「mrcImageSimilarityEstimate」の版間の差分

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===-ctfinfo のファイルのフォーマット===
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===-ref のフォーマット===
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2Dファイル1
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2Dファイル2
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.
 +
.
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</pre>
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===-ctfinfo のフォーマット===
 
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defocus Cs kV AmplitudeContrast
 
defocus Cs kV AmplitudeContrast
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== 実行例 ==
 
== 実行例 ==
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===[[:Media:Input-1VOM-N-Rot3-2D.fft|入力ファイル]]の画像===
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<table>
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<tr>
 +
<td><p align="Center">[[画像:Input-1VOM-N-Rot3-2D-FFT.png]]<br>
 +
[[mrcFFTExpression]](m=1)にて表示<br></p>
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</td>
 +
<td><p align="left">最小<br>
 +
最大<br>
 +
平均値<br>
 +
標準偏差<br>
 +
標準誤差<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="left">57.2237 (78, 32, 0)<br>
 +
520564 (0, 0, 0)<br>
 +
4898.64<br>
 +
12077.5<br>
 +
150.969<br></p>
 +
</td>
 +
</tr>
 +
</table>
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 +
 +
===参照ファイルのデータ===
 +
<pre>
 +
Input-1VOM-2D.mrc
 +
Input-1VOM-Rot-2D.mrc
 +
Input-1VOM-Rot1-2D.mrc
 +
Input-1VOM-Rot2-2D.mrc
 +
Input-1VOM-Rot3-2D.mrc
 +
Input-1VOM-Rot4-2D.mrc
 +
 +
</pre>
 +
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 +
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<div>[[:Media:Input-1VOM-2D.mrc|Input-1VOM-2D.mrc]]の画像</div>
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<table>
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<tr>
 +
<td>[[画像:Input-1VOM-2D.png]]</td>
 +
<td><p align="left">最小<br>
 +
最大<br>
 +
平均値<br>
 +
標準偏差<br>
 +
標準誤差<br></p>
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</td>
 +
<td><p align="left">0 (0, 0, 0)<br>
 +
49749.7 (27, 28, 0)<br>
 +
7212.9<br>
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8827.15<br>
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110.339<br></p>
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</td>
 +
</tr>
 +
</table>
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 +
<div>[[:Media:Input-1VOM-Rot-2D.mrc|Input-1VOM-Rot-2D.mrc]]の画像</div>
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<table>
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<tr>
 +
<td>[[画像:Input-1VOM-Rot-2D.png]]</td>
 +
<td><p align="left">最小<br>
 +
最大<br>
 +
平均値<br>
 +
標準偏差<br>
 +
標準誤差<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="left">-609.552 (68, 18, 0)<br>
 +
43476 (45, 47, 0)<br>
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6507.15<br>
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7376.01<br>
 +
92.2001<br></p>
 +
</td>
 +
</tr>
 +
</table>
 +
 +
<div>[[:Media:Input-1VOM-Rot1-2D.mrc|Input-1VOM-Rot1-2D.mrc]]の画像</div>
 +
<table>
 +
<tr>
 +
<td>[[画像:Input-1VOM-Rot1-2D.png]]</td>
 +
<td><p align="left">最小<br>
 +
最大<br>
 +
平均値<br>
 +
標準偏差<br>
 +
標準誤差<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="left">-2.31309e-06 (29, 7, 0)<br>
 +
49749.2 (52, 51, 0)<br>
 +
6572.32<br>
 +
8769.91<br>
 +
109.624<br></p>
 +
</td>
 +
</tr>
 +
</table>
 +
<br>
 +
 +
<div>[[:Media:Input-1VOM-Rot2-2D.mrc|Input-1VOM-Rot2-2D.mrc]]の画像</div>
 +
<table>
 +
<tr>
 +
<td>[[画像:Input-1VOM-Rot2-2D.png]]</td>
 +
<td><p align="left">最小<br>
 +
最大<br>
 +
平均値<br>
 +
標準偏差<br>
 +
標準誤差<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="left">0 (0, 0, 0)<br>
 +
49749.2 (28, 52, 0)<br>
 +
6572.32<br>
 +
8769.91<br>
 +
109.624<br></p>
 +
</td>
 +
</tr>
 +
</table>
 +
<br>
 +
 +
<div>[[:Media:Input-1VOM-Rot3-2D.mrc|Input-1VOM-Rot3-2D.mrc]]の画像</div>
 +
<table>
 +
<tr>
 +
<td>[[画像:Input-1VOM-Rot3-2D.png]]</td>
 +
<td><p align="left">最小<br>
 +
最大<br>
 +
平均値<br>
 +
標準偏差<br>
 +
標準誤差<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="left">-1.70846e-06 (56, 57, 0)<br>
 +
40287.6 (43, 43, 0)<br>
 +
6509.38<br>
 +
8494.21<br>
 +
106.178<br></p>
 +
</td>
 +
</tr>
 +
</table>
 +
<br>
 +
 +
<div>[[:Media:Input-1VOM-Rot4-2D.mrc|Input-1VOM-Rot4-2D.mrc]]の画像</div>
 +
<table>
 +
<tr>
 +
<td>[[画像:Input-1VOM-Rot4-2D.png]]</td>
 +
<td><p align="left">最小<br>
 +
最大<br>
 +
平均値<br>
 +
標準偏差<br>
 +
標準誤差<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="left">0 (0, 0, 0)<br>
 +
40287.6 (43, 36, 0)<br>
 +
6509.38<br>
 +
8494.21<br>
 +
106.178<br></p>
 +
</td>
 +
</tr>
 +
</table>
 +
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2014年2月13日 (木) 01:34時点における版

