「mrcImagePrint」の版間の差分

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<td>選択</td>  
 
<td>選択</td>  
 
<td>モードを設定</td>  
 
<td>モードを設定</td>  
<td>0</td>  
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<td>49</td>  
 
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-C  option is stronger than -AC and -PC
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-PC option is stronger than -AC
 +
-AC: (i+1)*(max-maen)  /(AC+1) + mean
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-PC: (i  )*(max+mean)/2)/AC    + (max+mean)/2
 +
-AS option is stronger than -S option
 +
The default value of -AS option is ignored.
 +
The default value of -S option is used.
 +
Both options are applied to y-axis.
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===モードの詳細===
 
===モードの詳細===
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<td>0</td>  
+
<td>1</td>  
<td></td>  
+
<td>ImageDensity</td>
 +
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<tr>
 +
<td>2</td>
 +
<td>Contour(DiffrentLineWidth)</td>  
 
</tr>  
 
</tr>  
 +
<tr>
 +
<td>4</td>
 +
<td>Contour(SameLineWidth)</td>
 +
</tr> 
 +
<tr>
 +
<td>8</td>
 +
<td>BlackCircles</td>
 +
</tr> 
 +
<tr>
 +
<td>16</td>
 +
<td>Scale</td>
 +
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 +
<tr>
 +
<td>32</td>
 +
<td>Centre Mark</td>
 +
</tr> 
 +
<tr>
 +
<td>16777216</td>
 +
<td>Amplitude by AsciiFile</td>
 +
</tr> 
 +
<tr>
 +
<td>33554432</td>
 +
<td>Log of Amplitude by AsciiFile</td>
 +
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 +
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 +
<td>67108864</td>
 +
<td>Phase by AsciiFile</td>
 +
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== 実行例 ==
 
== 実行例 ==

2013年11月6日 (水) 06:19時点における版

mrcImagePrintとはEosコマンドである。


オプション一覧

メインオプション

オプション 必須項目/選択項目 説明 デフォルト
-i 必須 入力ファイル: mrcImage NULL
-o 選択 出力ファイル: テキスト stdout
-H 選択 High Threshold 0.0
-L 選択 Low Threshold 1.0
-Section 選択 [z|x|y]Section z
-x 選択 x section:(xMin, xMax) (0, 0)
-y 選択 y section:(yMin, yMax) (0, 0)
-z 選択 z section:(zMin, zMax) (0, 0)
-S 選択 Scale(Centre is Bottom Left): -S 1 := 1 mm/pixel 1.0
-AS 選択 Scale(Centre is Bottom Left): -AS 1 := 1 mm/A (Real) or 1 mm/A-1 (Fourier Space) 1.0
-E 選択 Enlargement(image center is center) 1.0
-center 選択 Center of a printed image(in case of FT or N.x/2.0 in case of Image):(cx, cy) (0.0, 0.0)
-C 選択 ContourLevel 1.0
-I 選択 Black is High Density
-A 選択 HighThres=Mean-SD, LowThres=Mean+SD
-AC 選択 Auto Contour(thresHigh <-> mean) 10
-PC 選択 Peak Contour(thresHigh <-> (mean+thresHigh)/2 10
-AC2 選択 Auto Contour2(thresHigh <-> thresLow) 10
-Y 選択 Y-axis expanding 1
-RGB 選択 Contour Color Mode: RGB:(Red, Green, Blue) (0, 0, 0)
-RGBGradient 選択 Contour Color GradientMode: RGB:(RedFirst, GreenFirst, BlueFirst, RedLast, GreenLast, BlueLast) (0, 0, 0, 0, 0, 0)
-HSB 選択 Contour Color Mode: HSB:(Hue, Saturation, Brightness) (0, 0, 0)
-HSBGradient 選択 Contour Color GradientMode: HSB:(HueFirst, SaturationFirst, BrightnessFirst, HueLast, SaturationLast, BrightnessLast) (0, 0, 0, 0, 0, 0)
-LineColourRGB 選択 Contour Color Mode: RGB:(LineRed, LineGreen, LineBlue) (0, 0, 0)
-LineColourRGBGradient 選択 Contour Color GradientMode: RGB:(LineRedFirst, LineGreenFirst, LineBlueFirst, LineRedLast, LineGreenLast, LineBlueLast) (0, 0, 0, 0, 0, 0)
-LineColourHSB 選択 Contour Color Mode: HSB:(LineHue, LineSaturation, LineBrightness) (0, 0, 0)
-LineColourHSBGradient 選択 Contour Color GradientMode: HSB:(LineHueFirst, LineSaturationFirst, LineBrightnessFirst, LineHueLast, LineSaturationLast, LineBrightnessLast) (0, 0, 0, 0, 0, 0)
-LineChange 選択 Contour Color Change 0.1
-LineWidthStart 選択 Contour Line Width Start 0.1
-LineWidthStep 選択 Contour Line Width Step 0.05
-ReverseOrder 選択 Reverse Print Order
-Untwist 選択 Untwist Angle [degree/A], example: (-13,28) = 0.4709576 0.0
-UpsideDown 選択 Upside Down
-Centre 選択 Image Centre is at the centre of paper.
-CircleRadius 選択 Radius of circles in the case of imageCircles 0.5
-c 選択 コンフィグファイル設定 NULL
-m 選択 モードを設定 49
-h 選択 ヘルプを表示  
				-C  option is stronger than -AC and -PC
				-PC option is stronger than -AC
					-AC: (i+1)*(max-maen)  /(AC+1) + mean 
					-PC: (i  )*(max+mean)/2)/AC     + (max+mean)/2
				-AS option is stronger than -S option
				The default value of -AS option is ignored.
				The default value of -S option is used.
				Both options are applied to y-axis.

モードの詳細

モード 説明
1 ImageDensity
2 Contour(DiffrentLineWidth)
4 Contour(SameLineWidth)
8 BlackCircles
16 Scale
32 Centre Mark
16777216 Amplitude by AsciiFile
33554432 Log of Amplitude by AsciiFile
67108864 Phase by AsciiFile


実行例