「mrcImageVarianceAnalysis」の版間の差分

提供: Eospedia
移動: 案内、検索
行115: 行115:
 
</pre>
 
</pre>
  
−
<div>input1のデータ</div>
+
<div>Input1のデータ</div>
 +
<pre>
 +
/Eos/img/Input-1VOM-N-40.mrc 0 1
 +
/Eos/img/Input-1VOM-N-45.mrc 0 1
 +
 
 +
</pre>
 +
 
 +
<div>[[Media:Input-1VOM-N-40.mrc|Input-1VOM-N-40.mrc]]の画像</div>
 +
<table>
 +
<tr>
 +
<td>[[画像:Input-1VOM-N-40.png]]</td>
 +
<td><p align="left">最小<br>
 +
最大<br>
 +
平均値<br>
 +
標準偏差<br>
 +
標準誤差<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="left">-1631.11 (72, 71, 0)<br>
 +
3621.06 (11, 27, 0)<br>
 +
121.185<br>
 +
629.933<br>
 +
7.87416<br></p>
 +
</td>
 +
</tr>
 +
</table>
 +
 
 +
<div>[[Media:Input-1VOM-N-45.mrc|Input-1VOM-N-45.mrc]]の画像</div>
 +
<table>
 +
<tr>
 +
<td>[[画像:Input-1VOM-N-45.png]]</td>
 +
<td><p align="left">最小<br>
 +
最大<br>
 +
平均値<br>
 +
標準偏差<br>
 +
標準誤差<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="left">-1797.32 (0, 40, 0)<br>
 +
3996.35 (17, 62, 0)<br>
 +
129.146<br>
 +
627.982<br>
 +
7.84977<br></p>
 +
</td>
 +
</tr>
 +
</table>
 +
 
 +
<div>Input2のデータ</div>
 +
<pre>
 +
/Eos/img/Input-1VOM-N-50.mrc 0 1
 +
/Eos/img/Input-1VOM-N-55.mrc 0 1
 +
 
 +
</pre>
 +
 
 +
<div>[[Media:Input-1VOM-N-50.mrc|Input-1VOM-N-50.mrc]]の画像</div>
 +
<table>
 +
<tr>
 +
<td>[[画像:Input-1VOM-N-50.png]]</td>
 +
<td><p align="left">最小<br>
 +
最大<br>
 +
平均値<br>
 +
標準偏差<br>
 +
標準誤差<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="left">-1901.07 (62, 74, 0)<br>
 +
3446.77 (48, 32, 0)<br>
 +
129.75<br>
 +
625.926<br>
 +
7.82408<br></p>
 +
</td>
 +
</tr>
 +
</table>
 +
 
 +
<div>[[Media:Input-1VOM-N-55.mrc|Input-1VOM-N-55.mrc]]の画像</div>
 +
<table>
 +
<tr>
 +
<td>[[画像:Input-1VOM-N-55.png]]</td>
 +
<td><p align="left">最小<br>
 +
最大<br>
 +
平均値<br>
 +
標準偏差<br>
 +
標準誤差<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="left">-1893.8 (78, 47, 0)<br>
 +
3948.51 (49, 7, 0)<br>
 +
150.139<br>
 +
645.555<br>
 +
8.06943<br></p>
 +
</td>
 +
</tr>
 +
</table>
 +
 
 +
<div>Input3のデータ</div>
 +
<pre>
 +
/Eos/img/Input-1VOM-N-60.mrc 0 1
 +
/Eos/img/Input-1VOM-N-65.mrc 0 1
 +
 
 +
</pre>
 +
 
 +
<div>[[Media:Input-1VOM-N-60.mrc|Input-1VOM-N-60.mrc]]の画像</div>
 +
<table>
 +
<tr>
 +
<td>[[画像:Input-1VOM-N-60.png]]</td>
 +
<td><p align="left">最小<br>
 +
最大<br>
 +
平均値<br>
 +
標準偏差<br>
 +
標準誤差<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="left">-2169.75 (63, 69, 0)<br>
 +
3385.63 (50, 47, 0)<br>
 +
129.197<br>
 +
636.421<br>
 +
7.95527<br></p>
 +
</td>
 +
</tr>
 +
</table>
 +
 
