「mrcImageOddBoxel」の版間の差分

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行12: 行12:
 
</tr>  
 
</tr>  
 
<tr>  
 
<tr>  
−
<td>-i</td>  
+
<td>-I</td>  
 
<td>必須</td>  
 
<td>必須</td>  
−
<td>入力ファイル</td>  
+
<td>入力ファイルリスト: テキスト</td>  
 
<td>stdin</td>  
 
<td>stdin</td>  
 
</tr>  
 
</tr>  
行96: 行96:
 
</tr>  
 
</tr>  
 
</table>  
 
</table>  
 +
 +
===入力ファイルのフォーマット===
 +
<pre>
 +
mrcファイル1
 +
mrcファイル2
 +
.
 +
.
 +
.
 +
 +
</pre>
  
  
 
== 実行例 ==
 
== 実行例 ==
 +
===入力ファイルのデータ===
 +
<pre>
 +
/Eos/img/1VOM-40.mrc
 +
/Eos/img/1VOM-45.mrc
 +
/Eos/img/1VOM-50.mrc
 +
/Eos/img/1VOM-55.mrc
 +
/Eos/img/1VOM-60.mrc
 +
/Eos/img/1VOM-65.mrc
 +
 +
</pre>
 +
 +
<div>[[Media:1VOM-40.mrc|1VOM-40.mrc]]の画像</div>
 +
<table>
 +
<tr>
 +
<td>[[画像:1VOM-40.png]]</td>
 +
<td><p align="left">最小<br>
 +
最大<br>
 +
平均値<br>
 +
標準偏差<br>
 +
標準誤差<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="left">0 (0, 0, 0)<br>
 +
3077.54 (41, 49, 0)<br>
 +
126.786<br>
 +
387.323<br>
 +
4.84154<br></p>
 +
</td>
 +
</tr>
 +
</table>
 +
 +
<div>[[Media:1VOM-45.mrc|1VOM-45.mrc]]の画像</div>
 +
<table>
 +
<tr>
 +
<td>[[画像:1VOM-45.png]]</td>
 +
<td><p align="left">最小<br>
 +
最大<br>
 +
平均値<br>
 +
標準偏差<br>
 +
標準誤差<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="left">0 (0, 0, 0)<br>
 +
3099.59 (17, 62, 0)<br>
 +
123.791<br>
 +
381.654<br>
 +
4.77068<br></p>
 +
</td>
 +
</tr>
 +
</table>
 +
 +
<div>[[Media:1VOM-50.mrc|1VOM-50.mrc]]の画像</div>
 +
<table>
 +
<tr>
 +
<td>[[画像:1VOM-50.png]]</td>
 +
<td><p align="left">最小<br>
 +
最大<br>
 +
平均値<br>
 +
標準偏差<br>
 +
標準誤差<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="left">0 (0, 0, 0)<br>
 +
3095.88 (33, 57, 0)<br>
 +
143.393<br>
 +
399.986<br>
 +
4.99982<br></p>
 +
</td>
 +
</tr>
 +
</table>
 +
 +
<div>[[Media:1VOM-55.mrc|1VOM-55.mrc]]の画像</div>
 +
<table>
 +
<tr>
 +
<td>[[画像:1VOM-55.png]]</td>
 +
<td><p align="left">最小<br>
 +
最大<br>
 +
平均値<br>
 +
標準偏差<br>
 +
標準誤差<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="left">0 (0, 0, 0)<br>
 +
3044.97 (51, 58, 0)<br>
 +
148.952<br>
 +
413.856<br>
 +
5.1732<br></p>
 +
</td>
 +
</tr>
 +
</table>
 +
 +
<div>[[Media:1VOM-60.mrc|1VOM-60.mrc]]の画像</div>
 +
<table>
 +
<tr>
 +
<td>[[画像:1VOM-60.png]]</td>
 +
<td><p align="left">最小<br>
 +
最大<br>
 +
平均値<br>
 +
標準偏差<br>
 +
標準誤差<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="left">0 (0, 0, 0)<br>
 +
3026.91 (50, 47, 0)<br>
 +
129.875<br>
 +
386.428<br>
 +
4.83035<br></p>
 +
</td>
 +
</tr>
 +
</table>
 +
 +
<div>[[Media:1VOM-65.mrc|1VOM-65.mrc]]の画像</div>
 +
<table>
 +
<tr>
 +
<td>[[画像:1VOM-65.png]]</td>
 +
