「mrcImageAutoRotationCorrelation3D」の版間の差分

2013年6月26日 (水) 20:35時点における版

mrcImageAutoRotationCorrelation3DとはmrcImageファイルの３次元データ間の相関値を計算するためのEosのコマンドである。

アルゴリズム

オプション一覧

メインオプション

　　　　　　　　　　　　　　　　< 　　　　　　　　　　　　　　　　< 　　　　　　　　　　　　　　　　< 　　　　　　　　　　　　　　　　< 　　　　　　　　　　　　　　　　< 　　　　　　　　　　　　　　　　< 　　　　　　　　　　　　　　　　< 　　　　　　　　　　　　　　　　< 　　　　　　　　　　　　　　　　< 　　　　　　　　　　　　　　　　<

オプション	必須項目/選択項目	説明	デフォルト
-i	必須	入力テストファイル:mrcImage(INPUT)	NULL
-r	必須	参照テストファイル:mrcImage(INPUT)	NULL
-o	選択	出力ファイル:パラメータ	stdout(設定しなければ標準出力）
-cor	選択	出力ファイル:相関マップ	NULL
-fit	選択	類似度の一番高い位置、回転角でのテスト画像:mrcImage(OUTPUT)	NULL
-EA	選択	オイラー角の選択:４文字(INPUT)	YOYS
-Rot1	選択	オイラー角の第１角の範囲:min max delta(INPUT)	0.0 360.0 5.0
-Rot2	選択	オイラー角の第２角の範囲:min max delta(INPUT)	0.0 180.0 5.0
-Rot3	選択	オイラー角の第３角の範囲:min max delta(INPUT)	0.0 360.0 5.0
-Xrange	選択	min max (INPUT) [pixel] : 設定しなければ、Ｘ方向の全範囲	0 0
-Yrange	選択	min max (INPUT) [pixel] : 設定しなければ、Y方向の全範囲	0 0
-Zrange	選択	min max (INPUT) [pixel] : 設定しなければ、Z方向の全範囲	0 0
-M	選択	相関関数の選択：(INPUT)	0
-MR	選択	画像回転の取り扱い：(INPUT)　1: 平均値で周辺を埋める 0: 楕円体としての回転　+16:　直方体としての回転	0	単粒子であり、周辺が媒体と考えられる場合には、０が推奨、そうではなく、周辺まで像があるときには、１６が推奨
-m	選択	画像の補間モード：(INPUT); 0: 最近傍、1:１次補間、2:３次補間	0

モードの詳細

モード	説明

回転のモード: -MR

 0: padding 0 
 1: padding average 
 +0:  within ellipsoidal area.
 +16: within square area.

相関関数のモード: -M

0: Normal Correlation FxG*
1: Phase  Correlation FxG*/     |FxG*|
2: Phase  Correlation FxG*/sqrt(|FxG*|)
3: Normalized Normal Correlation FxG*/|F||G|)
16: (0,0) = 0

　補間のモード： -m

0: Nearest 
1: Bilinear
2: CubicConvolution

@@ 行117: / 行117: @@
 	</table>
-==== 相関関数のモード====
+==== 回転のモード:  -MR ====
+<pre>
+: padding 0
+: padding average
+ +0:  within ellipsoidal area.
+ +16: within square area.
+</pre>
+==== 相関関数のモード:  -M ====
 <pre>
 : Normal Correlation FxG*
@@ 行126: / 行135: @@
 </pre>
+====　補間のモード： -m ====
+<pre>
+: Nearest
+: Bilinear
+: CubicConvolution
+</pre>
 == 実行例 ==
 == 参考文献 ==