「mrcImageClusterAnalysis」の版間の差分

2014年5月7日 (水) 23:56時点における版

mrcImageClusterAnalysisとはEosのコマンドである。

オプション	必須項目/選択項目	説明	デフォルト
-I	必須	入力ファイル: ASCII	NULL
-o	選択	出力ファイル: ASCII	stdout
-O	選択	平均画像ファイルの出力: ファイル名: (入力ファイル名).avg
-N	選択	クラスターの数	1
-Min	選択	Minimum: Correlation: Conditions for ending	0.0
-Iter	選択	繰り返しを有効にする
-AR	選択	回転の刻み数	72
-ARange	選択	回転の範囲: (最小値, 最大値)	(0, 360)
-ARiter	選択	AutoRotationの繰り返し回数	2
-ARMethod	選択	AutoRotationCorrelationの計算方法	0
-M	選択	相関のモード	19
-pvm	選択	PVMでパラレル解析する
-pvmList	選択	入力: pvmリスト: ASCII	NULL
-Log	選択	出力: ログ:ASCII	stdout
-Log2	選択	出力: ログ(クラスターノードのみ): ASCII	NULL
-LogIn	選択	入力: 前回のログ: ASCII	NULL
-prevF	選択	入力: 前回のログファイル数	0
-c	選択	コンフィグファイル設定	NULL
-m	選択	クラスター間の距離の設定	2
-h	選択	ヘルプを表示

mrcImageAutoRotationCorrelation参照
-ARMethod: -Method, -M: -m に対応している。

モード	説明
0	相関値から算出
1	ユークリッド距離から算出
2	By Ward Method: -AR無し: ユークリッド距離, -AR有り: ユークリッド距離の2乗
3	By Ward Method using Linear Correlation : (1 - Correlation)/(1 + Correlation)
4	By Linear Correlation : (1 - Correlation)/(1 + Correlation)

Input-1VOM-N-2D.mrc
Input-1VOM-N-Rot-2D.mrc
Input-1VOM-N-Rot1-2D.mrc

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

-18651.7 (10, 1, 0)

52942.7 (24, 39, 0)
7214.87
10067.6

125.845

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

-11367.8 (51, 62, 0)

51939.8 (29, 26, 0)
6580.18
9247.8

115.597

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

-14918 (53, 17, 0)

58621.8 (30, 26, 0)
6579.96
9022.72

112.784

@@ 行132: / 行132: @@
 			</tr>
 		</table>
+<br>
+===-ARMethod, -M の詳細===
+<div>[[mrcImageAutoRotationCorrelation]]参照<br>
+-ARMethod: -Method, -M: -m に対応している。</div>
 <br>
@@ 行150: / 行155: @@
 			<tr>
 				<td>2</td>
-				<td>By Ward Method: 回転無し: ユークリッド距離, 回転有り: ユークリッド距離の2乗</td>
+				<td>By Ward Method: -AR無し: ユークリッド距離, -AR有り: ユークリッド距離の2乗</td>
 			</tr>
 			<tr>