<th>39/69ページ</th>  
 +
</tr>
 +
</table>
 +
 +
===オプション　-ReverseOrder===
 +
====ReverseOrder, S=2で実行====
 +
<table>
 +
<tr>
 +
<th>[[画像:Outdata-ReverseOrder-mrcImagePrint.png]]</th>
 +
</tr>
 +
<tr>
 +
<th>31/69ページ</th>
 +
</tr>
 +
</table>
 +
 +
===オプション　-untwist===
 +
====untwist=0.1, S=2で実行====
 +
<table>
 +
<tr>
 +
<th>[[画像:Outdata-untwist-mrcImagePrint.png]]</th>
 +
</tr>
 +
<tr>
 +
<th>39/69ページ</th>
 +
</tr>
 +
<tr>
 +
<th>[[画像:Outdata2-untwist-mrcImagePrint.png]]</th>
 +
</tr>
 +
<tr>
 +
<th>サムネイル</th>
 
</tr>  
 
</tr>  
 
</table>
 
</table>

2013年11月27日 (水) 04:15時点における版

mrcImagePrintとはEosのコマンドである。


オプション一覧

メインオプション

オプション 必須項目/選択項目 説明 デフォルト
-i 必須 入力ファイル: mrcImage NULL
-o 選択 出力ファイル: psファイル stdout
-H 選択 High Threshold 0.0
-L 選択 Low Threshold 1.0
-Section 選択 [z|x|y]Section z
-x 選択 x section:(xMin, xMax) (0, 0)
-y 選択 y section:(yMin, yMax) (0, 0)
-z 選択 z section:(zMin, zMax) (0, 0)
-S 選択 Scale(Centre is Bottom Left): -S 1 := 1 mm/pixel 1.0
-AS 選択 Scale(Centre is Bottom Left): -AS 1 := 1 mm/A (Real) or 1 mm/A-1 (Fourier Space) 1.0
-E 選択 Enlargement(image center is center) 1.0
-center 選択 Center of a printed image(in case of FT or N.x/2.0 in case of Image):(cx, cy) (0.0, 0.0)
-C 選択 コンターレベル 1.0
-I 選択 反転
-A 選択 HighThres=Mean-SD, LowThres=Mean+SD
-AC 選択 Auto Contour(thresHigh <-> mean) 10
-PC 選択 Peak Contour(thresHigh <-> (mean+thresHigh)/2 10
-AC2 選択 Auto Contour2(thresHigh <-> thresLow) 10
-Y 選択 y軸の拡大率 1
-RGB 選択 Contour Color Mode: RGB:(Red, Green, Blue) (0, 0, 0)
-RGBGradient 選択 Contour Color GradientMode: RGB:(RedFirst, GreenFirst, BlueFirst, RedLast, GreenLast, BlueLast) (0, 0, 0, 0, 0, 0)
-HSB 選択 Contour Color Mode: HSB:(Hue, Saturation, Brightness) (0, 0, 0)
-HSBGradient 選択 Contour Color GradientMode: HSB:(HueFirst, SaturationFirst, BrightnessFirst, HueLast, SaturationLast, BrightnessLast) (0, 0, 0, 0, 0, 0)
-LineColourRGB 選択 Contour Color Mode: RGB:(LineRed, LineGreen, LineBlue) (0, 0, 0)
-LineColourRGBGradient 選択 Contour Color GradientMode: RGB:(LineRedFirst, LineGreenFirst, LineBlueFirst, LineRedLast, LineGreenLast, LineBlueLast) (0, 0, 0, 0, 0, 0)
-LineColourHSB 選択 Contour Color Mode: HSB:(LineHue, LineSaturation, LineBrightness) (0, 0, 0)
-LineColourHSBGradient 選択 Contour Color GradientMode: HSB:(LineHueFirst, LineSaturationFirst, LineBrightnessFirst, LineHueLast, LineSaturationLast, LineBrightnessLast) (0, 0, 0, 0, 0, 0)
-LineChange 選択 Contour Color Change 0.1
-LineWidthStart 選択 Contour Line Width Start 0.1
-LineWidthStep 選択 Contour Line Width Step 0.05
-ReverseOrder 選択 ページを逆順にする
-Untwist 選択 Untwist Angle [degree/A], example: (-13,28) = 0.4709576 0.0
-UpsideDown 選択 Upside Down
-Centre 選択 Image Centre is at the centre of paper.
-CircleRadius 選択 Radius of circles in the case of imageCircles 0.5
-c 選択 コンフィグファイル設定 NULL
-m 選択 モードを設定 49
-h 選択 ヘルプを表示 　 
				-C  option is stronger than -AC and -PC
				-PC option is stronger than -AC
					-AC: (i+1)*(max-maen)  /(AC+1) + mean 
					-PC: (i  )*(max+mean)/2)/AC     + (max+mean)/2
				-AS option is stronger than -S option
				The default value of -AS option is ignored.
				The default value of -S option is used.
				Both options are applied to y-axis.

モードの詳細

モード 説明
1 ImageDensity
2 Contour(DiffrentLineWidth)
4 Contour(SameLineWidth)
8 BlackCircles
16 Scale
32 Centre Mark
16777216 Amplitude by AsciiFile
33554432 Log of Amplitude by AsciiFile
67108864 Phase by AsciiFile


実行例

入力ファイルの画像

Input-mrcImagePrint.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

0 (0, 0, 0)

5 (34, 41, 36)
0.00471829
0.0933498

0.000162869

オプション必須項目のみの場合

Outdata-mrcImagePrint.png
39/69ページ
Outdata2-mrcImagePrint.png
サムネイル

オプション　-S

S=2で実行

Outdata-S-mrcImagePrint.png
39/69ページ

オプション　-H

H=1, S=2で実行

Outdata-H-mrcImagePrint.png
39/69ページ

オプション　-L

L=1.5, S=2で実行

Outdata-L-mrcImagePrint.png
39/69ページ

オプション　-Section

Section=x, S=2で実行

Outdata-Section-mrcImagePrint.png
39/69ページ

オプション　-x, -y, -z

x=(10, 50), y=(0, 40), z=(30, 50), S=2で実行

Outdata-xyz-mrcImagePrint.png
11/21ページ

オプション　-AS

AS=1で実行

Outdata-AS-mrcImagePrint.png
39/69ページ

オプション　-center

center=(30, 30), S=2で実行

Outdata-center-mrcImagePrint.png
39/69ページ

オプション　-I

I, S=2で実行

Outdata-I-mrcImagePrint.png
39/69ページ

オプション　-A

A, S=2で実行

Outdata-A-mrcImagePrint.png
39/69ページ

オプション　-Y

Y=2で実行

Outdata-Y-mrcImagePrint.png
39/69ページ

オプション　-ReverseOrder

ReverseOrder, S=2で実行

Outdata-ReverseOrder-mrcImagePrint.png
31/69ページ

オプション　-untwist

untwist=0.1, S=2で実行

Outdata-untwist-mrcImagePrint.png
39/69ページ
Outdata2-untwist-mrcImagePrint.png
サムネイル

オプション　-

, S=2で実行

ファイル:Outdata--mrcImagePrint.png
39/69ページ

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