<td><p align="left">最小<br>
 +
最大<br>
 +
平均値<br>
 +
標準偏差<br>
 +
標準誤差<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="left">0 (0, 0, 0)<br>
 +
3308.47 (26, 42, 0)<br>
 +
105.169<br>
 +
351.901<br>
 +
4.39877<br></p>
 +
</td>
 +
</tr>
 +
</table>
 +
 +
 +
===オプション必須項目のみの場合===
 +
<div>(入力ファイル).scoreが入力ファイル数毎に出力される。</div><br>
 +
<div>1VOM-40.mrc.scoreの画像</div>
 +
<table>
 +
<tr>
 +
<td>[[画像:Outdata-mrcImageOddBoxel.png]]</td>
 +
<td><p align="left">最小<br>
 +
最大<br>
 +
平均値<br>
 +
標準偏差<br>
 +
標準誤差<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="left">-1.42114 (29, 17, 0)<br>
 +
2.04124 (2, 27, 0)<br>
 +
-0.0197871<br>
 +
0.764218<br>
 +
0.00955272<br></p>
 +
</td>
 +
</tr>
 +
</table>
 +
 +
<div>1VOM-45.mrc.scoreの画像</div>
 +
<table>
 +
<tr>
 +
<td>[[画像:Outdata1-mrcImageOddBoxel.png]]</td>
 +
<td><p align="left">最小<br>
 +
最大<br>
 +
平均値<br>
 +
標準偏差<br>
 +
標準誤差<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="left">-1.83809 (22, 35, 0)<br>
 +
2.04124 (67, 51, 0)<br>
 +
-0.0561763<br>
 +
0.700513<br>
 +
0.00875641<br></p>
 +
</td>
 +
</tr>
 +
</table>
 +
 +
<div>1VOM-50.mrc.scoreの画像</div>
 +
<table>
 +
<tr>
 +
<td>[[画像:Outdata2-mrcImageOddBoxel.png]]</td>
 +
<td><p align="left">最小<br>
 +
最大<br>
 +
平均値<br>
 +
標準偏差<br>
 +
標準誤差<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="left">-1.28819 (32, 47, 0)<br>
 +
2.04124 (51, 2, 0)<br>
 +
0.0365122<br>
 +
0.771584<br>
 +
0.0096448<br></p>
 +
</td>
 +
</tr>
 +
</table>
 +
 +
<div>1VOM-55.mrc.scoreの画像</div>
 +
<table>
 +
<tr>
 +
<td>[[画像:Outdata3-mrcImageOddBoxel.png]]</td>
 +
<td><p align="left">最小<br>
 +
最大<br>
 +
平均値<br>
 +
標準偏差<br>
 +
標準誤差<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="left">-1.56769 (31, 48, 0)<br>
 +
2.04124 (37, 5, 0)<br>
 +
0.0387604<br>
 +
0.787144<br>
 +
0.0098393<br></p>
 +
</td>
 +
</tr>
 +
</table>
 +
 +
<div>1VOM-60.mrc.scoreの画像</div>
 +
<table>
 +
<tr>
 +
<td>[[画像:Outdata4-mrcImageOddBoxel.png]]</td>
 +
<td><p align="left">最小<br>
 +
最大<br>
 +
平均値<br>
 +
標準偏差<br>
 +
標準誤差<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="left">-1.53558 (41, 52, 0)<br>
 +
2.04124 (57, 22, 0)<br>
 +
7.09678e-07<br>
 +
0.748489<br>
 +
0.00935612<br></p>
 +
</td>
 +
</tr>
 +
</table>
 +
 +
<div>1VOM-65.mrc.scoreの画像</div>
 +
<table>
 +
<tr>
 +
<td>[[画像:Outdata-mrcImageOddBoxel.png]]</td>
 +
<td><p align="left">最小<br>
 +
最大<br>
 +
平均値<br>
 +
標準偏差<br>
 +
標準誤差<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="left">-1.62873 (22, 60, 0)<br>
 +
2.04124 (19, 3, 0)<br>
 +
0.000690029<br>
 +
0.82345<br>
 +
0.0102931<br></p>
 +
</td>
 +
</tr>
 +
</table>

