mrcImageModelSubfilamentsCreate

mrcImageModelSubfilamentsCreateとはフィラメント画像を作るEosのコマンドである。

オプション一覧

メインオプション

オプション	必須項目/選択項目	説明	デフォルト
-i	必須	入力ファイル: mrcImage	NULL
-o	必須	出力ファイル: mrcImage	NULL
-nx	選択	Real length = nx * lx	71
-ny	選択	Real length = ny * ly	71
-nz	選択	Real length = nz * lz	100
-lx	選択	ピクセルサイズ[Angstrom]	5.0
-ly	選択	ピクセルサイズ[Angstrom]	5.0
-lz	選択	ピクセルサイズ[Angstrom]	5.0
-position	選択	subfilaments position from center [A]	70
-n	選択	n-helix	3
-dphi	選択	回転角度 [degree]	1.395348837
-sphi	選択	start angle [degree]	0
-c	選択	コンフィグファイル設定	NULL
-m	選択	モードを設定	0
-h	選択	ヘルプを表示

※nx, nyは奇数でなければならない

モードの詳細

モード	説明
0

実行例

入力ファイルの画像

最小 最大 平均値 標準偏差 標準誤差

0 (0, 0, 0) 2.09707 (58, 41, 0) 0.00306044 0.0749793 0.00108666

オプション必須項目のみの場合

xy平面

yz平面

最小 最大 平均値 標準偏差 標準誤差

0 (0, 0, 0) 1.98112 (31, 52, 0) 0.00741447 0.0893007 0.000125776

オプション　-nx, -ny, -nz

nx=99, ny=99, nz=99で実行

xy平面

yz平面

最小 最大 平均値 標準偏差 標準誤差

0 (0, 0, 0) 2.09707 (87, 56, 0) 0.00445187 0.0691579 5.70376e-05

オプション　-lx, -ly, lz

lx=8, ly=8, lz=8で実行

xy平面

yz平面

最小 最大 平均値 標準偏差 標準誤差

0 (0, 0, 0) 2.02889 (41, 2, 20) 0.00867218 0.0969264 0.000136516

オプション　-position

position=35で実行

xy平面

yz平面

最小 最大 平均値 標準偏差 標準誤差

0 (0, 0, 0) 2.09707 (66, 42, 0) 0.00869178 0.0977788 0.000137717

オプション　-n

n=6で実行

xy平面

yz平面

最小 最大 平均値 標準偏差 標準誤差

0 (0, 0, 0) 1.98112 (31, 52, 0) 0.0148289 0.125854 0.000177259

オプション　-dphi

dphi=2で実行

xy平面

yz平面

最小 最大 平均値 標準偏差 標準誤差

0 (0, 0, 0) 1.98112 (31, 52, 0) 0.00741588 0.0894188 0.000125942

オプション　-sphi

sphi=90で実行

xy平面

yz平面

最小 最大 平均値 標準偏差 標準誤差

0 (0, 0, 0) 1.98112 (18, 31, 0) 0.00741446 0.0893007 0.000125776