「mrcImage3DSymmetryFind」の版間の差分

提供: Eospedia
移動: 案内検索
(Kinoshita がページ「MrcImage3DSymmetryFind」を「mrcImage3DSymmetryFind」に移動しました)
 
行111: 行111:
  
 
== 実行例 ==
 
== 実行例 ==
 +
===[[Media:Input-ThickFilaments5-P.mrc | 入力ファイル]]の画像===
 +
<table>
 +
<tr>
 +
<td><p align="Center">[[画像:Input-ThickFilaments5-P.png]]<br>
 +
xy平面<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="Center">[[画像:Input1-ThickFilaments5-P.png]]<br>
 +
yz平面<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="left">最小<br>
 +
最大<br>
 +
平均値<br>
 +
標準偏差<br>
 +
標準誤差<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="left">0 (0, 0, 0)<br>
 +
2.33767 (57, 32, 45)<br>
 +
0.00497068<br>
 +
0.0883357<br>
 +
0.000172531<br></p>
 +
</td>
 +
</tr>
 +
</table>
 +
<br>
 +
 +
<div>以降はS=5で実行</div>
 +
 +
===オプション -Rot1, -Rot2===
 +
====Rot1=(0, 360, 30), Rot2=(-90, 90, 30)で実行====
 +
<div>出力結果</div>
 +
<pre>
 +
COR: 0.000000 -90.000000 2.183189 0.000000 1.000000 61.000000
 +
CORMAX: 0.000000 -90.000000 2.183189 0.000000 1.000000 61.000000
 +
COR: 0.000000 -60.000000 1.360026 0.000000 0.000000 5.000000
 +
COR: 60.000000 -60.000000 0.078503 31.000000 5.000000 0.000000
 +
COR: 120.000000 -60.000000 0.085735 40.000000 0.000000 35.000000
 +
COR: 180.000000 -60.000000 1.360025 0.000000 0.000000 5.000000
 +
COR: 240.000000 -60.000000 0.078503 31.000000 5.000000 0.000000
 +
COR: 300.000000 -60.000000 0.085734 40.000000 0.000000 35.000000
 +
COR: 0.000000 -30.000000 1.721305 0.000000 0.000000 61.000000
 +
COR: 34.641016 -30.000000 0.086765 60.000000 13.000000 21.000000
 +
COR: 69.282032 -30.000000 0.076439 22.000000 61.000000 58.000000
 +
 +
-中略-
 +
 +
COR: 346.410162 30.000000 0.122974 23.000000 39.000000 54.000000
 +
COR: 0.000000 60.000000 1.323306 1.000000 1.000000 54.000000
 +
COR: 60.000000 60.000000 0.088660 29.000000 62.000000 47.000000
 +
COR: 120.000000 60.000000 0.088762 15.000000 46.000000 35.000000
 +
COR: 180.000000 60.000000 1.323306 1.000000 1.000000 54.000000
 +
COR: 240.000000 60.000000 0.088660 29.000000 62.000000 47.000000
 +
COR: 300.000000 60.000000 0.088762 15.000000 46.000000 35.000000
 +
COR: 360.000000 60.000000 1.323306 1.000000 1.000000 54.000000
 +
COR: 0.000000 90.000000 2.183188 0.000000 1.000000 61.000000
 +
</pre>
 +
<br>
 +
 +
<div>-a のデータ</div>
 +
<table>
 +
<tr>
 +
<td><p align="Center">[[画像:Outdata-Rot-mrcImage3DSymmetryFind.png]]<br>
 +
xy平面<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="Center">[[画像:Outdata1-Rot-mrcImage3DSymmetryFind.png]]<br>
 +
yz平面<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="left">最小<br>
 +
最大<br>
 +
平均値<br>
 +
標準偏差<br>
 +
標準誤差<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="left">-4.54771e-06 (32, 5, 39)<br>
 +
1.17132 (57, 32, 15)<br>
 +
0.00524255<br>
 +
0.0559384<br>
 +
0.000109255<br></p>
 +
</td>
 +
</tr>
 +
</table>
 +
<br>
 +
 +
====Rot1=(90, 180, 30), Rot2=(-90, 90, 30)で実行====
 +
<div>出力結果</div>
 +
<pre>
 +
COR: 90.000000 -90.000000 1.377612 1.000000 1.000000 57.000000
 +
COR: 90.000000 -60.000000 1.377612 1.000000 1.000000 57.000000
 +
COR: 150.000000 -60.000000 0.071598 17.000000 61.000000 56.000000
 +
COR: 90.000000 -30.000000 1.377612 1.000000 1.000000 57.000000
 +
COR: 124.641016 -30.000000 0.097275 6.000000 29.000000 30.000000
 +
COR: 159.282032 -30.000000 0.081482 1.000000 56.000000 62.000000
 +
COR: 90.000000 0.000000 1.377612 1.000000 1.000000 57.000000
 +
COR: 120.000000 0.000000 0.069825 58.000000 1.000000 12.000000
 +
COR: 150.000000 0.000000 0.083980 8.000000 42.000000 56.000000
 +
COR: 180.000000 0.000000 1.650886 1.000000 0.000000 5.000000
 +
COR: 90.000000 30.000000 1.377611 1.000000 1.000000 57.000000
 +
COR: 124.641016 30.000000 0.103685 7.000000 34.000000 3.000000
 +
COR: 159.282032 30.000000 0.079128 12.000000 58.000000 0.000000
 +
COR: 90.000000 60.000000 1.377611 1.000000 1.000000 57.000000
 +
COR: 150.000000 60.000000 0.091102 20.000000 4.000000 4.000000
 +
COR: 90.000000 90.000000 1.377612 1.000000 1.000000 57.000000
 +
CORMAX: 180.000000 0.000000 1.650886 1.000000 0.000000 5.000000
 +
</pre>
 +
<br>
 +
 +
<div>-a のデータ</div>
 +
<table>
 +
<tr>
 +
<td><p align="Center">[[画像:Outdata-Rot1-mrcImage3DSymmetryFind.png]]<br>
 +
xy平面<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="Center">[[画像:Outdata1-Rot1-mrcImage3DSymmetryFind.png]]<br>
 +
yz平面<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="left">最小<br>
 +
最大<br>
 +
平均値<br>
 +
標準偏差<br>
 +
標準誤差<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="left">-6.08793e-06 (8, 43, 9)<br>
 +
1.17132 (57, 32, 45)<br>
 +
0.00524255<br>
 +
0.055938<br>
 +
0.000109254<br></p>
 +
</td>
 +
</tr>
 +
</table>
 +
<br>
 +
 +
====Rot1=(0, 360, 30), Rot2=(0, 45, 15)で実行====
 +
<div>出力結果</div>