2014年1月10日 (金) 02:59時点における版

mrcImageOddBoxelとはEosのコマンドである。


オプション一覧

メインオプション

オプション 必須項目/選択項目 説明 デフォルト
-I 必須 入力ファイルリスト: テキスト stdin
-Iter 選択 IterationFlag
-M 選択 分子の重さ (Iter選択時のみ) 1.0
-n 選択 分子の数(Iter選択時のみ) 1.0
-Boxel 選択 Final volume for iteration uning boxel unit 0
-d 選択 密度(Iter選択時のみ) 1.35
-I 選択 反転(Iter選択時のみ)
-Abs 選択 絶対値(Iter選択時のみ)
-Th 選択 閾値(Iter選択時のみ) 0.0
-c 選択 コンフィグファイル設定 NULL
-m 選択 モードを設定 0
-h 選択 ヘルプを表示 　

モードの詳細

モード 説明
0

入力ファイルのフォーマット

mrcファイル1
mrcファイル2
.
.
.


実行例

入力ファイルのデータ

/Eos/img/1VOM-40.mrc
/Eos/img/1VOM-45.mrc
/Eos/img/1VOM-50.mrc
/Eos/img/1VOM-55.mrc
/Eos/img/1VOM-60.mrc
/Eos/img/1VOM-65.mrc
1VOM-40.mrcの画像
1VOM-40.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

0 (0, 0, 0)

3077.54 (41, 49, 0)
126.786
387.323

4.84154
1VOM-45.mrcの画像
1VOM-45.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

0 (0, 0, 0)

3099.59 (17, 62, 0)
123.791
381.654

4.77068
1VOM-50.mrcの画像
1VOM-50.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

0 (0, 0, 0)

3095.88 (33, 57, 0)
143.393
399.986

4.99982
1VOM-55.mrcの画像
1VOM-55.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

0 (0, 0, 0)

3044.97 (51, 58, 0)
148.952
413.856

5.1732
1VOM-60.mrcの画像
1VOM-60.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

0 (0, 0, 0)

3026.91 (50, 47, 0)
129.875
386.428

4.83035
1VOM-65.mrcの画像
1VOM-65.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

0 (0, 0, 0)

3308.47 (26, 42, 0)
105.169
351.901

4.39877


オプション必須項目のみの場合

(入力ファイル).scoreが入力ファイル数毎に出力される。

1VOM-40.mrc.scoreの画像
Outdata-mrcImageOddBoxel.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

-1.42114 (29, 17, 0)

2.04124 (2, 27, 0)
-0.0197871
0.764218

0.00955272
1VOM-45.mrc.scoreの画像
Outdata1-mrcImageOddBoxel.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

-1.83809 (22, 35, 0)

2.04124 (67, 51, 0)
-0.0561763
0.700513

0.00875641
1VOM-50.mrc.scoreの画像
Outdata2-mrcImageOddBoxel.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

-1.28819 (32, 47, 0)

2.04124 (51, 2, 0)
0.0365122
0.771584

0.0096448
1VOM-55.mrc.scoreの画像
Outdata3-mrcImageOddBoxel.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

-1.56769 (31, 48, 0)

2.04124 (37, 5, 0)
0.0387604
0.787144

0.0098393
1VOM-60.mrc.scoreの画像
Outdata4-mrcImageOddBoxel.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

-1.53558 (41, 52, 0)

2.04124 (57, 22, 0)
7.09678e-07
0.748489

0.00935612
1VOM-65.mrc.scoreの画像
Outdata-mrcImageOddBoxel.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

-1.62873 (22, 60, 0)

2.04124 (19, 3, 0)
0.000690029
0.82345

0.0102931

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