 +
<div>[[Media:Input-1VOM-N-65.mrc|Input-1VOM-N-65.mrc]]の画像</div>
 +
<table>
 +
<tr>
 +
<td>[[画像:Input-1VOM-N-65.png]]</td>
 +
<td><p align="left">最小<br>
 +
最大<br>
 +
平均値<br>
 +
標準偏差<br>
 +
標準誤差<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="left">-1901.57 (21, 23, 0)<br>
 +
3647.85 (18, 34, 0)<br>
 +
111.178<br>
 +
607.688<br>
 +
7.5961<br></p>
 +
</td>
 +
</tr>
 +
</table>
 +
 
 +
 
 +
===参照ファイルのデータ===
 +
<pre>
 +
/Eos/data/Refer1.txt
 +
/Eos/data/Refer2.txt
 +
/Eos/data/Refer3.txt
 +
 
 +
</pre>
 +
 
 +
<div>Refer1のデータ</div>
 
<pre>
 
<pre>
 
/Eos/img/1VOM-40.mrc 0 1
 
/Eos/img/1VOM-40.mrc 0 1
行160: 行304:
 
</table>
 
</table>
  
−
<div>input2のデータ</div>
+
<div>Refer2のデータ</div>
 
<pre>
 
<pre>
 
/Eos/img/1VOM-50.mrc 0 1
 
/Eos/img/1VOM-50.mrc 0 1
行205: 行349:
 
</table>
 
</table>
  
−
<div>input3のデータ</div>
+
<div>Refer3のデータ</div>
 
<pre>
 
<pre>
 
/Eos/img/1VOM-60.mrc 0 1
 
/Eos/img/1VOM-60.mrc 0 1
行249: 行393:
 
</tr>  
 
</tr>  
 
</table>
 
</table>
 +
 +
 +
===入力ファイルのみの場合===
 +
<div>-o の画像</div>
 +
<table>
 +
<tr>
 +
<td>[[画像:Outdata-mrcImageVarianceAnalysis.png]]</td>
 +
<td><p align="left">最小<br>
 +
最大<br>
 +
平均値<br>
 +
標準偏差<br>
 +
標準誤差<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="left">50.0051 (48, 47, 0)<br>
 +
99.9996 (28, 61, 0)<br>
 +
80.7306<br>
 +
15.1406<br>
 +
0.189258<br></p>
 +
</td>
 +
</tr>
 +
</table>
 +
 +
<div>-v の画像</div>
 +
<table>
 +
<tr>
 +
<td><p align="left">最小<br>
 +
最大<br>
 +
平均値<br>
 +
標準偏差<br>
 +
標準誤差<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="left">0.000101508 (48, 47, 0)<br>
 +
3680.18 (28, 61, 0)<br>
 +
11.7094<br>
 +
77.1107<br>
 +
0.963884<br></p>
 +
</td>
 +
</tr>
 +
</table>
 +
 +
<div>[[mrcImageMakeDump]]で見た場合</div>
 +
<pre>
 +
0 0 1.25201
 +
1 0 0.656326
 +
2 0 0.208465
 +
3 0 0.924041
 +
4 0 0.531474
 +
 +
-中略-
 +
 +
46 47 4.88856
 +
47 47 0.140194
 +
48 47 0.000101508
 +
49 47 0.00912988
 +
50 47 0.41335
 +
 +
-中略-
 +
 +
26 61 0.142275
 +
27 61 3.64614
 +
28 61 3680.18
 +
29 61 2.14012
 +
30 61 4.39966
 +
 +
-中略-
 +
 +
75 79 32.6494
 +
76 79 0.429284
 +
77 79 0.585887
 +
78 79 1.82134
 +
79 79 473.092
 +
</pre>

2014年1月8日 (水) 05:22時点における版

mrcImageVarianceAnalysisとは分散解析を行うEosのコマンドである。


オプション一覧

メインオプション

オプション 必須項目/選択項目 説明 デフォルト
-i 選択 入力リスト: テキスト NULL
-r 選択 参照: 入力リスト NULL
-o 選択 出力: 分散率 NULL
-v 選択 出力: 分散解析 NULL
-c 選択 コンフィグファイル設定 NULL
-m 選択 モードを設定 0
-h 選択 ヘルプを表示 　

モードの詳細

モード 説明
0

入力リストのフォーマット

入力1
入力2
   .
   .
   .

