mrcImage3DPad
mrcImage3DPadとはパディング（3D）を行うEosのコマンドである。
目次
オプション一覧
メインオプション
| オプション | 必須項目/選択項目 | 説明 | デフォルト |
|---|---|---|---|
| -i | 必須 | 入力ファイル: mrcImage | NULL |
| -o | 必須 | 出力ファイル: mrcImage | NULL |
| -r | 選択 | Threshold radius of signal.Default is Nx. | 0 |
| -w | 選択 | Width of slope. For mode 1. | 1 |
| -v | 選択 | Value of out of threshold. | 0 |
| -Nx | 選択 | Number of x.Default is inputfile. | 0 |
| -Ny | 選択 | Number of y.Default is inputfile. | 0 |
| -Nz | 選択 | Number of z.Default is inputfile. | 0 |
| -Floating | 選択 | Floating | |
| -c | 選択 | コンフィグファイル設定 | NULL |
| -m | 選択 | モードを設定 | 0 |
| -M | 選択 | モード2を設定 | 0 |
| -h | 選択 | ヘルプを表示 |
-m の詳細
| モード | 説明 |
|---|---|
| 0 | Default: Out of threshold is avrage of threshold plain. |
| 1 | Mulplying cos function. Default: Out of threshold is avrage of threshold plain. |
-M の詳細
| モード | 説明 |
|---|---|
| 0 | For filaments. R is calculated from its axis. |
| 1 | For particles. R is calculated from its center. |
実行例
入力ファイルの画像
|
|
最小 最大 |
-2255.49 (1, 42, 21) 4032.8 (49, 53, 30) |
オプション必須項目のみの場合
|
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最小 最大 |
-2255.49 (1, 42, 21) 4032.8 (49, 53, 30) |
オプション -r
r=30で実行
|
|
最小 最大 |
-2134.45 (71, 30, 28) 4032.8 (49, 53, 30) |
オプション -Nx, -Ny, -Nz
Nx=70, Ny=70, Nz=75で実行
|
|
最小 最大 |
-2134.45 (57, 16, 28) 4032.8 (35, 39, 30) |
オプション -v
v=2, Nx=100, Ny=100, Nz=100で実行
 |
最小 最大 |
0 (15, 15, 0) 2 (0, 0, 0) |
オプション -Floating
Floating, v=2, Nx=100, Ny=100, Nz=100で実行
 |
最小 最大 |
-2 (15, 15, 0) 0 (0, 0, 0) |
オプション -m
m=1, r=20で実行
その他のオプションなし
 |
最小 最大 |
0 (31, 16, 0) 2 (35, 35, 5) |
w=5で実行
 |
最小 最大 |
0 (31, 20, 0) 2 (35, 35, 5) |
オプション -M
M=1, r=30で実行
 |
最小 最大 |
0 (14, 31, 28) 2 (15, 31, 27) |
