mrcImageVarianceMap
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mrcImageVarianceMapとはEosのコマンドである。
目次
オプション一覧
メインオプション
| オプション | 必須項目/選択項目 | 説明 | デフォルト |
|---|---|---|---|
| -i | 選択 | 入力リスト | NULL |
| -I | 選択 | 入力 (In2 In2Var In2N)) | NULL NULL 0 |
| -Nor | 選択 | 入力: A + B*x: NormalizingParameter (NorA NorB) | 0.0 1.0 |
| -r | 選択 | 参照: 入力リスト | NULL |
| -R | 選択 | 参照: 入力 (Ref2 Ref2Var Ref2N ) | NULL NULL 0 |
| -NorR | 選択 | 入力: A + B*x: NormalizingParameter for Ref (RNorARef RNorBRef) | 0.0 1.0 |
| -IR | 選択 | 入力参照: (InAndRef2 InAndRef2Var InAndRef2N) | NULL NULL 0 |
| -o | 選択 | 出力: 分散確率 | NULL |
| -v | 選択 | 出力: 分散マップ | NULL |
| -c | 選択 | コンフィグファイル設定 | NULL |
| -m | 選択 | モードを設定 | 0 |
| -h | 選択 | ヘルプを表示 |
モードの詳細
| モード | 説明 |
|---|---|
| 0 |
-i, -rのフォーマット
mrcファイル1 mrcファイル2 . .
分散マップ
VarianceMap := VarinceOfAll/((VarianceOfDataSet1*n1+VarianceOfDataSet2*n2)/n1+n2)
VarinceOfAll: variance of all data from Set1 and Set2
VarinceOfDataSet1: variance of all data from Set1
VarinceOfDataSet2: variance of all data from Set2
Kai-distribution: Kai^2 = SumOf (Xi - AvgOfXi)^2/sigma^2
= s^2*(n-1)/sigma^2 : degree of freedom n-1
when variables Xi are due to N(u, sigma^2)
Kai-distribution: Kai^2 = Kai1^2 + Kai2^2 : degree of freedom m1 + m2
F-distribution: F = (Kai1^2/k1)/(Kai2^2/k2) : degree of freedom : (k1, k2)
(s1^2/sigma1^2)/(s2^2/sigma2^2) : degree of freedom : (k1-1, k2-1)
If sigma1 == sigma2, then
s1^2/s2^2 (Variance Ratio) : degree of freedom : (k1-1, k2-1)
実行例
入力ファイルのデータ
/Eos/img/Input-ThickFilaments0-N-30.mrc /Eos/img/Input-ThickFilaments0-N-40.mrc /Eos/img/Input-ThickFilaments0-N-50.mrc
 |
最小 最大 |
-0.242386 (63, 38, 0) 1.18538 (46, 26, 0) |
 |
最小 最大 |
-0.284772 (20, 5, 0) 1.39313 (24, 45, 0) |
 |
最小 最大 |
-0.244921 (31, 53, 0) 1.10864 (41, 21, 0) |
参照ファイルのデータ
/Eos/img/Input-ThickFilaments0-30.mrc /Eos/img/Input-ThickFilaments0-40.mrc /Eos/img/Input-ThickFilaments0-50.mrc
 |
最小 最大 |
0 (0, 0, 0) 1.04379 (42, 46, 0) |
 |
最小 最大 |
0 (0, 0, 0) 1.34347 (44, 23, 0) |
 |
最小 最大 |
0 (0, 0, 0) 1 (32, 19, 0) |
