mrcImage3DPad

mrcImage3DPadとはパディング（3D）を行うEosのコマンドである。

オプション一覧

メインオプション

オプション	必須項目/選択項目	説明	デフォルト
-i	必須	入力ファイル: mrcImage	NULL
-o	必須	出力ファイル: mrcImage	NULL
-r	選択	Threshold radius of signal.Default is Nx.	0
-w	選択	Width of slope. For mode 1.	1
-v	選択	Value of out of threshold.	0
-Nx	選択	Number of x.Default is inputfile.	0
-Ny	選択	Number of y.Default is inputfile.	0
-Nz	選択	Number of z.Default is inputfile.	0
-Floating	選択	Floating
-c	選択	コンフィグファイル設定	NULL
-m	選択	モードを設定	0
-M	選択	モード2を設定	0
-h	選択	ヘルプを表示

-m の詳細

モード	説明
0	Default: Out of threshold is avrage of threshold plain.
1	Mulplying cos function. Default: Out of threshold is avrage of threshold plain.

-M の詳細

モード	説明
0	For filaments. R is calculated from its axis.
1	For particles. R is calculated from its center.

実行例

入力ファイルの画像

最小 最大 平均値 標準偏差 標準誤差

0 (0, 0, 0) 2 (35, 35, 5) 0.384947 0.605556 0.00086508

オプション必須項目のみの場合

最小 最大 平均値 標準偏差 標準誤差

0 (0, 0, 0) 2 (35, 35, 5) 0.384947 0.605556 0.00086508

デフォルト設定の場合、画像に変化はない

オプション　-r

r=20で実行

最小 最大 平均値 標準偏差 標準誤差

0 (31, 15, 0) 2 (35, 35, 5) 0.799661 0.290065 0.000414379

オプション　-Nx, -Ny, -Nz

Nx=100, Ny=100, Nz=100で実行

最小 最大 平均値 標準偏差 標準誤差

0 (0, 0, 0) 2 (50, 50, 5) 0.188624 0.465525 0.000465525

オプション　-v

v=2, Nx=100, Ny=100, Nz=100で実行

最小 最大 平均値 標準偏差 標準誤差

0 (15, 15, 0) 2 (0, 0, 0) 1.20862 0.911877 0.000911877

オプション　-Floating

Floating, v=2, Nx=100, Ny=100, Nz=100で実行

最小 最大 平均値 標準偏差 標準誤差

-2 (15, 15, 0) 0 (0, 0, 0) -0.791376 0.911877 0.000911877

オプション　-m

m=1, r=20で実行

その他のオプションなし

最小 最大 平均値 標準偏差 標準誤差

0 (31, 16, 0) 2 (35, 35, 5) 0.763544 0.291466 0.00041638

w=5で実行

最小 最大 平均値 標準偏差 標準誤差

0 (31, 20, 0) 2 (35, 35, 5) 0.524018 0.346496 0.000494995

オプション　-M

M=1, r=30で実行

最小 最大 平均値 標準偏差 標準誤差

0 (14, 31, 28) 2 (15, 31, 27) 0.845077 0.245951 0.000351358