 +
<pre>
 +
COR: 0.000000 0.000000 1.650886 1.000000 0.000000 5.000000
 +
COR: 30.000000 0.000000 0.076186 57.000000 3.000000 10.000000
 +
COR: 60.000000 0.000000 0.082015 8.000000 61.000000 5.000000
 +
COR: 90.000000 0.000000 1.377612 1.000000 1.000000 57.000000
 +
COR: 120.000000 0.000000 0.069825 58.000000 1.000000 12.000000
 +
COR: 150.000000 0.000000 0.083980 8.000000 42.000000 56.000000
 +
COR: 180.000000 0.000000 1.650886 1.000000 0.000000 5.000000
 +
COR: 210.000000 0.000000 0.076186 57.000000 3.000000 10.000000
 +
COR: 240.000000 0.000000 0.082015 8.000000 61.000000 5.000000
 +
COR: 270.000000 0.000000 1.377615 1.000000 1.000000 57.000000
 +
 +
-中略-
 +
 +
COR: 0.000000 45.000000 2.199364 1.000000 1.000000 1.000000
 +
COR: 42.426407 45.000000 0.071986 11.000000 36.000000 30.000000
 +
COR: 84.852814 45.000000 0.182864 1.000000 3.000000 26.000000
 +
COR: 127.279221 45.000000 0.068948 5.000000 63.000000 12.000000
 +
COR: 169.705627 45.000000 0.217003 2.000000 4.000000 8.000000
 +
COR: 212.132034 45.000000 0.076489 9.000000 45.000000 1.000000
 +
COR: 254.558441 45.000000 0.128826 28.000000 33.000000 14.000000
 +
COR: 296.984848 45.000000 0.128260 57.000000 62.000000 51.000000
 +
COR: 339.411255 45.000000 0.081883 2.000000 0.000000 13.000000
 +
CORMAX: 0.000000 45.000000 2.199364 1.000000 1.000000 1.000000
 +
</pre>
 +
<br>
 +
 +
<div>-a のデータ</div>
 +
<table>
 +
<tr>
 +
<td><p align="Center">[[画像:Outdata-Rot2-mrcImage3DSymmetryFind.png]]<br>
 +
xy平面<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="Center">[[画像:Outdata1-Rot2-mrcImage3DSymmetryFind.png]]<br>
 +
yz平面<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="left">最小<br>
 +
最大<br>
 +
平均値<br>
 +
標準偏差<br>
 +
標準誤差<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="left">-4.45873e-06 (30, 6, 47)<br>
 +
1.17131 (57, 32, 60)<br>
 +
0.00524255<br>
 +
0.055938<br>
 +
0.000109254<br></p>
 +
</td>
 +
</tr>
 +
</table>
 +
<br>
 +
 +
<div>Rot1=(0, 360, 30), Rot2=(-90, 90, 30)で実行</div>
 +
 +
===オプション -RotMode===
 +
====RotMode=YOYSで実行====
 +
<div>出力結果</div>
 +
<pre>
 +
COR: 0.000000 -90.000000 1.650886 1.000000 0.000000 5.000000
 +
COR: 0.000000 -60.000000 0.076186 57.000000 3.000000 10.000000
 +
COR: 60.000000 -60.000000 0.120710 19.000000 19.000000 59.000000
 +
COR: 120.000000 -60.000000 0.108374 55.000000 1.000000 16.000000
 +
COR: 180.000000 -60.000000 0.076186 57.000000 3.000000 10.000000
 +
COR: 240.000000 -60.000000 0.120710 19.000000 19.000000 59.000000
 +
COR: 300.000000 -60.000000 0.108374 55.000000 1.000000 16.000000
 +
COR: 0.000000 -30.000000 0.082015 8.000000 61.000000 5.000000
 +
COR: 34.641016 -30.000000 0.060247 53.000000 39.000000 3.000000
 +
COR: 69.282032 -30.000000 0.121584 6.000000 16.000000 55.000000
 +
 +
-中略-
 +
 +
COR: 346.410162 30.000000 0.085250 4.000000 28.000000 30.000000
 +
COR: 0.000000 60.000000 0.083980 8.000000 42.000000 56.000000
 +
COR: 60.000000 60.000000 0.102389 7.000000 3.000000 30.000000
 +
COR: 120.000000 60.000000 0.103884 40.000000 43.000000 12.000000
 +
COR: 180.000000 60.000000 0.083980 8.000000 42.000000 56.000000
 +
COR: 240.000000 60.000000 0.102389 7.000000 3.000000 30.000000
 +
COR: 300.000000 60.000000 0.103884 40.000000 43.000000 12.000000
 +
COR: 360.000000 60.000000 0.083980 8.000000 42.000000 56.000000
 +
COR: 0.000000 90.000000 1.650886 1.000000 0.000000 5.000000
 +
CORMAX: 90.000000 0.000000 2.183189 0.000000 1.000000 61.000000
 +
</pre>
 +
<br>
 +
 +
<div>-a のデータ</div>
 +
<table>
 +
<tr>
 +
<td><p align="Center">[[画像:Outdata-RotMode-mrcImage3DSymmetryFind.png]]<br>
 +
xy平面<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="Center">[[画像:Outdata1-RotMode-mrcImage3DSymmetryFind.png]]<br>
 +
yz平面<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="left">最小<br>
 +
最大<br>
 +
平均値<br>
 +
標準偏差<br>
 +
標準誤差<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="left">-4.25576e-06 (10, 18, 16)<br>
 +
1.17132 (57, 32, 15)<br>
 +
0.00524255<br>
 +
0.0559384<br>
 +
0.000109255<br></p>
 +
</td>
 +
</tr>
 +
</table>
 +
<br>
 +
 +
===オプション -dCos===
 +
====dCos=2で実行====
 +
<div>出力結果</div>
 +
<pre>
 +
COR: 0.000000 -90.000000 2.183189 0.000000 1.000000 61.000000
 +
COR: 30.000000 -90.000000 0.085503 0.000000 8.000000 0.000000
 +
COR: 60.000000 -90.000000 0.069688 20.000000 58.000000 7.000000
 +
COR: 90.000000 -90.000000 1.377612 1.000000 1.000000 57.000000
 +
COR: 120.000000 -90.000000 0.068475 1.000000 7.000000 54.000000
 +
COR: 150.000000 -90.000000 0.067421 10.000000 58.000000 3.000000
 +
COR: 180.000000 -90.000000 2.183190 0.000000 1.000000 61.000000
 +
COR: 210.000000 -90.000000 0.085503 0.000000 8.000000 0.000000
 +
COR: 240.000000 -90.000000 0.069688 20.000000 58.000000 7.000000
