「pdbListRMSDCalc」の版間の差分
提供: Eospedia
| 行20: | 行20: | ||
<td>-r</td> | <td>-r</td> | ||
<td>必須</td> | <td>必須</td> | ||
| − | <td>参照ファイル</td> | + | <td>参照ファイル: [[PDB]]</td> |
<td>NULL</td> | <td>NULL</td> | ||
</tr> | </tr> | ||
| 行26: | 行26: | ||
<td>-o</td> | <td>-o</td> | ||
<td>必須</td> | <td>必須</td> | ||
| − | <td>出力ファイル</td> | + | <td>出力ファイル: [[PDB]]</td> |
<td>NULL</td> | <td>NULL</td> | ||
</tr> | </tr> | ||
| 行48: | 行48: | ||
</tr> | </tr> | ||
</table> | </table> | ||
| + | <br> | ||
===モードの詳細=== | ===モードの詳細=== | ||
| 行60: | 行61: | ||
</tr> | </tr> | ||
</table> | </table> | ||
| + | <br> | ||
===入力ファイルリストのフォーマット=== | ===入力ファイルリストのフォーマット=== | ||
| 行70: | 行72: | ||
</pre> | </pre> | ||
| + | <br> | ||
== 実行例 == | == 実行例 == | ||
2014年3月6日 (木) 08:08時点における版
オプション一覧
メインオプション
| オプション | 必須項目/選択項目 | 説明 | デフォルト |
|---|---|---|---|
| -i | 必須 | 入力ファイルリスト: ASCII | NULL |
| -r | 必須 | 参照ファイル: PDB | NULL |
| -o | 必須 | 出力ファイル: PDB | NULL |
| -c | 選択 | コンフィグファイル設定 | NULL |
| -m | 選択 | モードを設定 | 0 |
| -h | 選択 | ヘルプを表示 |
モードの詳細
| モード | 説明 |
|---|---|
| 0 |
入力ファイルリストのフォーマット
PDBファイル1
PDBファイル2
.
.
.
実行例
入力ファイルのデータ
Input-121P-T1.pdb Input-121P-T2.pdb Input-121P-T3.pdb
![]() |
重心 最大半径 |
6.053012e+00 9.408175e+00 2.622422e+01 3.286665e+01 |
![]() |
重心 最大半径 |
6.053012e+00 2.519590e+01 1.189075e+01 3.286664e+01 |
![]() |
重心 最大半径 |
5.097651e-01 1.932045e+01 1.188975e+01 3.286711e+01 |
参照のファイルの画像
![]() |
重心 最大半径 |
6.053012e+00 2.519590e+01 1.189075e+01 3.286664e+01 |



