mrcImageNormalizing

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mrcImageNormalizingとは画像の値の正規化を行うEosコマンドである。


オプション一覧

メインオプション

オプション 必須項目/選択項目 説明 デフォルト
-i 必須 入力ファイル: mrcImage NULL
-o 必須 出力ファイル: mrcImage NULL
-A 選択 A 1.0
-B 選択 B 0.0
-ContourMin 選択 輪郭の最小値 0.0
-ContourMax 選択 輪郭の最大値 1.0
-ContourSolvent 選択 溶媒の輪郭 0.0
-c 選択 コンフィグファイル設定 NULL
-m 選択 モードを設定 0
-h 選択 ヘルプを表示  

モードの詳細

モード 説明
0 Double Exponential: Solvent and Object

Fitting histgram to double exponentials as Solvent and Object

data = A*(data-MeanOfSolvent)/(MeanOfObject-MeanOfSolvent) + B
1 Min-Max: Background and Object
data = A*(data-Min)/(Max-Min) + B
2 Contour
data = A*(data-ContourMin)/(ContourMax-ContourMin) + B
3 Contour and Solvent

if data < ContourSolvent, data = ContourSolvent. After this, calculate the below.

data = A*(data-ContourMin)/(ContourMax-ContourMin) + B
4 No Estimation
data = A*data + B


実行例

入力ファイルの画像

Input-mrcImageNormalizing.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

0 (0, 0, 0)

255 (14, 5, 0)
82.357
119.241

1.49051

オプション必須項目のみの場合

Outdata-mrcImageNormalizing.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

0 (14, 5, 0)

1 (0, 0, 0)
0.677031
0.467611

0.00584514

オプション -A, -B

A=100, B=-94で実行

Outdata-m0-mrcImageNormalizing.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

4 (14, 5, 0)

5 (0, 0, 0)
4.67703
0.467611

0.00584514