「mrcImage3DPad」の版間の差分
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<td>-m</td> | <td>-m</td> | ||
<td>選択</td> | <td>選択</td> | ||
− | <td> | + | <td>パディング値の算出方法を設定</td> |
<td>0</td> | <td>0</td> | ||
</tr> | </tr> | ||
行99: | 行99: | ||
<tr> | <tr> | ||
<td>0</td> | <td>0</td> | ||
− | <td> | + | <td>平均値でパディングする</td> |
</tr> | </tr> | ||
<tr> | <tr> | ||
行106: | 行106: | ||
</tr> | </tr> | ||
</table> | </table> | ||
+ | |||
+ | <div>パディング値は-v が優先される</div> | ||
===-M の詳細=== | ===-M の詳細=== | ||
行115: | 行117: | ||
<tr> | <tr> | ||
<td>0</td> | <td>0</td> | ||
− | <td>フィラメント用(半径を軸から算出する)</td> | + | <td>フィラメント用(半径を軸から算出する: z軸方向にはずれてしまう)</td> |
</tr> | </tr> | ||
<tr> | <tr> | ||
<td>1</td> | <td>1</td> | ||
− | <td>粒子用( | + | <td>粒子用(半径を中心から算出する:球)</td> |
</tr> | </tr> | ||
− | </table> | + | <tr> |
− | + | <td>2</td> | |
+ | <td>粒子用(半径を中心から算出する:楕円)</td> | ||
+ | </tr> | ||
+ | <tr> | ||
+ | <td>3</td> | ||
+ | <td>粒子用(半径を中心から算出する:直方体)</td> | ||
+ | </tr> | ||
+ | </table> | ||
== 実行例 == | == 実行例 == |
2015年8月24日 (月) 00:04時点における最新版
mrcImage3DPadとはフィラメントまたは粒子のmrcImage(3D)に対してパディングを行うEosのコマンドである。
オプション一覧
メインオプション
オプション | 必須項目/選択項目 | 説明 | デフォルト |
---|---|---|---|
-i | 必須 | 入力ファイル: mrcImage | NULL |
-o | 必須 | 出力ファイル: mrcImage | NULL |
-r | 選択 | 境界の半径(-M 参照) | Nx |
-w | 選択 | スロープの幅(m=1で使用) | 1 |
-v | 選択 | パディング値 | 0 |
-Nx | 選択 | 出力ファイルのNx | 入力ファイルのNx |
-Ny | 選択 | 出力ファイルのNy | 入力ファイルのNy |
-Nz | 選択 | 出力ファイルのNz | 入力ファイルのNz |
-Floating | 選択 | フローティング | |
-c | 選択 | コンフィグファイル設定 | NULL |
-m | 選択 | パディング値の算出方法を設定 | 0 |
-M | 選択 | -r の算出方法を設定 | 0 |
-h | 選択 | ヘルプを表示 |
-m の詳細
モード | 説明 |
---|---|
0 | 平均値でパディングする |
1 | 余弦関数を掛ける |
-M の詳細
モード | 説明 |
---|---|
0 | フィラメント用(半径を軸から算出する: z軸方向にはずれてしまう) |
1 | 粒子用(半径を中心から算出する:球) |
2 | 粒子用(半径を中心から算出する:楕円) |
3 | 粒子用(半径を中心から算出する:直方体) |
実行例
入力ファイルの画像
最小 最大 |
-0.307724 (52, 10, 79) 1.52145 (47, 41, 47) |
最小 最大 |
-2255.49 (1, 42, 21) 4032.8 (49, 53, 30) |
オプション必須項目のみの場合
Tailer: 0 Program Start N: 69 69 100 TailerNum 0 r: 34
最小 最大 |
-0.307724 (52, 10, 79) 1.52145 (47, 41, 47) |
オプション -Nx, -Ny, -Nz
Nx=50, Ny=50, Nz=75で実行
Tailer: 0 Program Start N: 50 50 75 TailerNum 0 r: 34
最小 最大 |
-0.295151 (23, 12, 71) 1.52145 (38, 32, 47) |
オプション -r
r=20で実行
Tailer: 0 Program Start N: 69 69 100 TailerNum 0 r: 20
最小 最大 |
-0.295151 (32, 21, 71) 1.52145 (47, 41, 47) |
オプション -v
v=0.1で実行
Tailer: 0 Program Start N: 69 69 100 TailerNum 0
最小 最大 |
-0.295151 (32, 21, 71) 1.52145 (47, 41, 47) |
オプション -Floating
Tailer: 0 Program Start N: 69 69 100 TailerNum 0 r: 20 Floating avg:-0.000912
最小 最大 |
-0.294238 (32, 21, 71) 1.52236 (47, 41, 47) |
オプション -m
m=1で実行
その他のオプションなし
Tailer: 0 Program Start N: 69 69 100 TailerNum 0 r: -0.000245498 av: -0.000245498
最小 最大 |
-0.295151 (32, 21, 71) 1.52145 (47, 41, 47) |
w=2で実行
Tailer: 0 Program Start N: 69 69 100 TailerNum 0 r: -0.000162708 av: -0.000162708
最小 最大 |
-0.255166 (37, 36, 69) 1.06472 (47, 41, 47) |
オプション -M
M=1, r=30で実行
Tailer: 0 Program Start N: 99 99 99 99 99 99
最小 最大 |
-1991.84 (41, 38, 29) 4032.8 (49, 53, 30) |