「mrcImageInfo」の版間の差分
提供: Eospedia
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<td>選択</td> | <td>選択</td> | ||
<td>このオプションが設定された場合には、画像の一般的な統計情報が出力される</td> | <td>このオプションが設定された場合には、画像の一般的な統計情報が出力される</td> | ||
| − | </tr> </div> | + | <td></td> |
| + | </tr> | ||
| + | <tr> | ||
| + | <td>-X</td> | ||
| + | <td>選択</td> | ||
| + | <td>X Section at y=X(value)</td> | ||
| + | <td>0.0</td> | ||
| + | </tr> | ||
| + | <tr> | ||
| + | <td>-Y</td> | ||
| + | <td>選択</td> | ||
| + | <td>Y Section at y=Y(value)</td> | ||
| + | <td>0.0</td> | ||
| + | </tr> | ||
| + | <tr> | ||
| + | <td>-x</td> | ||
| + | <td>選択</td> | ||
| + | <td>x Projection[OutPut ASCII FILE]</td> | ||
| + | <td></td> | ||
| + | </tr> | ||
| + | <tr> | ||
| + | <td>-y</td> | ||
| + | <td>選択</td> | ||
| + | <td>y Projection[OutPut ASCII FILE]</td> | ||
| + | <td></td> | ||
| + | </tr> | ||
| + | <tr> | ||
| + | <td>-H</td> | ||
| + | <td>選択</td> | ||
| + | <td>Histgram: Class Number: Normalize</td> | ||
| + | <td>256</td> | ||
| + | </tr> | ||
| + | <tr> | ||
| + | <td>-H2</td> | ||
| + | <td>選択</td> | ||
| + | <td>Histgram2: Class Width: Integer: Normalize</td> | ||
| + | <td>1</td> | ||
| + | </tr> | ||
| + | <tr> | ||
| + | <td>-H3</td> | ||
| + | <td>選択</td> | ||
| + | <td>Histgram: Class Number: Count</td> | ||
| + | <td>256</td> | ||
| + | </tr> | ||
| + | <tr> | ||
| + | <td>-H4</td> | ||
| + | <td>選択</td> | ||
| + | <td>Histgram2: Class Width: Integer: Count</td> | ||
| + | <td>1</td> | ||
| + | </tr> | ||
| + | <tr> | ||
| + | <td>-H5</td> | ||
| + | <td>選択</td> | ||
| + | <td>Histgram5: Class Number: Count</td> | ||
| + | <td>1</td> | ||
| + | </tr> | ||
| + | <tr> | ||
| + | <td>-H6</td> | ||
| + | <td>選択</td> | ||
| + | <td>Histgram6: Class Width: Integer: Count</td> | ||
| + | <td>1</td> | ||
| + | </tr> | ||
| + | <tr> | ||
| + | <td>-Low</td> | ||
| + | <td>選択</td> | ||
| + | <td>Low : thres</td> | ||
| + | <td>1</td> | ||
| + | </tr> | ||
| + | <tr> | ||
| + | <td>-High</td> | ||
| + | <td>選択</td> | ||
| + | <td>High: thres</td> | ||
| + | <td>1</td> | ||
| + | </tr> | ||
| + | <tr> | ||
| + | <td>-rmax</td> | ||
| + | <td>選択</td> | ||
| + | <td>rmax [A]</td> | ||
| + | <td>250</td> | ||
| + | </tr> | ||
| + | <tr> | ||
| + | <td>-c</td> | ||
| + | <td>選択</td> | ||
| + | <td></td> | ||
| + | <td>NULL</td> | ||
| + | </tr> | ||
| + | <tr> | ||
| + | <td>-m</td> | ||
| + | <td>選択</td> | ||
| + | <td></td> | ||
| + | <td>0</td> | ||
| + | </tr> | ||
| + | <tr> | ||
| + | <td>-h</td> | ||
| + | <td>選択</td> | ||
| + | <td></td> | ||
| + | <td></td> | ||
| + | </tr> | ||
| + | </div> | ||
</table> | </table> | ||
| 行38: | 行136: | ||
</tr> | </tr> | ||
<tr> | <tr> | ||
| − | <th> | + | <th>0</th> |
| − | <th> | + | <th>mean of all density</th> |
| + | </tr> | ||
| + | <tr> | ||
| + | <th>1</th> | ||
| + | <th>mean of sphere surface density at rmax</th> | ||
| + | </tr> | ||
| + | <tr> | ||
| + | <th>2</th> | ||
| + | <th>mean of cylinder surface density at rmax</th> | ||
| + | </tr> | ||
| + | <tr> | ||
| + | <th>3</th> | ||
| + | <th>mean of edge pixels</th> | ||
| + | </tr> | ||
| + | <tr> | ||
| + | <th>4</th> | ||
| + | <th>mean of Centre</th> | ||
| + | </tr> | ||
| + | <tr> | ||
| + | <th>5</th> | ||
| + | <th>mean of Sparse</th> | ||
| + | </tr> | ||
| + | <tr> | ||
| + | <th>6</th> | ||
| + | <th>mean of 2DEdge</th> | ||
| + | </tr> | ||
| + | <tr> | ||
| + | <th>7</th> | ||
| + | <th>RMS of all pixels</th> | ||
</tr> | </tr> | ||
| − | |||
</div> | </div> | ||
</table> | </table> | ||
2013年10月23日 (水) 07:06時点における版
mrcImageInfoとはmrcファイルの画像の情報を表示するためのEosのコマンドである。
オプション一覧
メインオプション
| オプション | 必須項目/選択項目 | 説明 | デフォルト |
|---|---|---|---|
| -i | 必須 | 入力ファイル設定 | NULL |
| -o | 選択 | 出力ファイル設定 | stdout(設定しなければ標準出力) |
| -I[nfo] | 選択 | このオプションが設定された場合には、画像の一般的な統計情報が出力される | |
| -X | 選択 | X Section at y=X(value) | 0.0 |
| -Y | 選択 | Y Section at y=Y(value) | 0.0 |
| -x | 選択 | x Projection[OutPut ASCII FILE] | |
| -y | 選択 | y Projection[OutPut ASCII FILE] | |
| -H | 選択 | Histgram: Class Number: Normalize | 256 |
| -H2 | 選択 | Histgram2: Class Width: Integer: Normalize | 1 |
| -H3 | 選択 | Histgram: Class Number: Count | 256 |
| -H4 | 選択 | Histgram2: Class Width: Integer: Count | 1 |
| -H5 | 選択 | Histgram5: Class Number: Count | 1 |
| -H6 | 選択 | Histgram6: Class Width: Integer: Count | 1 |
| -Low | 選択 | Low : thres | 1 |
| -High | 選択 | High: thres | 1 |
| -rmax | 選択 | rmax [A] | 250 |
| -c | 選択 | NULL | |
| -m | 選択 | 0 | |
| -h | 選択 |
モードの詳細
| モード | 説明 |
|---|---|
| 0 | mean of all density |
| 1 | mean of sphere surface density at rmax |
| 2 | mean of cylinder surface density at rmax |
| 3 | mean of edge pixels |
| 4 | mean of Centre |
| 5 | mean of Sparse |
| 6 | mean of 2DEdge |
| 7 | RMS of all pixels |