mrcImageFourierShellCorrelation
提供: Eospedia
mrcImageFourierShellCorrelationとはmrcImage型の三次元像の表示するためのEosのコマンドである。
アルゴリズム
オプション一覧
メインオプション
| オプション | 必須項目/選択項目 | 説明 | デフォルト |
|---|---|---|---|
| -i1 | 選択 | 入力: mrcImage: 3D from one set | NULL |
| -i2 | 選択 | 入力: mrcImage: 3D from another set | NULL |
| -d | 選択 | 入力: Delta [A-1] (Default 1/(Nx*size of pixel) | 0 |
| -z | 選択 | 相関参照ファイルのzの位置(M=2のみ) | 0 |
| -L | 選択 | Low threshold (m=+2で使用) | 0 |
| -H | 選択 | High threshold (m=+2で使用) | 0 |
| -I1 | 選択 | InputDataFiles | stdin |
| -c | 選択 | コンフィグファイル設定 | NULL |
| -m | 選択 | モードを設定 | 0 |
| -h | 選択 | ヘルプを表示 |
-m の詳細
| モード | 説明 |
|---|---|
| 0 | Fourier Shell Correlation(FSC) |
| 1 | Fourier Shell Phase Residual(FSPR) |
| +2 | Correlation between L and H |
| +4 | Without equator |
-M の詳細
| モード | 説明 |
|---|---|
| 0 | Correlation between same size images |
| 1 | Correlation between 2D image and image extracted from 3D image |
| +2 | Correlation between 2D different size images. In1 is compared with center of In2 |
実行例
$ mrcImageFourierCorrealation -i1 aa1 -i2 aa2 -d 0.005 > aa.FSC
