mrcImagePrintとはEosのコマンドである。
目次
- 1 オプション一覧
- 2 実行例
- 2.1 入力ファイルの画像
- 2.2 オプション必須項目のみの場合
- 2.3 オプション -S
- 2.4 オプション -H
- 2.5 オプション -L
- 2.6 オプション -Section
- 2.7 オプション -x, -y, -z
- 2.8 オプション -AS
- 2.9 オプション -center
- 2.10 オプション -I
- 2.11 オプション -A
- 2.12 オプション -Y
- 2.13 オプション -ReverseOrder
- 2.14 オプション -untwist
- 2.15 オプション -UpsideDown
- 2.16 オプション -Centre
- 2.17 オプション -m
- 2.17.1 m=1, S=2で実行
- 2.17.2 m=17, S=2で実行
- 2.17.3 m=2, C=(1, 2, 3), S=2で実行
- 2.17.4 m=6, C=(1, 2, 3), S=2で実行
- 2.17.5 m=10, C=(1, 2, 3), S=2で実行
- 2.17.6 m=34, C=(1, 2, 3), S=2で実行
- 2.17.7 m=62, C=(1, 2, 3), S=2で実行
- 2.18 オプション -AC
- 2.19 オプション -PC
- 2.20 オプション -AC2
- 2.21 オプション -CircleRadius
オプション一覧
メインオプション
オプション |
必須項目/選択項目 |
説明 |
デフォルト |
-i |
必須 |
入力ファイル: mrcImage |
NULL |
-o |
選択 |
出力ファイル: psファイル |
stdout |
-H |
選択 |
High Threshold |
0.0 |
-L |
選択 |
Low Threshold |
1.0 |
-Section |
選択 |
[z|x|y]Section |
z |
-x |
選択 |
x section:(xMin, xMax) |
(0, 0) |
-y |
選択 |
y section:(yMin, yMax) |
(0, 0) |
-z |
選択 |
z section:(zMin, zMax) |
(0, 0) |
-S |
選択 |
Scale(Centre is Bottom Left): -S 1 := 1 mm/pixel |
1.0 |
-AS |
選択 |
Scale(Centre is Bottom Left): -AS 1 := 1 mm/A (Real) or 1 mm/A-1 (Fourier Space) |
1.0 |
-E |
選択 |
Enlargement(image center is center) |
1.0 |
-center |
選択 |
Center of a printed image(in case of FT or N.x/2.0 in case of Image):(cx, cy) |
(0.0, 0.0) |
-C |
選択 |
可変入力: コンターレベル |
1.0 ... |
-I |
選択 |
反転 |
|
-A |
選択 |
HighThres=Mean-SD, LowThres=Mean+SD |
|
-AC |
選択 |
Auto Contour(thresHigh <-> mean) |
10 |
-PC |
選択 |
Peak Contour(thresHigh <-> (mean+thresHigh)/2 |
10 |
-AC2 |
選択 |
Auto Contour2(thresHigh <-> thresLow) |
10 |
-Y |
選択 |
y軸の拡大率 |
1 |
-RGB |
選択 |
Contour Color Mode: RGB:(Red, Green, Blue) |
(0, 0, 0) |
-RGBGradient |
選択 |
Contour Color GradientMode: RGB:(RedFirst, GreenFirst, BlueFirst, RedLast, GreenLast, BlueLast) |
(0, 0, 0, 0, 0, 0) |
-HSB |
選択 |
Contour Color Mode: HSB:(Hue, Saturation, Brightness) |
(0, 0, 0) |
-HSBGradient |
選択 |
Contour Color GradientMode: HSB:(HueFirst, SaturationFirst, BrightnessFirst, HueLast, SaturationLast, BrightnessLast) |
(0, 0, 0, 0, 0, 0) |
-LineColourRGB |
選択 |
Contour Color Mode: RGB:(LineRed, LineGreen, LineBlue) |
(0, 0, 0) |
-LineColourRGBGradient |
選択 |
Contour Color GradientMode: RGB:(LineRedFirst, LineGreenFirst, LineBlueFirst, LineRedLast, LineGreenLast, LineBlueLast) |
(0, 0, 0, 0, 0, 0) |
-LineColourHSB |
選択 |
Contour Color Mode: HSB:(LineHue, LineSaturation, LineBrightness) |
(0, 0, 0) |
-LineColourHSBGradient |
選択 |
Contour Color GradientMode: HSB:(LineHueFirst, LineSaturationFirst, LineBrightnessFirst, LineHueLast, LineSaturationLast, LineBrightnessLast) |
(0, 0, 0, 0, 0, 0) |
-LineChange |
選択 |
Contour Color Change |
0.1 |
-LineWidthStart |
選択 |
Contour Line Width Start |
0.1 |
-LineWidthStep |
選択 |
Contour Line Width Step |
0.05 |
-ReverseOrder |
選択 |
ページを逆順にする |
|
-Untwist |
選択 |
