mrcImageModelSubfilamentsCreate

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mrcImageModelSubfilamentsCreateとはフィラメント画像を作るEosコマンドである。


オプション一覧

メインオプション

オプション 必須項目/選択項目 説明 デフォルト
-i 必須 入力ファイル: mrcImage NULL
-o 必須 出力ファイル: mrcImage NULL
-nx 選択 Real length = nx * lx 71
-ny 選択 Real length = ny * ly 71
-nz 選択 Real length = nz * lz 100
-lx 選択 ピクセルサイズ[Angstrom] 5.0
-ly 選択 ピクセルサイズ[Angstrom] 5.0
-lz 選択 ピクセルサイズ[Angstrom] 5.0
-position 選択 subfilaments position from center [A] 70
-n 選択 n-helix 3
-dphi 選択 回転角度 [degree] 1.395348837
-sphi 選択 start angle [degree] 0
-c 選択 コンフィグファイル設定 NULL
-m 選択 モードを設定 0
-h 選択 ヘルプを表示  
※nx, nyは奇数でなければならない

モードの詳細

モード 説明
0


実行例

入力ファイルの画像

Input-mrcImageModelSubfilamentsCreate.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

0 (0, 0, 0)

2.09707 (58, 41, 0)
0.00306044
0.0749793

0.00108666


オプション必須項目のみの場合

Outdata-mrcImageModelSubfilamentsCreate.png
xy平面

Outdata1-mrcImageModelSubfilamentsCreate.png
yz平面

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

0 (0, 0, 0)

1.98112 (31, 52, 0)
0.00741447
0.0893007

0.000125776


オプション -nx, -ny, -nz

nx=99, ny=99, nz=99で実行

Outdata-nxnynz-mrcImageModelSubfilamentsCreate.png
xy平面

Outdata1-nxnynz-mrcImageModelSubfilamentsCreate.png
yz平面

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

0 (0, 0, 0)

2.09707 (87, 56, 0)
0.00445187
0.0691579

5.70376e-05


オプション -lx, -ly, lz

lx=8, ly=8, lz=8で実行

Outdata-l-mrcImageModelSubfilamentsCreate.png
xy平面

Outdata1-l-mrcImageModelSubfilamentsCreate.png
yz平面

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

0 (0, 0, 0)

2.02889 (41, 2, 20)
0.00867218
0.0969264

0.000136516


オプション -position

position=35で実行

Outdata-position-mrcImageModelSubfilamentsCreate.png
xy平面

Outdata1-position-mrcImageModelSubfilamentsCreate.png
yz平面

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

0 (0, 0, 0)

2.09707 (66, 42, 0)
0.00869178
0.0977788

0.000137717

オプション -n

n=6で実行

Outdata-n-mrcImageModelSubfilamentsCreate.png
xy平面

Outdata1-n-mrcImageModelSubfilamentsCreate.png
yz平面

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

0 (0, 0, 0)

1.98112 (31, 52, 0)
0.0148289
0.125854

0.000177259

オプション -dphi

dphi=2で実行

Outdata-dphi-mrcImageModelSubfilamentsCreate.png
xy平面

Outdata1-dphi-mrcImageModelSubfilamentsCreate.png
yz平面

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

0 (0, 0, 0)

1.98112 (31, 52, 0)
0.00741588
0.0894188

0.000125942

オプション -sphi

sphi=90で実行

Outdata-sphi-mrcImageModelSubfilamentsCreate.png
xy平面

Outdata1-sphi-mrcImageModelSubfilamentsCreate.png
yz平面

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

0 (0, 0, 0)

1.98112 (18, 31, 0)
0.00741446
0.0893007

0.000125776