pdbAtomSection
提供: Eospedia
pdbAtomSectionとは原子モデルのセクション(断面)をとりだしてpsファイルで出力するEosのコマンドである。
オプション一覧
メインオプション
| オプション | 必須項目/選択項目 | 説明 | デフォルト |
|---|---|---|---|
| -i | 必須 | 入力ファイル: PDB | NULL |
| -if | 選択 | 入力ファイル: FlagsFile | NULL |
| -o | 必須 | 出力ファイル: psファイル | NULL |
| -dist | 選択 | Distance of Sections | 2.5 |
| -zmin | 選択 | zの最小値 | 0.0 |
| -zmax | 選択 | zの最大値 | 90.0 |
| -fm | 選択 | flag mode | 13 |
| -r | 選択 | 半径 | 1.0 |
| -clw | 選択 | 円周の幅 | 0.1 |
| -plw | 選択 | ペプチド結合の幅 | 0.1 |
| -fontsize | 選択 | font size | 2.0 |
| -AS | 選択 | absolute scale of PS file (-AS 1 := 1 mm/A) | 1.0 |
| -shiftx | 選択 | pdb Shift x [A] | 0.0 |
| -shifty | 選択 | pdb Shift y [A] | 0.0 |
| -shiftz | 選択 | pdb Shift z [A] | 0.0 |
| -c | 選択 | コンフィグファイル設定 | NULL |
| -m | 選択 | モードを設定 | 0 |
| -h | 選択 | ヘルプを表示 |
モードの詳細
| モード | 説明 |
|---|---|
| 0 |
実行例
入力ファイルの画像
![]() |
重心 最大半径 |
6.053012e+00 2.519590e+01 1.189075e+01 3.286664e+01 |
オプション必須項目のみの場合
![]() |
|---|
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