pdbCrystalCreate

提供: Eospedia
2014年1月28日 (火) 08:23時点におけるKinoshita (トーク | 投稿記録)による版

移動: 案内検索

pdbCrystalCreateとはEosコマンドである。


オプション一覧

メインオプション

オプション 必須項目/選択項目 説明 デフォルト
-i 必須 入力ファイル: PDB NULL
-I 必須 入力ファイル: [Crystal Information] NULL
-o 必須 出力ファイル: PDB NULL
-c 選択 コンフィグファイル設定 NULL
-m 選択 モードを設定 0
-h 選択 ヘルプを表示  

モードの詳細

モード 説明
0

-I のフォーマット

aAxis       %15.6g %15.6g %15.6g
bAxis       %15.6g %15.6g %15.6g
cAxis       %15.6g %15.6g %15.6g
CellLength  %15.6g %15.6g %15.6g
Origin      %15.6g %15.6g %15.6g
N           %15d %15d %15d
StartN      %15d %15d %15d
SpaceGroup  %15d
HelixInfo   %10d %10d %10d
パラメータ設定が重要

CellLengthとAxisは依存している。
axisは単位ベクトルでなければならない。
HelixInfo: t u n

CrystalSpaceGroup: 0: P1, 1: らせん対称

実行例