mrcImageInfo

mrcImageInfoとはmrcファイルの画像の情報を表示するためのEosのコマンドである。

オプション一覧

メインオプション

オプション	必須項目/選択項目	説明	デフォルト
-i	必須	入力ファイル設定	NULL
-o	選択	出力ファイル設定	stdout(設定しなければ標準出力）
-I[nfo]	選択	このオプションが設定された場合には、画像の一般的な統計情報が出力される
-X	選択	X Section at y=X(value)	0.0
-Y	選択	Y Section at y=Y(value)	0.0
-x	選択	x Projection[OutPut ASCII FILE]
-y	選択	y Projection[OutPut ASCII FILE]
-H	選択	Histgram: Class Number: Normalize	256
-H2	選択	Histgram2: Class Width: Integer: Normalize	1
-H3	選択	Histgram: Class Number: Count	256
-H4	選択	Histgram2: Class Width: Integer: Count	1
-H5	選択	Histgram5: Class Number: Count	1
-H6	選択	Histgram6: Class Width: Integer: Count	1
-Low	選択	Low : thres	1
-High	選択	High: thres	1
-rmax	選択	rmax [A]	250
-c	選択		NULL
-m	選択		0
-h	選択

モードの詳細

モード	説明
0	mean of all density
1	mean of sphere surface density at rmax
2	mean of cylinder surface density at rmax
3	mean of edge pixels
4	mean of Centre
5	mean of Sparse
6	mean of 2DEdge
7	RMS of all pixels

実行例

入力ファイルの画像

-Iで実行

Min:               0 (41, 10, 0)	最小
Max:             255 (42, 36, 0)	最大
Mean:         111.211		平均値
SD:          32.7239			標準偏差
SE:         0.409049			標準誤差
Sum:          711751