「ctfFunction」の版間の差分
提供: Eospedia
| 行14: | 行14: | ||
<td>-o</td> | <td>-o</td> | ||
<td>選択</td> | <td>選択</td> | ||
| − | <td>出力ファイル</td> | + | <td>出力ファイル: テキスト</td> |
<td>stdout (設定しなければ標準出力)</td> | <td>stdout (設定しなければ標準出力)</td> | ||
</tr> | </tr> | ||
| 行41: | 行41: | ||
<td>2.1</td> | <td>2.1</td> | ||
</tr> | </tr> | ||
| + | <tr> | ||
| + | <td>-df</td> | ||
| + | <td>選択</td> | ||
| + | <td>Defocus[A]:under(+)</td> | ||
| + | <td>27000</td> | ||
| + | </tr> | ||
| + | <tr> | ||
| + | <td>-A</td> | ||
| + | <td>選択</td> | ||
| + | <td>AmplitudeContrast/PhaseContrast</td> | ||
| + | <td>0.0</td> | ||
| + | </tr> | ||
| + | <tr> | ||
| + | <td>-Ain</td> | ||
| + | <td>選択</td> | ||
| + | <td>IlluminationAperture[mrad]</td> | ||
| + | <td>0.02</td> | ||
| + | </tr> | ||
| + | <tr> | ||
| + | <td>-ctfMode</td> | ||
| + | <td>選択</td> | ||
| + | <td>CTFMode</td> | ||
| + | <td>32</td> | ||
| + | </tr> | ||
| + | <tr> | ||
| + | <td>-pvm</td> | ||
| + | <td>選択</td> | ||
| + | <td>PVM: MultiProcessor</td> | ||
| + | <td>0</td> | ||
| + | </tr> | ||
| + | <tr> | ||
| + | <td>-pvmList</td> | ||
| + | <td>選択</td> | ||
| + | <td>PVM Host List: MultiProcessor</td> | ||
| + | <td>stdin</td> | ||
| + | </tr> | ||
| + | <tr> | ||
| + | <td>-c</td> | ||
| + | <td>選択</td> | ||
| + | <td>コンフィグファイル設定</td> | ||
| + | <td>NULL</td> | ||
| + | </tr> | ||
| + | <tr> | ||
| + | <td>-m</td> | ||
| + | <td>選択</td> | ||
| + | <td>モードを設定</td> | ||
| + | <td>0</td> | ||
| + | </tr> | ||
| + | <tr> | ||
| + | <td>-h</td> | ||
| + | <td>選択</td> | ||
| + | <td>ヘルプを表示</td> | ||
| + | <td> </td> | ||
| + | </tr> | ||
</div> | </div> | ||
</table> | </table> | ||
2013年11月18日 (月) 04:57時点における版
ctfFunctionとはCTF(コントラスト伝達関数)を計算するためのEosのコマンドである。
オプション一覧
メインオプション
| オプション | 必須項目/選択項目 | 説明 | デフォルト |
|---|---|---|---|
| -o | 選択 | 出力ファイル: テキスト | stdout (設定しなければ標準出力) |
| -Rmax | 選択 | 最大空間周波数[/A] | 0.1 (1/10A=1/1nm) |
| -dR | 選択 | 空間周波数間隔[/A] | 0.0001 (1/10000A=1/100nm) |
| -kV | 選択 | 加速電圧[kV] | 200 |
| -Cs | 選択 | 球面収差[mm] | 2.1 |
| -df | 選択 | Defocus[A]:under(+) | 27000 |
| -A | 選択 | AmplitudeContrast/PhaseContrast | 0.0 |
| -Ain | 選択 | IlluminationAperture[mrad] | 0.02 |
| -ctfMode | 選択 | CTFMode | 32 |
| -pvm | 選択 | PVM: MultiProcessor | 0 |
| -pvmList | 選択 | PVM Host List: MultiProcessor | stdin |
| -c | 選択 | コンフィグファイル設定 | NULL |
| -m | 選択 | モードを設定 | 0 |
| -h | 選択 | ヘルプを表示 |
モードの詳細
| モード | 説明 |
|---|---|
| 0 | 位相コントラストだけ |
| 1 | 強度コントラストを加える |
| 32 | 包絡関数を積算する |