mrcImageVolumeCalc
提供: Eospedia
mrcImageVolumeCalcとはEosのコマンドである。
目次
オプション一覧
| オプション | 必須項目/選択項目 | 説明 | デフォルト |
|---|---|---|---|
| -i | 必須 | 入力ファイル設定: mrcImage | NULL |
| -o | 選択 | 出力ファイル設定: ASCII | stdout |
| -n | 選択 | 分子の数 | 1.0 |
| -M | 選択 | 分子量 | 1.0 |
| -d | 選択 | 密度 | 1.35 |
| -D | 選択 | ピクセル幅を設定 | 5.0 |
| -R | 選択 | (MinVol, MaxVol, DelVol) | (0.0, 200.0, 10.0) |
| -I | 選択 | 反転 | 0 |
| -format | 選択 | コンターレベル毎に出力するフォーマット | ContourLevel(%3g): %g %lu |
| -c | 選択 | コンフィグファイル設定 | NULL |
| -m | 選択 | モードを設定 | 0 |
| -h | 選択 | ヘルプを表示 |
-formatの詳細
%gなどを使用することにより、最大5つの情報が出力できる。
出力順
出力順
1st double # ContourLevel[%] 2nd double # Contour[value] 3rd int # VolumeNumber [fromBlack] 4th int # VolumeNumber [fromWhite] ; Default : omiited 5th double # Volume[A^3] ; Default : omitted
モードの詳細
| モード | 説明 |
|---|---|
| 0 |
実行例
------入力ファイルの画像------
入力画像は３Ｄ画像でなければならない
 |
最小 最大 |
0 2 |
------出力結果------
今回の入力ファイルのH-rasの分子量などを設定する
n=1,M=21000,d=1.35,D=1.700となる
実行すると以下のデータが得られる
------オプション -I------
上記と同じ条件でオプション-Iを使用すると以下のようなデータが得られる