Untwist Angle [degree/A], example: (-13,28) = 0.4709576 |
0.0 |
-UpsideDown |
選択 |
Upside Down |
|
-Centre |
選択 |
画像の中心をページの中心に合わせる |
|
-CircleRadius |
選択 |
Radius of circles in the case of imageCircles |
0.5 |
-c |
選択 |
コンフィグファイル設定 |
NULL |
-m |
選択 |
モードを設定 |
49 |
-h |
選択 |
ヘルプを表示 |
|
-C option is stronger than -AC and -PC
-PC option is stronger than -AC
-AC: (i+1)*(max-maen) /(AC+1) + mean
-PC: (i )*(max+mean)/2)/AC + (max+mean)/2
-AS option is stronger than -S option
The default value of -AS option is ignored.
The default value of -S option is used.
Both options are applied to y-axis.
モードの詳細
モード |
説明 |
1 |
ImageDensity |
2 |
Contour(DiffrentLineWidth) |
4 |
Contour(SameLineWidth) |
8 |
BlackCircles |
16 |
目盛りの表示 |
32 |
中心点の表示 |
16777216 |
Amplitude by AsciiFile |
33554432 |
Log of Amplitude by AsciiFile |
67108864 |
Phase by AsciiFile |
実行例
入力ファイルの画像
 |
最小
最大
平均値
標準偏差
標準誤差
|
0 (0, 0, 0)
5 (34, 41, 36)
0.00471829
0.0933498
0.000162869
|
オプション必須項目のみの場合
 |
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 |
サムネイル |
オプション -S
S=2で実行
 |
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 |
サムネイル |
オプション -H
H=1, S=2で実行
 |
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オプション -L
L=1.5, S=2で実行
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オプション -Section
Section=x, S=2で実行
 |
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オプション -x, -y, -z
x=(10, 50), y=(0, 40), z=(30, 50), S=2で実行
 |
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オプション -AS
AS=1で実行
 |
39/69ページ |
オプション -center
center=(30, 30), S=2で実行
 |
39/69ページ |
オプション -I
I, S=2で実行
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39/69ページ |
オプション -A
A, S=2で実行
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39/69ページ |
オプション -Y
Y=2で実行
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オプション -ReverseOrder
ReverseOrder, S=2で実行
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 |
サムネイル |
オプション -untwist
untwist=0.1, S=2で実行
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 |
サムネイル |
オプション -UpsideDown
UpsideDown, S=2で実行
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 |
サムネイル |
オプション -Centre
Centre, S=2で実行
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 |
サムネイル |
オプション -m
m=1, S=2で実行
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39/69ページ |
m=17, S=2で実行
 |
39/69ページ |
m=2, C=(1, 2, 3), S=2で実行
 |
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m=6, C=(1, 2, 3), S=2で実行
 |
39/69ページ |
m=10, C=(1, 2, 3), S=2で実行
 |
39/69ページ |
m=34, C=(1, 2, 3), S=2で実行
 |
39/69ページ |
m=62, C=(1, 2, 3), S=2で実行
 |
39/69ページ |
オプション -AC
AC=3, m=62, S=2で実行
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39/69ページ |
オプション -PC
PC=1, m=62, S=2で実行
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オプション -AC2
AC2=4, m=62, S=2で実行
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オプション -CircleRadius
CircleRadius=0.75, m=62, C=(1, 2, 3), S=2で実行
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