「pdbAtomSection」の版間の差分
提供: Eospedia
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== 実行例 == | == 実行例 == | ||
| + | ===[[:Media:Input-121P.pdb.zip|入力ファイル]]の画像=== | ||
| + | <table> | ||
| + | <tr> | ||
| + | <td>[[画像:Input-121P-PDB.png]]</td> | ||
| + | <td><p align="left">重心<br> | ||
| + | 最大半径<br> | ||
| + | 最大半径(座標)<br> </p> | ||
| + | </td> | ||
| + | <td><p align="left">6.053012e+00 2.519590e+01 1.189075e+01<br> | ||
| + | 3.286664e+01 <br> | ||
| + | 24.77 23.85 28.04<br></p> | ||
| + | </td> | ||
| + | </tr> | ||
| + | </table> | ||
| + | <br> | ||
| + | |||
| + | ===オプション必須項目のみの場合=== | ||
| + | <table> | ||
| + | <tr> | ||
| + | <th>[[画像:Outdata-pdbAtomSection.png]]</th> | ||
| + | </tr> | ||
| + | <tr> | ||
| + | <th>6/90ページ(ページ左下)</th> | ||
| + | </tr> | ||
| + | </table> | ||
2014年1月28日 (火) 23:49時点における版
pdbAtomSectionとは原子モデルのセクション（断面）をとりだしてpsファイルで出力するEosのコマンドである。
オプション一覧
メインオプション
| オプション | 必須項目/選択項目 | 説明 | デフォルト |
|---|---|---|---|
| -i | 必須 | 入力ファイル: PDB | NULL |
| -if | 選択 | 入力ファイル: FlagsFile | NULL |
| -o | 必須 | 出力ファイル: psファイル | NULL |
| -dist | 選択 | Distance of Sections | 2.5 |
| -zmin | 選択 | zの最小値 | 0.0 |
| -zmax | 選択 | zの最大値 | 90.0 |
| -fm | 選択 | flag mode | 13 |
| -r | 選択 | 半径 | 1.0 |
| -clw | 選択 | 円周の幅 | 0.1 |
| -plw | 選択 | ペプチド結合の幅 | 0.1 |
| -fontsize | 選択 | font size | 2.0 |
| -AS | 選択 | absolute scale of PS file (-AS 1 := 1 mm/A) | 1.0 |
| -shiftx | 選択 | pdb Shift x [A] | 0.0 |
| -shifty | 選択 | pdb Shift y [A] | 0.0 |
| -shiftz | 選択 | pdb Shift z [A] | 0.0 |
| -c | 選択 | コンフィグファイル設定 | NULL |
| -m | 選択 | モードを設定 | 0 |
| -h | 選択 | ヘルプを表示 |
モードの詳細
| モード | 説明 |
|---|---|
| 0 |
実行例
入力ファイルの画像
 |
重心 最大半径 |
6.053012e+00 2.519590e+01 1.189075e+01 3.286664e+01 |
オプション必須項目のみの場合
 |
|---|
| 6/90ページ(ページ左下) |
