mrcImageMultiCTFCompensation

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mrcImageMultiCTFCompensationとは複数枚の画像からCTFの補正を行うEosコマンドである。


オプション一覧

メインオプション

オプション 必須項目/選択項目 説明 デフォルト
-i 必須 入力ファイル設定 stdin
-info2 選択 入力ファイルリスト設定: the same order as the input: ctfinfo from Display2/ctfDisplay stdin
-o 必須 出力ファイル設定(average file) stdout
-f 選択 出力ファイル設定(averaged fft file) stdout
-W 選択 ホワイトノイズ 1.0
-WR 選択 WhiteNoiseRaising 1.0
-SinWin 選択 Windowing by sine function from Rmin[/A] to Rmax[/A](SinWinRmin, SinWinRmax) (0.1, 1.0)
-MaxIter 選択 Max Iteration 10
-ctfMode 選択 CTFMode: refer to mrcImageCTFObservation 1
-solventMode 選択 If solvent flatterning is used, NEED 0
-solventSTD 選択 If solvent flatterning is used as mode=1, NEED -1.0
-Log 選択 stderr ログファイル名
-c 選択 コンフィグファイル設定 NULL
-m 選択 モードを設定 0
-h 選択 ヘルプを表示  

モードの詳細

モード 説明
0 CTF-weighted compensation, CTF/(SQR(CTF) + (NS)^2)
+1 Adding solvent-flattening process
+16 Without phase flipping, in case of images after phase only correction.

入力ファイルのフォーマット

filename0 deltaF[A] Cs[mm] kV[kV] ratioOfAmpToPhase
filename1 deltaF[A] Cs[mm] kV[kV] ratioOfAmpToPhase
     .                .            .           .                   .
     .                .            .           .                   .
     .                .            .           .                   .

Input: ctfinfo, with the same order as the input; from Display2/ctfDisplay

filename0.ctfinfo 
filename1.ctfinfo 
          .
          .
          .


実行例