「mrcRefCoreGet」の版間の差分

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<tr>  
 
<tr>  
 
<td>0</td>  
 
<td>0</td>  
<td>If |Pixel of Image| < Cutoff ,|Pixel of Image|=0</td>  
+
<td>データの絶対値がCutoff未満の場合は0に補正する</td>  
 
</tr>  
 
</tr>  
 
<tr>  
 
<tr>  
 
<td>1</td>  
 
<td>1</td>  
<td>If |Pixel of Image| < Cutoff*SqrAvr ,|Pixel of Image|=0</td>  
+
<td>データの絶対値がCutoff*SqrAvr未満の場合は0に補正する</td>  
 
</tr>  
 
</tr>  
 
</table>  
 
</table>  
行67: 行67:
  
 
== 実行例 ==
 
== 実行例 ==
===入力ファイルの画像===
+
===[[Media:Input-ThickFilaments1-R.mrc | 入力ファイル]]の画像===
 
<table>  
 
<table>  
 
<tr>  
 
<tr>  
<td>[[画像:Input-mrcRefCoreGet.png]]</td>  
+
<td><p align="Center">[[画像:Input-ThickFilaments1-R.png]]<br>
 +
xy平面<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="Center">[[画像:Input1-ThickFilaments1-R.png]]<br>
 +
yz平面<br></p>
 +
</td>  
 
<td><p align="left">最小<br>  
 
<td><p align="left">最小<br>  
 
最大<br>  
 
最大<br>  
行77: 行82:
 
標準誤差<br></p>  
 
標準誤差<br></p>  
 
</td>  
 
</td>  
<td><p align="left">-1.12463 (4, 0, 62)<br>  
+
<td><p align="left">-1.28686 (30, 27, 1)<br>  
 
15 (8, 0, 0)<br>  
 
15 (8, 0, 0)<br>  
4.00604<br>  
+
0.118695<br>  
3.45942<br>  
+
0.579571<br>  
0.0208384<br></p>  
+
0.000709225<br></p>  
 
</td>  
 
</td>  
 
</tr>  
 
</tr>  
 
</table>  
 
</table>  
 +
  
 
===オプション必須項目のみの場合===
 
===オプション必須項目のみの場合===
 
<table>  
 
<table>  
 
<tr>  
 
<tr>  
<td>[[画像:Outdata-mrcRefCoreGet.png]]</td>  
+
<td><p align="Center">[[画像:Outdata-mrcRefCoreGet.png]]<br>
 +
xy平面<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="Center">[[画像:Outdata1-mrcRefCoreGet.png]]<br>
 +
yz平面<br></p>
 +
</td>  
 
<td><p align="left">最小<br>  
 
<td><p align="left">最小<br>  
 
最大<br>  
 
最大<br>  
行96: 行107:
 
標準誤差<br></p>  
 
標準誤差<br></p>  
 
</td>  
 
</td>  
<td><p align="left">-1.12463 (4, 0, 62)<br>  
+
<td><p align="left">-1.28686 (30, 27, 1)<br>  
 
15 (8, 0, 0)<br>  
 
15 (8, 0, 0)<br>  
4.00604<br>  
+
0.118695<br>  
3.45942<br>  
+
0.579571<br>  
0.0208384<br></p>  
+
0.000709225<br></p>  
 
</td>  
 
</td>  
 
</tr>  
 
</tr>  
 
</table>  
 
</table>  
 +
<div>デフォルトではC=0なので補正しない</div>
 +
  
 
===オプション -C===
 
===オプション -C===
====C=10で実行====  
+
====C=2.5で実行====  
 
<table>  
 
<table>  
 
<tr>  
 
<tr>  
<td>[[画像:Outdata-C-mrcRefCoreGet.png]]</td>  
+
<td><p align="Center">[[画像:Outdata-C-mrcRefCoreGet.png]]<br>
 +
xy平面<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="Center">[[画像:Outdata1-C-mrcRefCoreGet.png]]<br>
 +
yz平面<br></p>
 +
</td>  
 
<td><p align="left">最小<br>  
 
<td><p align="left">最小<br>  
 
最大<br>  
 
最大<br>  
行118: 行136:
 
<td><p align="left">0 (0, 0, 0)<br>  
 
<td><p align="left">0 (0, 0, 0)<br>  
 
15 (8, 0, 0)<br>  
 
15 (8, 0, 0)<br>  
0.0791433<br>  
+
0.0702304<br>  
0.899715<br>  
+
0.485476<br>  
0.00541958<br></p>  
+
0.000594079<br></p>  
 
</td>  
 
</td>  
 
</tr>  
 
</tr>  
</table>
+
</table>  
 +
 
  
 
===オプション -m===
 
===オプション -m===
====m=1, C=1.7で実行====  
+
====m=1, C=5で実行====  
 
<table>  
 
<table>  
 
<tr>  
 
<tr>  
<td>[[画像:Outdata-m-mrcRefCoreGet.png]]</td>  
+
<td><p align="Center">[[画像:Outdata-m-mrcRefCoreGet.png]]<br>
 +
xy平面<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="Center">[[画像:Outdata1-m-mrcRefCoreGet.png]]<br>
 +
yz平面<br></p>
 +
</td>  
 
<td><p align="left">最小<br>  
 
<td><p align="left">最小<br>  
 
最大<br>  
 
最大<br>  
行138: 行162:
 
<td><p align="left">0 (0, 0, 0)<br>  
 
<td><p align="left">0 (0, 0, 0)<br>  
 
15 (8, 0, 0)<br>  
 
15 (8, 0, 0)<br>  
0.365579<br>  
+
0.0475147<br>  
1.84002<br>  
+
0.419722<br>  
0.0110837<br></p>  
+
0.000513616<br></p>  
 
</td>  
 
</td>  
 
</tr>  
 
</tr>  
 
</table>
 
</table>

2013年12月24日 (火) 00:20時点における版

mrcRefCoreGetとはEosコマンドである。


オプション一覧

メインオプション

オプション 必須項目/選択項目 説明 デフォルト
-i 必須 入力ファイル: mrcImage NULL
-o 必須 出力ファイル: mrcImage NULL
-C 選択 Cutoff 0
-c 選択 コンフィグファイル設定 NULL
-m 選択 モードを設定 0
-h 選択 ヘルプを表示  

モードの詳細

モード 説明
0 データの絶対値がCutoff未満の場合は0に補正する
1 データの絶対値がCutoff*SqrAvr未満の場合は0に補正する


実行例

入力ファイルの画像

Input-ThickFilaments1-R.png
xy平面

Input1-ThickFilaments1-R.png
yz平面

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

-1.28686 (30, 27, 1)

15 (8, 0, 0)
0.118695
0.579571

0.000709225


オプション必須項目のみの場合

Outdata-mrcRefCoreGet.png
xy平面

Outdata1-mrcRefCoreGet.png
yz平面

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

-1.28686 (30, 27, 1)

15 (8, 0, 0)
0.118695
0.579571

0.000709225

デフォルトではC=0なので補正しない


オプション -C

C=2.5で実行

Outdata-C-mrcRefCoreGet.png
xy平面

Outdata1-C-mrcRefCoreGet.png
yz平面

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

0 (0, 0, 0)

15 (8, 0, 0)
0.0702304
0.485476

0.000594079


オプション -m

m=1, C=5で実行

Outdata-m-mrcRefCoreGet.png
xy平面

Outdata1-m-mrcRefCoreGet.png
yz平面

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

0 (0, 0, 0)

15 (8, 0, 0)
0.0475147
0.419722

0.000513616