「mrcRefSmoothing」の版間の差分
細 (Kinoshita がページ「MrcRefSmoothing」を「mrcRefSmoothing」に移動しました) |
|||
行87: | 行87: | ||
== 実行例 == | == 実行例 == | ||
− | === | + | ===[[Media:Input-121P1-R.mrc | 入力ファイル]]の画像=== |
<table> | <table> | ||
<tr> | <tr> | ||
− | <td>[[画像:Input- | + | <td><p align="center">[[画像:Input-121P1-R163.png]]<br> |
− | <td><p align="left">最小<br> | + | z=163<br></p> |
+ | </td> | ||
+ | <td><p align="left">サイズ<br> | ||
+ | モード<br> | ||
+ | 最小<br> | ||
最大<br> | 最大<br> | ||
平均値<br> | 平均値<br> | ||
行97: | 行101: | ||
標準誤差<br></p> | 標準誤差<br></p> | ||
</td> | </td> | ||
− | <td><p align="left">- | + | <td><p align="left">( 56, 27, 326)<br> |
− | + | mrcFloatImage <br> | |
− | + | -1503.16 (14, 25, 131)<br> | |
− | + | 36873.4 (28, 20, 158)<br> | |
− | + | 6082.23<br> | |
+ | 6479.76<br> | ||
+ | 9.22942<br></p> | ||
</td> | </td> | ||
</tr> | </tr> | ||
</table> | </table> | ||
+ | |||
===オプション -m=== | ===オプション -m=== | ||
行110: | 行117: | ||
<table> | <table> | ||
<tr> | <tr> | ||
− | <td>[[画像:Outdata-m1-mrcRefSmoothing.png]]</td> | + | <td><p align="center">[[画像:Outdata-m1-mrcRefSmoothing.png]]<br> |
− | <td><p align="left">最小<br> | + | z=163<br></p> |
+ | </td> | ||
+ | <td><p align="left">サイズ<br> | ||
+ | モード<br> | ||
+ | 最小<br> | ||
最大<br> | 最大<br> | ||
平均値<br> | 平均値<br> | ||
行117: | 行128: | ||
標準誤差<br></p> | 標準誤差<br></p> | ||
</td> | </td> | ||
− | <td><p align="left">- | + | <td><p align="left">( 56, 27, 326)<br> |
− | + | mrcFloatImage <br> | |
− | + | -1503.16 (14, 25, 131)<br> | |
− | + | 36873.4 (28, 20, 158)<br> | |
− | + | 6082.23<br> | |
+ | 6479.76<br> | ||
+ | 9.22942<br></p> | ||
</td> | </td> | ||
</tr> | </tr> | ||
</table> | </table> | ||
+ | |||
====m=2で実行==== | ====m=2で実行==== | ||
<table> | <table> | ||
<tr> | <tr> | ||
− | <td>[[画像:Outdata-m2-mrcRefSmoothing.png]]</td> | + | <td><p align="center">[[画像:Outdata-m2-mrcRefSmoothing.png]]<br> |
− | <td><p align="left">最小<br> | + | z=163<br></p> |
+ | </td> | ||
+ | <td><p align="left">サイズ<br> | ||
+ | モード<br> | ||
+ | 最小<br> | ||
最大<br> | 最大<br> | ||
平均値<br> | 平均値<br> | ||
行136: | 行154: | ||
標準誤差<br></p> | 標準誤差<br></p> | ||
</td> | </td> | ||
− | <td><p align="left">- | + | <td><p align="left">( 56, 27, 326)<br> |
− | + | mrcFloatImage <br> | |
− | + | -1410.88 (15, 26, 132)<br> | |
− | + | 29742.1 (33, 26, 4)<br> | |
− | + | 2238.05<br> | |
+ | 2466.5<br> | ||
+ | 3.51315<br></p> | ||
</td> | </td> | ||
</tr> | </tr> | ||
</table> | </table> | ||
+ | |||
====m=3で実行==== | ====m=3で実行==== | ||
<table> | <table> | ||
<tr> | <tr> | ||
− | <td>[[画像:Outdata-m3-mrcRefSmoothing.png]]</td> | + | <td><p align="center">[[画像:Outdata-m3-mrcRefSmoothing.png]]<br> |
− | <td><p align="left">最小<br> | + | z=163<br></p> |
+ | </td> | ||
+ | <td><p align="left">サイズ<br> | ||
+ | モード<br> | ||
