mrcImageNormalizing

mrcImageNormalizingとは画像の値の正規化を行うEosのコマンドである。

オプション一覧

メインオプション

オプション	必須項目/選択項目	説明	デフォルト
-i	必須	入力ファイル: mrcImage	NULL
-o	必須	出力ファイル: mrcImage	NULL
-A	選択	A	1.0
-B	選択	B	0.0
-ContourMin	選択	輪郭の最小値	0.0
-ContourMax	選択	輪郭の最大値	1.0
-ContourSolvent	選択	溶媒の輪郭	0.0
-c	選択	コンフィグファイル設定	NULL
-m	選択	モードを設定	0
-h	選択	ヘルプを表示

モードの詳細

モード	説明
0	Double Exponential: Solvent and Object Fitting histgram to double exponentials as Solvent and Object data = A*(data-MeanOfSolvent)/(MeanOfObject-MeanOfSolvent) + B
1	Min-Max: Background and Object data = A*(data-Min)/(Max-Min) + B
2	Contour data = A*(data-ContourMin)/(ContourMax-ContourMin) + B
3	Contour and Solvent if data < ContourSolvent, data = ContourSolvent. After this, calculate the below. data = A*(data-ContourMin)/(ContourMax-ContourMin) + B
4	No Estimation data = A*data + B

実行例

入力ファイルの画像

最小 最大 平均値 標準偏差 標準誤差

0 60.6 26.9463 22.1197 0.264381

オプション必須項目のみの場合

最小 最大 平均値 標準偏差 標準誤差

0.948122 1.00694 0.974274 0.0214681 0.000256593

オプション　-A, -B

A=100, B=-94で実行

最小 最大 平均値 標準偏差 標準誤差

0.812155 6.69363 3.4274 2.14681 0.0256593

オプション　-m

m=1で実行

ファイル:Outdata-m1-mrcImageNormalizing.png

最小 最大 平均値 標準偏差 標準誤差