mrcImageNormalizing

mrcImageNormalizingとは画像の値の正規化を行うEosのコマンドである。

オプション一覧

メインオプション

オプション	必須項目/選択項目	説明	デフォルト
-i	必須	入力ファイル: mrcImage	NULL
-o	必須	出力ファイル: mrcImage	NULL
-A	選択	A	1.0
-B	選択	B	0.0
-ContourMin	選択	輪郭の最小値	0.0
-ContourMax	選択	輪郭の最大値	1.0
-ContourSolvent	選択	溶媒の輪郭	0.0
-c	選択	コンフィグファイル設定	NULL
-m	選択	モードを設定	0
-h	選択	ヘルプを表示

モードの詳細

モード	説明
0	Double Exponential: Solvent and Object Fitting histgram to double exponentials as Solvent and Object data = A*(data-MeanOfSolvent)/(MeanOfObject-MeanOfSolvent) + B
1	Min-Max: Background and Object data = A*(data-Min)/(Max-Min) + B
2	Contour data = A*(data-ContourMin)/(ContourMax-ContourMin) + B
3	Contour and Solvent if data < ContourSolvent, data = ContourSolvent. After this, calculate the below. data = A*(data-ContourMin)/(ContourMax-ContourMin) + B
4	直接演算する data = A*data + B
5	ガウシアンとして密度を仮定する data = A*Normalized(data) + B Normalized(data): 平均値: 0, 標準偏差: 1としたもの

実行例

入力ファイルの画像

最小 最大 平均値 標準偏差 標準誤差

-18651.7 (10, 1, 0) 52942.7 (24, 39, 0) 7214.87 10067.6 125.845

オプション必須項目のみの場合

最小 最大 平均値 標準偏差 標準誤差

-0.00221962 (10, 1, 0) 0.00448009 (24, 39, 0) 0.000200939 0.000942109 1.17764e-05

オプション　-A, -B

A=1000, B=3で実行

最小 最大 平均値 標準偏差 標準誤差

0.780381 (10, 1, 0) 7.48009 (24, 39, 0) 3.20094 0.942109 0.0117764

オプション -m

m=5で実行

A=1, B=0 のとき

最小 最大 平均値 標準偏差 標準誤差

-2.5693 (10, 1, 0) 4.5421 (24, 39, 0) -3.70619e-12 1 0.0125

平均値が0、標準偏差が1になるように正規化されている。

A=2, B=3 のとき

最小 最大 平均値 標準偏差 標準誤差

-5.70789 (10, 1, 0) 15.6263 (24, 39, 0) 2 3 0.0375

平均値が2、標準偏差が3になるように正規化されている。