+ | 最小<br> | ||
最大<br> | 最大<br> | ||
平均値<br> | 平均値<br> | ||
行155: | 行180: | ||
標準誤差<br></p> | 標準誤差<br></p> | ||
</td> | </td> | ||
− | <td><p align="left">- | + | <td><p align="left">( 56, 27, 326)<br> |
− | + | mrcFloatImage <br> | |
− | + | -1410.88 (15, 26, 132)<br> | |
− | + | 29742.1 (33, 26, 4)<br> | |
− | + | 844.502<br> | |
+ | 1886.37<br> | ||
+ | 2.68684<br></p> | ||
</td> | </td> | ||
</tr> | </tr> | ||
</table> | </table> | ||
+ | |||
====m=4で実行==== | ====m=4で実行==== | ||
<table> | <table> | ||
<tr> | <tr> | ||
− | <td>[[画像:Outdata-m4-mrcRefSmoothing.png]]</td> | + | <td><p align="center">[[画像:Outdata-m4-mrcRefSmoothing.png]]<br> |
− | <td><p align="left">最小<br> | + | z=163<br></p> |
+ | </td> | ||
+ | <td><p align="left">サイズ<br> | ||
+ | モード<br> | ||
+ | 最小<br> | ||
最大<br> | 最大<br> | ||
平均値<br> | 平均値<br> | ||
行174: | 行206: | ||
標準誤差<br></p> | 標準誤差<br></p> | ||
</td> | </td> | ||
− | <td><p align="left">- | + | <td><p align="left">( 56, 27, 326)<br> |
− | + | mrcFloatImage <br> | |
− | + | -1503.16 (13, 25, 131)<br> | |
− | + | 36873.4 (27, 20, 158)<br> | |
− | + | 6082.23<br> | |
+ | 6479.76<br> | ||
+ | 9.22942<br></p> | ||
</td> | </td> | ||
</tr> | </tr> | ||
</table> | </table> | ||
+ | |||
===オプション -sx, -sy, -sz=== | ===オプション -sx, -sy, -sz=== | ||
行187: | 行222: | ||
<table> | <table> | ||
<tr> | <tr> | ||
− | <td>[[画像:Outdata-sxsysz-mrcRefSmoothing.png]]</td> | + | <td><p align="center">[[画像:Outdata-sxsysz-mrcRefSmoothing.png]]<br> |
− | <td><p align="left">最小<br> | + | z=163<br></p> |
+ | </td> | ||
+ | <td><p align="left">サイズ<br> | ||
+ | モード<br> | ||
+ | 最小<br> | ||
最大<br> | 最大<br> | ||
平均値<br> | 平均値<br> | ||
行194: | 行233: | ||
標準誤差<br></p> | 標準誤差<br></p> | ||
</td> | </td> | ||
− | <td><p align="left"> | + | <td><p align="left">( 56, 27, 326)<br> |
− | + | mrcFloatImage <br> | |
− | + | <br> | |
− | + | <br> | |
− | + | <br> | |
+ | <br> | ||
+ | <br></p> | ||
</td> | </td> | ||
</tr> | </tr> | ||
</table> | </table> |
2013年12月25日 (水) 05:31時点における版
目次
オプション一覧
メインオプション
オプション | 必須項目/選択項目 | 説明 | デフォルト |
---|---|---|---|
-i | 必須 | 入力ファイル: mrcImage | NULL |
-o | 必須 | 出力ファイル: mrcImage | NULL |
-sx | 選択 | カーネルサイズ x: 奇数 | 3 |
-sy | 選択 | カーネルサイズ y: 奇数 | 3 |
-sz | 選択 | カーネルサイズ z: 奇数 | 3 |
-c | 選択 | コンフィグファイル設定 | NULL |
-m | 選択 | モードを設定 | 0: 未定義 |
-h | 選択 | ヘルプを表示 |
モードの詳細
モード | 説明 |
---|---|
1 | Median filter |
2 | Mean filter |
3 | Surface Fit filter |
4 | Lee-Sigma filter |
実行例
入力ファイルの画像
サイズ モード |
( 56, 27, 326) mrcFloatImage |
オプション -m
m=1で実行
サイズ モード |
( 56, 27, 326) mrcFloatImage |
m=2で実行
サイズ モード |
( 56, 27, 326) mrcFloatImage |
m=3で実行
サイズ モード |
( 56, 27, 326) mrcFloatImage |
m=4で実行
サイズ モード |
( 56, 27, 326) mrcFloatImage |
オプション -sx, -sy, -sz
sx=3, sy=5, sz=7, m=2で実行
サイズ モード |
( 56, 27, 326) mrcFloatImage |