 +
COR: 270.000000 -90.000000 1.377615 1.000000 1.000000 57.000000
 +
 +
-中略-
 +
 +
COR: 120.000000 90.000000 0.069688 20.000000 58.000000 7.000000
 +
COR: 150.000000 90.000000 0.085502 0.000000 8.000000 0.000000
 +
COR: 180.000000 90.000000 2.183188 0.000000 1.000000 61.000000
 +
COR: 210.000000 90.000000 0.067421 10.000000 58.000000 3.000000
 +
COR: 240.000000 90.000000 0.068475 1.000000 7.000000 54.000000
 +
COR: 270.000000 90.000000 1.377615 1.000000 1.000000 57.000000
 +
COR: 300.000000 90.000000 0.069688 20.000000 58.000000 7.000000
 +
COR: 330.000000 90.000000 0.085503 0.000000 8.000000 0.000000
 +
COR: 360.000000 90.000000 2.183188 0.000000 1.000000 61.000000
 +
CORMAX: 180.000000 -90.000000 2.183190 0.000000 1.000000 61.000000
 +
</pre>
 +
<br>
 +
 +
<div>-a のデータ</div>
 +
<table>
 +
<tr>
 +
<td><p align="Center">[[画像:Outdata-dCos-mrcImage3DSymmetryFind.png]]<br>
 +
xy平面<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="Center">[[画像:Outdata1-dCos-mrcImage3DSymmetryFind.png]]<br>
 +
yz平面<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="left">最小<br>
 +
最大<br>
 +
平均値<br>
 +
標準偏差<br>
 +
標準誤差<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="left">-8.51144e-06 (10, 18, 18)<br>
 +
1.17132 (57, 32, 15)<br>
 +
0.00524255<br>
 +
0.0559384<br>
 +
0.000109255<br></p>
 +
</td>
 +
</tr>
 +
</table>
 +
<br>
 +
 +
===オプション -CorMode===
 +
====CorMode=0で実行====
 +
<div>出力結果</div>
 +
<pre>
 +
COR: 0.000000 -90.000000 2.197224 0.000000 1.000000 61.000000
 +
COR: 0.000000 -60.000000 1.374043 0.000000 0.000000 5.000000
 +
COR: 60.000000 -60.000000 0.092597 31.000000 5.000000 0.000000
 +
COR: 120.000000 -60.000000 0.099758 40.000000 0.000000 35.000000
 +
COR: 180.000000 -60.000000 1.374043 0.000000 0.000000 5.000000
 +
COR: 240.000000 -60.000000 0.092597 31.000000 5.000000 0.000000
 +
COR: 300.000000 -60.000000 0.099758 40.000000 0.000000 35.000000
 +
COR: 0.000000 -30.000000 1.735318 0.000000 0.000000 61.000000
 +
COR: 34.641016 -30.000000 0.100761 60.000000 13.000000 21.000000
 +
COR: 69.282032 -30.000000 0.090407 22.000000 61.000000 58.000000
 +
 +
-中略-
 +
 +
COR: 346.410162 30.000000 0.136882 23.000000 39.000000 54.000000
 +
COR: 0.000000 60.000000 1.337318 1.000000 1.000000 54.000000
 +
COR: 60.000000 60.000000 0.102703 29.000000 62.000000 47.000000
 +
COR: 120.000000 60.000000 0.102782 15.000000 46.000000 35.000000
 +
COR: 180.000000 60.000000 1.337319 1.000000 1.000000 54.000000
 +
COR: 240.000000 60.000000 0.102703 29.000000 62.000000 47.000000
 +
COR: 300.000000 60.000000 0.102782 15.000000 46.000000 35.000000
 +
COR: 360.000000 60.000000 1.337318 1.000000 1.000000 54.000000
 +
COR: 0.000000 90.000000 2.197222 0.000000 1.000000 61.000000
 +
CORMAX: 0.000000 -90.000000 2.197224 0.000000 1.000000 61.000000
 +
</pre>
 +
<br>
 +
 +
<div>-a のデータ</div>
 +
<table>
 +
<tr>
 +
<td><p align="Center">[[画像:Outdata-CorMode0-mrcImage3DSymmetryFind.png]]<br>
 +
xy平面<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="Center">[[画像:Outdata1-CorMode0-mrcImage3DSymmetryFind.png]]<br>
 +
yz平面<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="left">最小<br>
 +
最大<br>
 +
平均値<br>
 +
標準偏差<br>
 +
標準誤差<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="left">-4.54771e-06 (32, 5, 39)<br>
 +
1.17132 (57, 32, 15)<br>
 +
0.00524255<br>
 +
0.0559384<br>
 +
0.000109255<br></p>
 +
</td>
 +
</tr>
 +
</table>
 +
<br>
 +
 +
====CorMode=1で実行====
 +
<div>出力結果</div>
 +
<pre>
 +
COR: 0.000000 -90.000000 191.501678 0.000000 1.000000 12.000000
 +
COR: 0.000000 -60.000000 76.109550 0.000000 0.000000 54.000000
 +
COR: 60.000000 -60.000000 8.493662 31.000000 5.000000 0.000000
 +
COR: 120.000000 -60.000000 7.064181 63.000000 31.000000 5.000000
 +
COR: 180.000000 -60.000000 76.109619 0.000000 0.000000 54.000000
 +
COR: 240.000000 -60.000000 8.493727 31.000000 5.000000 0.000000
 +
COR: 300.000000 -60.000000 7.064159 63.000000 31.000000 5.000000
 +
COR: 0.000000 -30.000000 118.692253 0.000000 0.000000 12.000000
 +
COR: 34.641016 -30.000000 8.690958 43.000000 46.000000 53.000000
 +
COR: 69.282032 -30.000000 7.165199 30.000000 31.000000 11.000000
 +
 +
-中略-
 +
 +
COR: 346.410162 30.000000 14.205758 0.000000 10.000000 51.000000
 +
COR: 0.000000 60.000000 71.928177 1.000000 1.000000 54.000000
 +
COR: 60.000000 60.000000 7.827852 5.000000 8.000000 31.000000
 +
COR: 120.000000 60.000000 8.705132 54.000000 0.000000 18.000000
 +
COR: 180.000000 60.000000 71.928482 1.000000 1.000000 54.000000
 +
COR: 240.000000 60.000000 7.827887 5.000000 8.000000 31.000000
 +
COR: 300.000000 60.000000 8.705167 54.000000 0.000000 18.000000
 +
COR: 360.000000 60.000000 71.928558 1.000000 1.000000 54.000000
 +
COR: 0.000000 90.000000 191.501495 0.000000 1.000000 12.000000