mrcImageSimilarityEstimateとはEosのコマンドである。


オプション一覧

メインオプション

オプション 必須項目/選択項目 説明 デフォルト
-i 必須 入力ファイル NULL
-o 選択 出力ファイル NULL
-oCor 選択 出力ファイル NULL
-ref 必須 参照ファイルリスト: ASCII stdin
-corfilename 選択 相関ファイルリスト: ASCII stdin
-cormode 選択 cormode 0
-ctfinfo 選択 CTF情報: ASCII NULL
-c 選択 コンフィグファイル設定 NULL
-m 選択 モードを設定 0
-h 選択 ヘルプを表示 　


モードの詳細

モード 説明
0


-cormode の詳細

モード 説明
0 Normal Correlation FxG*
1 Phase Correlation FxG*/ |FxG*|
2 Phase Correlation FxG*/sqrt(|FxG*|)
3 Normalized Normal Correlation FxG*/|F||G|)
16 (0, 0)=0


-ref のフォーマット

2Dファイル1
2Dファイル2
.
.


-ctfinfo のフォーマット

defocus Cs kV AmplitudeContrast


実行例

入力ファイルの画像

Input-1VOM-N-Rot3-2D-FFT.png
mrcFFTExpression(m=1)にて表示

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

57.2237 (78, 32, 0)

520564 (0, 0, 0)
4898.64
12077.5

150.969


参照ファイルのデータ

Input-1VOM-2D.mrc
Input-1VOM-Rot-2D.mrc
Input-1VOM-Rot1-2D.mrc
Input-1VOM-Rot2-2D.mrc
Input-1VOM-Rot3-2D.mrc
Input-1VOM-Rot4-2D.mrc


Input-1VOM-2D.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

0 (0, 0, 0)

49749.7 (27, 28, 0)
7212.9
8827.15

110.339
Input-1VOM-Rot-2D.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

-609.552 (68, 18, 0)

43476 (45, 47, 0)
6507.15
7376.01

92.2001
Input-1VOM-Rot1-2D.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

-2.31309e-06 (29, 7, 0)

49749.2 (52, 51, 0)
6572.32
8769.91

109.624


Input-1VOM-Rot2-2D.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

0 (0, 0, 0)

49749.2 (28, 52, 0)
6572.32
8769.91

109.624


Input-1VOM-Rot3-2D.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

-1.70846e-06 (56, 57, 0)

40287.6 (43, 43, 0)
6509.38
8494.21

106.178


Input-1VOM-Rot4-2D.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

0 (0, 0, 0)

40287.6 (43, 36, 0)
6509.38
8494.21

106.178



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