入力1, 2, ... のフォーマット

ファイル名		A	B
	. 			.	.
	.			.	.
A + B*density


分散分析のアルゴリズム

   VarianceRatio := VarinceBetweenClasses/(SumOfVarianceWithinEachClass)
                  VarinceBetweenClasses: variance between classes
                  VarinceWithClasses:    variance within each class

General Information

   Kai-distribution: Kai^2 = SumOf (Xi - AvgOfXi)^2/sigma^2  
                           = s^2*(n-1)/sigma^2  : degree of freedom n-1 
                             when variables Xi are due to N(u, sigma^2)
   Kai-distribution: Kai^2 = Kai1^2 + Kai2^2 : degree of freedom m1 + m2
   F-distribution: F = (Kai1^2/k1)/(Kai2^2/k2)           : degree of freedom : (k1, k2)
                       (s1^2/sigma1^2)/(s2^2/sigma2^2)   : degree of freedom : (k1-1, k2-1)
   If sigma1 == sigma2, then                    
                       s1^2/s2^2  (Variance Ratio)       : degree of freedom : (k1-1, k2-1)


実行例

入力ファイルのデータ

/Eos/data/Input1.txt
/Eos/data/Input2.txt
/Eos/data/Input3.txt
Input1のデータ
/Eos/img/Input-1VOM-N-40.mrc 0 1
/Eos/img/Input-1VOM-N-45.mrc 0 1
Input-1VOM-N-40.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

-1631.11 (72, 71, 0)

3621.06 (11, 27, 0)
121.185
629.933

7.87416
Input-1VOM-N-45.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

-1797.32 (0, 40, 0)

3996.35 (17, 62, 0)
129.146
627.982

7.84977
Input2のデータ
/Eos/img/Input-1VOM-N-50.mrc 0 1
/Eos/img/Input-1VOM-N-55.mrc 0 1
Input-1VOM-N-50.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

-1901.07 (62, 74, 0)

3446.77 (48, 32, 0)
129.75
625.926

7.82408
Input-1VOM-N-55.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

-1893.8 (78, 47, 0)

3948.51 (49, 7, 0)
150.139
645.555

8.06943
Input3のデータ
/Eos/img/Input-1VOM-N-60.mrc 0 1
/Eos/img/Input-1VOM-N-65.mrc 0 1
Input-1VOM-N-60.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

-2169.75 (63, 69, 0)

3385.63 (50, 47, 0)
129.197
636.421

7.95527
Input-1VOM-N-65.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

-1901.57 (21, 23, 0)

3647.85 (18, 34, 0)
111.178
607.688

7.5961


参照ファイルのデータ

/Eos/data/Refer1.txt
/Eos/data/Refer2.txt
/Eos/data/Refer3.txt
Refer1のデータ
/Eos/img/1VOM-40.mrc 0 1
/Eos/img/1VOM-45.mrc 1 1
1VOM-40.mrcの画像
1VOM-40.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

0 (0, 0, 0)

3077.54 (41, 49, 0)
126.786
387.323

4.84154
1VOM-45.mrcの画像
1VOM-45.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

0 (0, 0, 0)

3099.59 (17, 62, 0)
123.791
381.654

4.77068
Refer2のデータ
/Eos/img/1VOM-50.mrc 0 1
/Eos/img/1VOM-55.mrc 0 1
1VOM-50.mrcの画像
1VOM-50.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

0 (0, 0, 0)

3095.88 (33, 57, 0)
143.393
399.986

4.99982
1VOM-55.mrcの画像
1VOM-55.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

0 (0, 0, 0)

3044.97 (51, 58, 0)
148.952
413.856

5.1732
Refer3のデータ
/Eos/img/1VOM-60.mrc 0 1
/Eos/img/1VOM-65.mrc 0 1
1VOM-60.mrcの画像
1VOM-60.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

0 (0, 0, 0)

3026.91 (50, 47, 0)
129.875
386.428

4.83035
1VOM-65.mrcの画像
1VOM-65.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

0 (0, 0, 0)

3308.47 (26, 42, 0)
105.169
351.901

4.39877


入力ファイルのみの場合

-o の画像
Outdata-mrcImageVarianceAnalysis.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

50.0051 (48, 47, 0)

99.9996 (28, 61, 0)
80.7306
15.1406

0.189258
-v の画像

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

0.000101508 (48, 47, 0)

3680.18 (28, 61, 0)
11.7094
77.1107

0.963884
mrcImageMakeDumpで見た場合
0 0 1.25201 
1 0 0.656326 
2 0 0.208465 
3 0 0.924041 
4 0 0.531474 

-中略-

46 47 4.88856 
47 47 0.140194 
48 47 0.000101508 
49 47 0.00912988 
50 47 0.41335 

-中略-

26 61 0.142275 
27 61 3.64614 
28 61 3680.18 
29 61 2.14012 
30 61 4.39966 

-中略-

75 79 32.6494 
76 79 0.429284 
77 79 0.585887 
78 79 1.82134 
79 79 473.092

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