 +
CORMAX: 0.000000 -90.000000 191.501678 0.000000 1.000000 12.000000
 +
</pre>
 +
<br>
 +
 +
<div>-a のデータ</div>
 +
<table>
 +
<tr>
 +
<td><p align="Center">[[画像:Outdata-CorMode-mrcImage3DSymmetryFind.png]]<br>
 +
xy平面<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="Center">[[画像:Outdata1-CorMode-mrcImage3DSymmetryFind.png]]<br>
 +
yz平面<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="left">最小<br>
 +
最大<br>
 +
平均値<br>
 +
標準偏差<br>
 +
標準誤差<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="left">-4.54771e-06 (32, 5, 24)<br>
 +
1.17132 (57, 32, 45)<br>
 +
0.00524255<br>
 +
0.0559389<br>
 +
0.000109256<br></p>
 +
</td>
 +
</tr>
 +
</table>
 +
<br>
 +
 +
====CorMode=2で実行====
 +
<div>出力結果</div>
 +
<pre>
 +
COR: 0.000000 -90.000000 15.875746 0.000000 1.000000 12.000000
 +
COR: 0.000000 -60.000000 8.264269 0.000000 0.000000 54.000000
 +
COR: 60.000000 -60.000000 0.648076 31.000000 5.000000 0.000000
 +
COR: 120.000000 -60.000000 0.600062 40.000000 0.000000 50.000000
 +
COR: 180.000000 -60.000000 8.264269 0.000000 0.000000 54.000000
 +
COR: 240.000000 -60.000000 0.648076 31.000000 5.000000 0.000000
 +
COR: 300.000000 -60.000000 0.600059 40.000000 0.000000 50.000000
 +
COR: 0.000000 -30.000000 11.065264 0.000000 0.000000 12.000000
 +
COR: 34.641016 -30.000000 0.677072 60.000000 13.000000 21.000000
 +
COR: 69.282032 -30.000000 0.532551 13.000000 13.000000 3.000000
 +
 +
-中略-
 +
 +
COR: 346.410162 30.000000 0.976308 0.000000 10.000000 51.000000
 +
COR: 0.000000 60.000000 7.939377 1.000000 1.000000 54.000000
 +
COR: 60.000000 60.000000 0.662591 29.000000 62.000000 17.000000
 +
COR: 120.000000 60.000000 0.631593 16.000000 47.000000 5.000000
 +
COR: 180.000000 60.000000 7.939386 1.000000 1.000000 54.000000
 +
COR: 240.000000 60.000000 0.662592 29.000000 62.000000 17.000000
 +
COR: 300.000000 60.000000 0.631593 16.000000 47.000000 5.000000
 +
COR: 360.000000 60.000000 7.939386 1.000000 1.000000 54.000000
 +
COR: 0.000000 90.000000 15.875733 0.000000 1.000000 12.000000
 +
CORMAX: 0.000000 -90.000000 15.875746 0.000000 1.000000 12.000000
 +
</pre>
 +
<br>
 +
 +
<div>-a のデータ</div>
 +
<table>
 +
<tr>
 +
<td><p align="Center">[[画像:Outdata-CorMode2-mrcImage3DSymmetryFind.png]]<br>
 +
xy平面<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="Center">[[画像:Outdata1-CorMode2-mrcImage3DSymmetryFind.png]]<br>
 +
yz平面<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="left">最小<br>
 +
最大<br>
 +
平均値<br>
 +
標準偏差<br>
 +
標準誤差<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="left">-4.54771e-06 (32, 5, 24)<br>
 +
1.17132 (57, 32, 45)<br>
 +
0.00524255<br>
 +
0.0559389<br>
 +
0.000109256<br></p>
 +
</td>
 +
</tr>
 +
</table>
 +
<br>
 +
 +
====CorMode=3で実行====
 +
<div>出力結果</div>
 +
<pre>
 +
COR: 0.000000 -90.000000 0.305786 0.000000 1.000000 61.000000
 +
COR: 0.000000 -60.000000 0.191449 0.000000 0.000000 5.000000
 +
COR: 60.000000 -60.000000 0.012832 31.000000 5.000000 0.000000
 +
COR: 120.000000 -60.000000 0.013894 40.000000 0.000000 35.000000
 +
COR: 180.000000 -60.000000 0.191449 0.000000 0.000000 5.000000
 +
COR: 240.000000 -60.000000 0.012831 31.000000 5.000000 0.000000
 +
COR: 300.000000 -60.000000 0.013894 40.000000 0.000000 35.000000
 +
COR: 0.000000 -30.000000 0.241871 0.000000 0.000000 61.000000
 +
COR: 34.641016 -30.000000 0.014061 60.000000 13.000000 21.000000
 +
COR: 69.282032 -30.000000 0.012641 22.000000 61.000000 58.000000
 +
 +
-中略-
 +
 +
COR: 346.410162 30.000000 0.019222 23.000000 39.000000 54.000000
 +
COR: 0.000000 60.000000 0.186398 1.000000 1.000000 54.000000
 +
COR: 60.000000 60.000000 0.014283 29.000000 62.000000 47.000000
 +
COR: 120.000000 60.000000 0.014318 15.000000 46.000000 35.000000
 +
COR: 180.000000 60.000000 0.186398 1.000000 1.000000 54.000000
 +
COR: 240.000000 60.000000 0.014283 29.000000 62.000000 47.000000
 +
COR: 300.000000 60.000000 0.014319 15.000000 46.000000 35.000000
 +
COR: 360.000000 60.000000 0.186398 1.000000 1.000000 54.000000
 +
COR: 0.000000 90.000000 0.305786 0.000000 1.000000 61.000000
 +
CORMAX: 0.000000 -90.000000 0.305786 0.000000 1.000000 61.000000
 +
</pre>
 +
<br>
 +
 +
<div>-a のデータ</div>
 +
<table>
 +
<tr>
 +
<td><p align="Center">[[画像:Outdata-CorMode3-mrcImage3DSymmetryFind.png]]<br>
 +
xy平面<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="Center">[[画像:Outdata1-CorMode3-mrcImage3DSymmetryFind.png]]<br>
 +
yz平面<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="left">最小<br>
 +
最大<br>
 +
平均値<br>
 +
標準偏差<br>
 +
標準誤差<br></p>
 +
</td>
 +
<td><p align="left">-4.54771e-06 (32, 5, 39)<br>
 +
1.17132 (57, 32, 15)<br>
 +
0.00524255<br>
 +
0.0559384<br>
 +
0.000109255<br></p>
 +
</td>
 +
</tr>
 +
</table>
 +
<br>

