「統合コマンド」の版間の差分

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*使用方法2(Double): [[電子線トモグラフィー#実行例3(Doubleを使用した2軸傾斜での再構成)]]<br>
 
*使用方法2(Double): [[電子線トモグラフィー#実行例3(Doubleを使用した2軸傾斜での再構成)]]<br>
  
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３次元再構成(ラドン変換): [[:Media:Makefile-Tomogram7.zip]]<br>
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３次元再構成(ラドン変換): ([[:Media:Makefile-Tomogram7.zip|Makefileのみ]]) ([http://sourceforge.jp/projects/eos/scm/git/tutorial/archive/master/Tomography/Tomography7/ 全ファイル])<br>
 
*使用方法: [[電子線トモグラフィー#ラドン変換を使った３次元再構成で実行]]<br>
 
*使用方法: [[電子線トモグラフィー#ラドン変換を使った３次元再構成で実行]]<br>
 
*旧バージョン: [[:Media:Makefile-Tomogram3.zip]](ファイルからの角度情報の読み出しに未対応)<br>
 
*旧バージョン: [[:Media:Makefile-Tomogram3.zip]](ファイルからの角度情報の読み出しに未対応)<br>

2014年8月26日 (火) 07:41時点における版

統合コマンド一覧　

Eosが提供している統合コマンドの一覧を示します。現在は、ほとんどMakefileもしくはbashで書かれています。少しずつPIONEでの記述も提供します。

画像補正

CTFの補正


単粒子解析

２次元画像の分類（クラスター解析）と平均像の獲得

クラスター解析

実行例1: (Makefileのみ) (全ファイル)


リファレンスがある場合の３次元再構成

参照像の作成

PCAを使った場合: (Makefileのみ) (全ファイル)

PDBファイルを使った場合: (Makefileのみ) (全ファイル)


３次元再構成

mrc2Dto3Dを使用した場合: (Makefileのみ) (全ファイル)

ラドン変換を利用した場合: (Makefileのみ) (全ファイル)


３次元再構成の繰り返し処理

1軸回転: (Makefileのみ) (全ファイル)

1軸回転(角度情報偏り改善ver.): (Makefileのみ) (全ファイル)

2軸回転(角度情報偏り改善ver.): (Makefileのみ) (全ファイル)


らせん単粒子解析


電子線トモグラフィー

複数領域のROIのある電子線トモグラフィー法

３次元再構成(1軸傾斜): (Makefileのみ) (全ファイル)

ファイン・アラインメント: (Makefileのみ) (全ファイル)

ファイン・アラインメント(繰り返し): (Makefileのみ) (全ファイル)

３次元再構成(2軸傾斜): (Makefileのみ) (全ファイル)

３次元再構成(ラドン変換): (Makefileのみ) (全ファイル)

セグメンテーションとサブトモグラム

1軸傾斜: (Makefileのみ) (全ファイル)

2軸傾斜: (Makefileのみ) (全ファイル)


らせん対称性解析

らせん対称性を利用した3次元再構成


２次元画像処理


3次元画像処理


分解能解析


FRET解析


モデリング



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