「pdbMove」の版間の差分
提供: Eospedia
| 行29: | 行29: | ||
<td>x軸方向の移動量</td> | <td>x軸方向の移動量</td> | ||
<td>0</td> | <td>0</td> | ||
| + | </tr> | ||
<tr> | <tr> | ||
<td>-y</td> | <td>-y</td> | ||
| 行40: | 行41: | ||
<td>z軸方向の移動量</td> | <td>z軸方向の移動量</td> | ||
<td>0</td> | <td>0</td> | ||
| − | |||
</tr> | </tr> | ||
</div> | </div> | ||
| 行53: | 行53: | ||
<th>説明</th> | <th>説明</th> | ||
</tr> | </tr> | ||
| − | + | <tr> | |
| + | <td>0</td> | ||
| + | <td></td> | ||
| + | </tr> | ||
</div> | </div> | ||
</table> | </table> | ||
2013年12月5日 (木) 04:59時点における版
pdbMoveとはPDBファイルの原子モデルを平行移動するためのEosのコマンドである。
目次
オプション一覧
メインオプション
| オプション | 必須項目/選択項目 | 説明 | デフォルト |
|---|---|---|---|
| -i | 必須 | 入力ファイル:ＰＤＢ | NULL |
| -o | 必須 | 出力ファイル：ＰＤＢ | NULL |
| -x | 選択 | x軸方向の移動量 | 0 |
| -y | 選択 | y軸方向の移動量 | 0 |
| -z | 選択 | z軸方向の移動量 | 0 |
モードの詳細
| モード | 説明 |
|---|---|
| 0 |
実行例
ヘルプ実行
$ pdbMove -h
Usage: /Applications/Eos.app/Eos/bin/X86MAC64/pdbMove
Options:
[-i[nput] In (NULL )] :Essential :InputDataFile
[-o[utput] Out (NULL )] :Essential :OutputDataFile
[-x X (0.0 )] :Optional :Move X[A]
[-y Y (0.0 )] :Optional :Move Y[A]
[-z Z (0.0 )] :Optional :Move Z[A]
[-c[onfig] configFile (NULL )] :Optional :ConfigurationFile
[-m[ode] mode (0 )] :Optional :Mode
Additional Usage -----
------入力ファイルの詳細------
------オプション必須項目のみの場合の出力結果------
オプション-x,-y,-zのデフォルトは0.0なので、何も変わらない
------移動させる幅を設定（オプション -x,-y,-z）------
移動の幅をすべて1に設定
移動の幅をx=-6.053012e+00,y=-2.519590e+01,z=-1.189075e+01に設定