2014年2月3日 (月) 05:26時点における最新版

mrcImage3DSymmetryFindとはEosコマンドである。


オプション一覧

メインオプション

オプション 必須項目/選択項目 説明 デフォルト
-i 必須 入力ファイル: mrcImage(3D) NULL
-o 選択 出力: SymmetryFindParameters stdout
-a 選択 出力: SymmetryAverage NULL
-S 選択 SpaceGroupNumber 0
-RotMode 選択 オイラー角の回転モード XOYS
-Rot1 選択 (minRot1, maxRot1, dRot1): [degree] (0, 360, 1.0)
-Rot2 選択 (minRot2, maxRot2, dRot2): [degree] (-90, 90, 1.0)
-dCos 選択 dCos 1
-CorMode 選択 CorrelationMode 16
-OffsetMode 選択 OffsetMode 0
-InterpolationMode 選択 InterpolationMode 2
-c 選択 コンフィグファイル設定 NULL
-m 選択 モードを設定 0
-h 選択 ヘルプを表示  

モードの詳細

モード 説明
0


実行例

入力ファイルの画像

Input-ThickFilaments5-P.png
xy平面

Input1-ThickFilaments5-P.png
yz平面

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

0 (0, 0, 0)

2.33767 (57, 32, 45)
0.00497068
0.0883357

0.000172531


以降はS=5で実行

オプション -Rot1, -Rot2

Rot1=(0, 360, 30), Rot2=(-90, 90, 30)で実行

出力結果
COR: 0.000000 -90.000000 2.183189 0.000000 1.000000 61.000000
CORMAX: 0.000000 -90.000000 2.183189 0.000000 1.000000 61.000000
COR: 0.000000 -60.000000 1.360026 0.000000 0.000000 5.000000
COR: 60.000000 -60.000000 0.078503 31.000000 5.000000 0.000000
COR: 120.000000 -60.000000 0.085735 40.000000 0.000000 35.000000
COR: 180.000000 -60.000000 1.360025 0.000000 0.000000 5.000000
COR: 240.000000 -60.000000 0.078503 31.000000 5.000000 0.000000
COR: 300.000000 -60.000000 0.085734 40.000000 0.000000 35.000000
COR: 0.000000 -30.000000 1.721305 0.000000 0.000000 61.000000
COR: 34.641016 -30.000000 0.086765 60.000000 13.000000 21.000000
COR: 69.282032 -30.000000 0.076439 22.000000 61.000000 58.000000

