mrcImagePrint

mrcImagePrintとはEosのコマンドである。

オプション一覧

メインオプション

オプション	必須項目/選択項目	説明	デフォルト
-i	必須	入力ファイル: mrcImage	NULL
-o	選択	出力ファイル: psファイル	stdout
-H	選択	High Threshold	0.0
-L	選択	Low Threshold	1.0
-Section	選択	[z|x|y]Section	z
-x	選択	x section:(xMin, xMax)	(0, 0)
-y	選択	y section:(yMin, yMax)	(0, 0)
-z	選択	z section:(zMin, zMax)	(0, 0)
-S	選択	Scale(Centre is Bottom Left): -S 1 := 1 mm/pixel	1.0
-AS	選択	Scale(Centre is Bottom Left): -AS 1 := 1 mm/A (Real) or 1 mm/A-1 (Fourier Space)	1.0
-E	選択	Enlargement(image center is center)	1.0
-center	選択	Center of a printed image(in case of FT or N.x/2.0 in case of Image):(cx, cy)	(0.0, 0.0)
-C	選択	ContourLevel	1.0
-I	選択	Black is High Density
-A	選択	HighThres=Mean-SD, LowThres=Mean+SD
-AC	選択	Auto Contour(thresHigh <-> mean)	10
-PC	選択	Peak Contour(thresHigh <-> (mean+thresHigh)/2	10
-AC2	選択	Auto Contour2(thresHigh <-> thresLow)	10
-Y	選択	Y-axis expanding	1
-RGB	選択	Contour Color Mode: RGB:(Red, Green, Blue)	(0, 0, 0)
-RGBGradient	選択	Contour Color GradientMode: RGB:(RedFirst, GreenFirst, BlueFirst, RedLast, GreenLast, BlueLast)	(0, 0, 0, 0, 0, 0)
-HSB	選択	Contour Color Mode: HSB:(Hue, Saturation, Brightness)	(0, 0, 0)
-HSBGradient	選択	Contour Color GradientMode: HSB:(HueFirst, SaturationFirst, BrightnessFirst, HueLast, SaturationLast, BrightnessLast)	(0, 0, 0, 0, 0, 0)
-LineColourRGB	選択	Contour Color Mode: RGB:(LineRed, LineGreen, LineBlue)	(0, 0, 0)
-LineColourRGBGradient	選択	Contour Color GradientMode: RGB:(LineRedFirst, LineGreenFirst, LineBlueFirst, LineRedLast, LineGreenLast, LineBlueLast)	(0, 0, 0, 0, 0, 0)
-LineColourHSB	選択	Contour Color Mode: HSB:(LineHue, LineSaturation, LineBrightness)	(0, 0, 0)
-LineColourHSBGradient	選択	Contour Color GradientMode: HSB:(LineHueFirst, LineSaturationFirst, LineBrightnessFirst, LineHueLast, LineSaturationLast, LineBrightnessLast)	(0, 0, 0, 0, 0, 0)
-LineChange	選択	Contour Color Change	0.1
-LineWidthStart	選択	Contour Line Width Start	0.1
-LineWidthStep	選択	Contour Line Width Step	0.05
-ReverseOrder	選択	Reverse Print Order
-Untwist	選択	Untwist Angle [degree/A], example: (-13,28) = 0.4709576	0.0
-UpsideDown	選択	Upside Down
-Centre	選択	Image Centre is at the centre of paper.
-CircleRadius	選択	Radius of circles in the case of imageCircles	0.5
-c	選択	コンフィグファイル設定	NULL
-m	選択	モードを設定	49
-h	選択	ヘルプを表示

				-C  option is stronger than -AC and -PC
				-PC option is stronger than -AC
					-AC: (i+1)*(max-maen)  /(AC+1) + mean 
					-PC: (i  )*(max+mean)/2)/AC     + (max+mean)/2
				-AS option is stronger than -S option
				The default value of -AS option is ignored.
				The default value of -S option is used.
				Both options are applied to y-axis.

モードの詳細

モード	説明
1	ImageDensity
2	Contour(DiffrentLineWidth)
4	Contour(SameLineWidth)
8	BlackCircles
16	Scale
32	Centre Mark
16777216	Amplitude by AsciiFile
33554432	Log of Amplitude by AsciiFile
67108864	Phase by AsciiFile

実行例

入力ファイルの画像

最小 最大 平均値 標準偏差 標準誤差

0 (0, 0, 0) 5 (34, 41, 36) 0.00471829 0.0933498 0.000162869

オプション必須項目のみの場合

オプション　-H

H=1で実行

オプション　-L

L=128で実行