pdbMove

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移動: 案内検索

pdbMoveとはPDBファイルの原子モデルを平行移動するためのEosコマンドである。

オプション一覧

メインオプション

オプション 必須項目/選択項目 説明 デフォルト
-i 必須 入力ファイル:PDB NULL
-o 必須 出力ファイル:PDB NULL
-x 選択 x軸方向の移動量 0
-y 選択 y軸方向の移動量 0
-z 選択 z軸方向の移動量 0

モードの詳細

モード 説明
0


実行例

ヘルプ実行

$ pdbMove  -h
Usage: /Applications/Eos.app/Eos/bin/X86MAC64/pdbMove
Options:
    [-i[nput]            In                  (NULL      )] :Essential :InputDataFile
    [-o[utput]           Out                 (NULL      )] :Essential :OutputDataFile
    [-x                  X                   (0.0       )] :Optional  :Move X[A]
    [-y                  Y                   (0.0       )] :Optional  :Move Y[A]
    [-z                  Z                   (0.0       )] :Optional  :Move Z[A]
    [-c[onfig]           configFile          (NULL      )] :Optional  :ConfigurationFile
    [-m[ode]             mode                (0         )] :Optional  :Mode

Additional Usage -----

------入力ファイルの詳細------

121p.pdb-pdbMove.png

------オプション必須項目のみの場合の出力結果------

121p-pdbMove.png
オプション-x,-y,-zのデフォルトは0.0なので、何も変わらない

------移動させる幅を設定(オプション -x,-y,-z)------

移動の幅をすべて1に設定

121p.1xyz-pdbMove.png

移動の幅をx=-6.053012e+00,y=-2.519590e+01,z=-1.189075e+01に設定

121p.-xyz-pdbMove.png