-中略-

COR: 346.410162 30.000000 0.122974 23.000000 39.000000 54.000000
COR: 0.000000 60.000000 1.323306 1.000000 1.000000 54.000000
COR: 60.000000 60.000000 0.088660 29.000000 62.000000 47.000000
COR: 120.000000 60.000000 0.088762 15.000000 46.000000 35.000000
COR: 180.000000 60.000000 1.323306 1.000000 1.000000 54.000000
COR: 240.000000 60.000000 0.088660 29.000000 62.000000 47.000000
COR: 300.000000 60.000000 0.088762 15.000000 46.000000 35.000000
COR: 360.000000 60.000000 1.323306 1.000000 1.000000 54.000000
COR: 0.000000 90.000000 2.183188 0.000000 1.000000 61.000000


-a のデータ

Outdata-Rot-mrcImage3DSymmetryFind.png
xy平面

Outdata1-Rot-mrcImage3DSymmetryFind.png
yz平面

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

-4.54771e-06 (32, 5, 39)

1.17132 (57, 32, 15)
0.00524255
0.0559384

0.000109255


Rot1=(90, 180, 30), Rot2=(-90, 90, 30)で実行

出力結果
COR: 90.000000 -90.000000 1.377612 1.000000 1.000000 57.000000
COR: 90.000000 -60.000000 1.377612 1.000000 1.000000 57.000000
COR: 150.000000 -60.000000 0.071598 17.000000 61.000000 56.000000
COR: 90.000000 -30.000000 1.377612 1.000000 1.000000 57.000000
COR: 124.641016 -30.000000 0.097275 6.000000 29.000000 30.000000
COR: 159.282032 -30.000000 0.081482 1.000000 56.000000 62.000000
COR: 90.000000 0.000000 1.377612 1.000000 1.000000 57.000000
COR: 120.000000 0.000000 0.069825 58.000000 1.000000 12.000000
COR: 150.000000 0.000000 0.083980 8.000000 42.000000 56.000000
COR: 180.000000 0.000000 1.650886 1.000000 0.000000 5.000000
COR: 90.000000 30.000000 1.377611 1.000000 1.000000 57.000000
COR: 124.641016 30.000000 0.103685 7.000000 34.000000 3.000000
COR: 159.282032 30.000000 0.079128 12.000000 58.000000 0.000000
COR: 90.000000 60.000000 1.377611 1.000000 1.000000 57.000000
COR: 150.000000 60.000000 0.091102 20.000000 4.000000 4.000000
COR: 90.000000 90.000000 1.377612 1.000000 1.000000 57.000000
CORMAX: 180.000000 0.000000 1.650886 1.000000 0.000000 5.000000


-a のデータ

Outdata-Rot1-mrcImage3DSymmetryFind.png
xy平面

Outdata1-Rot1-mrcImage3DSymmetryFind.png
yz平面

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

-6.08793e-06 (8, 43, 9)

1.17132 (57, 32, 45)
0.00524255
0.055938

0.000109254


Rot1=(0, 360, 30), Rot2=(0, 45, 15)で実行

出力結果
COR: 0.000000 0.000000 1.650886 1.000000 0.000000 5.000000
COR: 30.000000 0.000000 0.076186 57.000000 3.000000 10.000000
COR: 60.000000 0.000000 0.082015 8.000000 61.000000 5.000000
COR: 90.000000 0.000000 1.377612 1.000000 1.000000 57.000000
COR: 120.000000 0.000000 0.069825 58.000000 1.000000 12.000000
COR: 150.000000 0.000000 0.083980 8.000000 42.000000 56.000000
COR: 180.000000 0.000000 1.650886 1.000000 0.000000 5.000000
COR: 210.000000 0.000000 0.076186 57.000000 3.000000 10.000000
COR: 240.000000 0.000000 0.082015 8.000000 61.000000 5.000000
COR: 270.000000 0.000000 1.377615 1.000000 1.000000 57.000000

-中略-

COR: 0.000000 45.000000 2.199364 1.000000 1.000000 1.000000
COR: 42.426407 45.000000 0.071986 11.000000 36.000000 30.000000
COR: 84.852814 45.000000 0.182864 1.000000 3.000000 26.000000
COR: 127.279221 45.000000 0.068948 5.000000 63.000000 12.000000
COR: 169.705627 45.000000 0.217003 2.000000 4.000000 8.000000
COR: 212.132034 45.000000 0.076489 9.000000 45.000000 1.000000
COR: 254.558441 45.000000 0.128826 28.000000 33.000000 14.000000
COR: 296.984848 45.000000 0.128260 57.000000 62.000000 51.000000
COR: 339.411255 45.000000 0.081883 2.000000 0.000000 13.000000
CORMAX: 0.000000 45.000000 2.199364 1.000000 1.000000 1.000000


-a のデータ

Outdata-Rot2-mrcImage3DSymmetryFind.png
xy平面

Outdata1-Rot2-mrcImage3DSymmetryFind.png
yz平面

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

-4.45873e-06 (30, 6, 47)

1.17131 (57, 32, 60)
0.00524255
0.055938

0.000109254


Rot1=(0, 360, 30), Rot2=(-90, 90, 30)で実行

オプション -RotMode

RotMode=YOYSで実行

出力結果
COR: 0.000000 -90.000000 1.650886 1.000000 0.000000 5.000000
COR: 0.000000 -60.000000 0.076186 57.000000 3.000000 10.000000
COR: 60.000000 -60.000000 0.120710 19.000000 19.000000 59.000000
COR: 120.000000 -60.000000 0.108374 55.000000 1.000000 16.000000
COR: 180.000000 -60.000000 0.076186 57.000000 3.000000 10.000000
COR: 240.000000 -60.000000 0.120710 19.000000 19.000000 59.000000
COR: 300.000000 -60.000000 0.108374 55.000000 1.000000 16.000000
COR: 0.000000 -30.000000 0.082015 8.000000 61.000000 5.000000
COR: 34.641016 -30.000000 0.060247 53.000000 39.000000 3.000000
COR: 69.282032 -30.000000 0.121584 6.000000 16.000000 55.000000

-中略-

COR: 346.410162 30.000000 0.085250 4.000000 28.000000 30.000000
COR: 0.000000 60.000000 0.083980 8.000000 42.000000 56.000000
COR: 60.000000 60.000000 0.102389 7.000000 3.000000 30.000000
COR: 120.000000 60.000000 0.103884 40.000000 43.000000 12.000000
COR: 180.000000 60.000000 0.083980 8.000000 42.000000 56.000000
COR: 240.000000 60.000000 0.102389 7.000000 3.000000 30.000000
COR: 300.000000 60.000000 0.103884 40.000000 43.000000 12.000000
COR: 360.000000 60.000000 0.083980 8.000000 42.000000 56.000000
COR: 0.000000 90.000000 1.650886 1.000000 0.000000 5.000000
CORMAX: 90.000000 0.000000 2.183189 0.000000 1.000000 61.000000


-a のデータ

Outdata-RotMode-mrcImage3DSymmetryFind.png
xy平面

Outdata1-RotMode-mrcImage3DSymmetryFind.png
yz平面

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

-4.25576e-06 (10, 18, 16)

1.17132 (57, 32, 15)
0.00524255
0.0559384

0.000109255


オプション -dCos

dCos=2で実行

出力結果
COR: 0.000000 -90.000000 2.183189 0.000000 1.000000 61.000000
COR: 30.000000 -90.000000 0.085503 0.000000 8.000000 0.000000
COR: 60.000000 -90.000000 0.069688 20.000000 58.000000 7.000000
COR: 90.000000 -90.000000 1.377612 1.000000 1.000000 57.000000
COR: 120.000000 -90.000000 0.068475 1.000000 7.000000 54.000000
COR: 150.000000 -90.000000 0.067421 10.000000 58.000000 3.000000
COR: 180.000000 -90.000000 2.183190 0.000000 1.000000 61.000000
COR: 210.000000 -90.000000 0.085503 0.000000 8.000000 0.000000
COR: 240.000000 -90.000000 0.069688 20.000000 58.000000 7.000000
COR: 270.000000 -90.000000 1.377615 1.000000 1.000000 57.000000

-中略-

COR: 120.000000 90.000000 0.069688 20.000000 58.000000 7.000000
COR: 150.000000 90.000000 0.085502 0.000000 8.000000 0.000000
COR: 180.000000 90.000000 2.183188 0.000000 1.000000 61.000000
COR: 210.000000 90.000000 0.067421 10.000000 58.000000 3.000000
COR: 240.000000 90.000000 0.068475 1.000000 7.000000 54.000000
COR: 270.000000 90.000000 1.377615 1.000000 1.000000 57.000000
COR: 300.000000 90.000000 0.069688 20.000000 58.000000 7.000000
COR: 330.000000 90.000000 0.085503 0.000000 8.000000 0.000000
COR: 360.000000 90.000000 2.183188 0.000000 1.000000 61.000000
CORMAX: 180.000000 -90.000000 2.183190 0.000000 1.000000 61.000000


-a のデータ

Outdata-dCos-mrcImage3DSymmetryFind.png
xy平面

Outdata1-dCos-mrcImage3DSymmetryFind.png
yz平面

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

-8.51144e-06 (10, 18, 18)

1.17132 (57, 32, 15)
0.00524255
0.0559384

0.000109255


オプション -CorMode

CorMode=0で実行

出力結果
COR: 0.000000 -90.000000 2.197224 0.000000 1.000000 61.000000
COR: 0.000000 -60.000000 1.374043 0.000000 0.000000 5.000000
COR: 60.000000 -60.000000 0.092597 31.000000 5.000000 0.000000
COR: 120.000000 -60.000000 0.099758 40.000000 0.000000 35.000000
COR: 180.000000 -60.000000 1.374043 0.000000 0.000000 5.000000
COR: 240.000000 -60.000000 0.092597 31.000000 5.000000 0.000000
COR: 300.000000 -60.000000 0.099758 40.000000 0.000000 35.000000
COR: 0.000000 -30.000000 1.735318 0.000000 0.000000 61.000000
COR: 34.641016 -30.000000 0.100761 60.000000 13.000000 21.000000
COR: 69.282032 -30.000000 0.090407 22.000000 61.000000 58.000000

-中略-

COR: 346.410162 30.000000 0.136882 23.000000 39.000000 54.000000
COR: 0.000000 60.000000 1.337318 1.000000 1.000000 54.000000
COR: 60.000000 60.000000 0.102703 29.000000 62.000000 47.000000
COR: 120.000000 60.000000 0.102782 15.000000 46.000000 35.000000
COR: 180.000000 60.000000 1.337319 1.000000 1.000000 54.000000
COR: 240.000000 60.000000 0.102703 29.000000 62.000000 47.000000
COR: 300.000000 60.000000 0.102782 15.000000 46.000000 35.000000
COR: 360.000000 60.000000 1.337318 1.000000 1.000000 54.000000
COR: 0.000000 90.000000 2.197222 0.000000 1.000000 61.000000
CORMAX: 0.000000 -90.000000 2.197224 0.000000 1.000000 61.000000


-a のデータ

Outdata-CorMode0-mrcImage3DSymmetryFind.png
xy平面

Outdata1-CorMode0-mrcImage3DSymmetryFind.png
yz平面

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

-4.54771e-06 (32, 5, 39)

1.17132 (57, 32, 15)
0.00524255
0.0559384

0.000109255


CorMode=1で実行

出力結果
COR: 0.000000 -90.000000 191.501678 0.000000 1.000000 12.000000
COR: 0.000000 -60.000000 76.109550 0.000000 0.000000 54.000000
COR: 60.000000 -60.000000 8.493662 31.000000 5.000000 0.000000
COR: 120.000000 -60.000000 7.064181 63.000000 31.000000 5.000000
COR: 180.000000 -60.000000 76.109619 0.000000 0.000000 54.000000
COR: 240.000000 -60.000000 8.493727 31.000000 5.000000 0.000000
COR: 300.000000 -60.000000 7.064159 63.000000 31.000000 5.000000
COR: 0.000000 -30.000000 118.692253 0.000000 0.000000 12.000000
COR: 34.641016 -30.000000 8.690958 43.000000 46.000000 53.000000
COR: 69.282032 -30.000000 7.165199 30.000000 31.000000 11.000000

-中略-

COR: 346.410162 30.000000 14.205758 0.000000 10.000000 51.000000
COR: 0.000000 60.000000 71.928177 1.000000 1.000000 54.000000
COR: 60.000000 60.000000 7.827852 5.000000 8.000000 31.000000
COR: 120.000000 60.000000 8.705132 54.000000 0.000000 18.000000
COR: 180.000000 60.000000 71.928482 1.000000 1.000000 54.000000
COR: 240.000000 60.000000 7.827887 5.000000 8.000000 31.000000
COR: 300.000000 60.000000 8.705167 54.000000 0.000000 18.000000
COR: 360.000000 60.000000 71.928558 1.000000 1.000000 54.000000
COR: 0.000000 90.000000 191.501495 0.000000 1.000000 12.000000
CORMAX: 0.000000 -90.000000 191.501678 0.000000 1.000000 12.000000


-a のデータ

Outdata-CorMode-mrcImage3DSymmetryFind.png
xy平面

Outdata1-CorMode-mrcImage3DSymmetryFind.png
yz平面

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

-4.54771e-06 (32, 5, 24)

1.17132 (57, 32, 45)
0.00524255
0.0559389

0.000109256


CorMode=2で実行

出力結果
COR: 0.000000 -90.000000 15.875746 0.000000 1.000000 12.000000
COR: 0.000000 -60.000000 8.264269 0.000000 0.000000 54.000000
COR: 60.000000 -60.000000 0.648076 31.000000 5.000000 0.000000
COR: 120.000000 -60.000000 0.600062 40.000000 0.000000 50.000000
COR: 180.000000 -60.000000 8.264269 0.000000 0.000000 54.000000
COR: 240.000000 -60.000000 0.648076 31.000000 5.000000 0.000000
COR: 300.000000 -60.000000 0.600059 40.000000 0.000000 50.000000
COR: 0.000000 -30.000000 11.065264 0.000000 0.000000 12.000000
COR: 34.641016 -30.000000 0.677072 60.000000 13.000000 21.000000
COR: 69.282032 -30.000000 0.532551 13.000000 13.000000 3.000000

-中略-

COR: 346.410162 30.000000 0.976308 0.000000 10.000000 51.000000
COR: 0.000000 60.000000 7.939377 1.000000 1.000000 54.000000
COR: 60.000000 60.000000 0.662591 29.000000 62.000000 17.000000
COR: 120.000000 60.000000 0.631593 16.000000 47.000000 5.000000
COR: 180.000000 60.000000 7.939386 1.000000 1.000000 54.000000
COR: 240.000000 60.000000 0.662592 29.000000 62.000000 17.000000
COR: 300.000000 60.000000 0.631593 16.000000 47.000000 5.000000
COR: 360.000000 60.000000 7.939386 1.000000 1.000000 54.000000
COR: 0.000000 90.000000 15.875733 0.000000 1.000000 12.000000
CORMAX: 0.000000 -90.000000 15.875746 0.000000 1.000000 12.000000


-a のデータ

Outdata-CorMode2-mrcImage3DSymmetryFind.png
xy平面

Outdata1-CorMode2-mrcImage3DSymmetryFind.png
yz平面

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

-4.54771e-06 (32, 5, 24)

1.17132 (57, 32, 45)
0.00524255
0.0559389

0.000109256


CorMode=3で実行

出力結果
COR: 0.000000 -90.000000 0.305786 0.000000 1.000000 61.000000
COR: 0.000000 -60.000000 0.191449 0.000000 0.000000 5.000000
COR: 60.000000 -60.000000 0.012832 31.000000 5.000000 0.000000
COR: 120.000000 -60.000000 0.013894 40.000000 0.000000 35.000000
COR: 180.000000 -60.000000 0.191449 0.000000 0.000000 5.000000
COR: 240.000000 -60.000000 0.012831 31.000000 5.000000 0.000000
COR: 300.000000 -60.000000 0.013894 40.000000 0.000000 35.000000
COR: 0.000000 -30.000000 0.241871 0.000000 0.000000 61.000000
COR: 34.641016 -30.000000 0.014061 60.000000 13.000000 21.000000
COR: 69.282032 -30.000000 0.012641 22.000000 61.000000 58.000000

-中略-

COR: 346.410162 30.000000 0.019222 23.000000 39.000000 54.000000
COR: 0.000000 60.000000 0.186398 1.000000 1.000000 54.000000
COR: 60.000000 60.000000 0.014283 29.000000 62.000000 47.000000
COR: 120.000000 60.000000 0.014318 15.000000 46.000000 35.000000
COR: 180.000000 60.000000 0.186398 1.000000 1.000000 54.000000
COR: 240.000000 60.000000 0.014283 29.000000 62.000000 47.000000
COR: 300.000000 60.000000 0.014319 15.000000 46.000000 35.000000
COR: 360.000000 60.000000 0.186398 1.000000 1.000000 54.000000
COR: 0.000000 90.000000 0.305786 0.000000 1.000000 61.000000
CORMAX: 0.000000 -90.000000 0.305786 0.000000 1.000000 61.000000


-a のデータ

Outdata-CorMode3-mrcImage3DSymmetryFind.png
xy平面

Outdata1-CorMode3-mrcImage3DSymmetryFind.png
yz平面

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

-4.54771e-06 (32, 5, 39)

1.17132 (57, 32, 15)
0.00524255
0.0559384

0.000109255