ctfWeightMapCreation
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ctfWeightMapCreationとはEosのコマンドである。
オプション一覧
メインオプション
| オプション | 必須項目/選択項目 | 説明 | デフォルト |
|---|---|---|---|
| -o | 選択 | 出力ファイル設定: ASCII | stdout |
| -kV | 選択 | 加速電圧: [kV] | 200 |
| -Cs | 選択 | 球面収差係数: [mm] | 1.7 |
| -df | 必須 | デフォーカス量: [A] (+がアンダーフォーカス) | 2.7 |
| -white | 選択 | 白色ノイズ比(Noise/Signal) | 1.0 |
| -noise | 選択 | Noise Power Spectrum | NULL |
| -splusn | 選択 | Signal+Noise Power Spectrum | NULL |
| -dRinv | 必須 | dRinv[A] | 1024*5/3 |
| -dRmaxInv | 必須 | dRmaxInv[A] | 10.0 |
| -SinWin | 選択 | (RminInv[A], RmaxInv[A]) | (20.0, 10.0) |
| -c | 選択 | コンフィグファイル設定 | NULL |
| -m | 選択 | モードを設定 | 0 |
| -h | 選択 | ヘルプを表示 |
モードの詳細
| モード | 説明 |
|---|---|
| 0 | No correction : F = G |
| 1 | Phase contrast : F = G*(H/abs(H))(Only 1 or -1) |
| 2 | Phase contrast : F = G*H (Winer filter (S/N << 1)) |
| 3 | Phase contrast : F = G/H (Inverse filter) |
| 4 | Phase contrast : F = G*(H/(H*H + N*N)) (Winer filter (white noise : Required Option -white)) |
| 5 | Phase contrast : F = G*(H/abs(H)*abs(G*G-N*N)/(G*G)) (Winer filter: Required Option -noise, -splusn)) |
実行例
オプション必須項目のみの場合
df=2.7, dRinv=1024*5/3, dRmaxInv=10.0で実行
0.000000 1.000000 1.000000
0.000977 1.000000 -0.000000
0.001953 1.000000 -0.000001
0.002930 1.000000 -0.000002
0.003906 1.000000 -0.000003
0.004883 1.000000 -0.000005
0.005859 1.000000 -0.000007
0.006836 1.000000 -0.000009
0.007812 1.000000 -0.000011
0.008789 1.000000 -0.000014
-中略-
0.090820 1.000000 0.026869
0.091797 1.000000 0.028082
0.092773 1.000000 0.029335
0.093750 1.000000 0.030629
0.094727 1.000000 0.031964
0.095703 1.000000 0.033343
0.096680 1.000000 0.034765
0.097656 1.000000 0.036232
0.098633 1.000000 0.037744
0.099609 1.000000 0.039302
以降、df=2.7, dRinv=1024*5/3, dRmaxInv=10.0で実行
オプション -kV
kV=100で実行
0.000000 1.000000 1.000000
0.000977 1.000000 -0.000000
0.001953 1.000000 -0.000001
0.002930 1.000000 -0.000003
0.003906 1.000000 -0.000004
0.004883 1.000000 -0.000007
0.005859 1.000000 -0.000009
0.006836 1.000000 -0.000012
0.007812 1.000000 -0.000014
0.008789 1.000000 -0.000016
-中略-
0.090820 1.000000 0.089324
0.091797 1.000000 0.093274
0.092773 1.000000 0.097352
0.093750 1.000000 0.101561
0.094727 1.000000 0.105902
0.095703 1.000000 0.110378
0.096680 1.000000 0.114993
0.097656 1.000000 0.119748
0.098633 1.000000 0.124646
0.099609 1.000000 0.129690
オプション -Cs
Cs=2で実行
0.000000 1.000000 1.000000
0.000977 1.000000 -0.000000
0.001953 1.000000 -0.000001
0.002930 1.000000 -0.000002
0.003906 1.000000 -0.000003
0.004883 1.000000 -0.000005
0.005859 1.000000 -0.000007
0.006836 1.000000 -0.000009
0.007812 1.000000 -0.000011
0.008789 1.000000 -0.000013
-中略-
0.090820 1.000000 0.031918
0.091797 1.000000 0.033352
0.092773 1.000000 0.034832
0.093750 1.000000 0.036361
0.094727 1.000000 0.037939
0.095703 1.000000 0.039567
0.096680 1.000000 0.041247
0.097656 1.000000 0.042979
0.098633 1.000000 0.044765
0.099609 1.000000 0.046605
オプション -m
m=1で実行
0.000000 1.000000 1.000000
0.000977 -1.000000 -0.000000
0.001953 -1.000000 -0.000001
0.002930 -1.000000 -0.000002
0.003906 -1.000000 -0.000003
0.004883 -1.000000 -0.000005
0.005859 -1.000000 -0.000007
0.006836 -1.000000 -0.000009
0.007812 -1.000000 -0.000011
0.008789 -1.000000 -0.000014
-中略-
0.090820 1.000000 0.026869
0.091797 1.000000 0.028082
0.092773 1.000000 0.029335
0.093750 1.000000 0.030629
0.094727 1.000000 0.031964
0.095703 1.000000 0.033343
0.096680 1.000000 0.034765
0.097656 1.000000 0.036232
0.098633 1.000000 0.037744
0.099609 1.000000 0.039302
m=2で実行
0.000000 1.000000 1.000000
0.000977 -0.000000 -0.000000
0.001953 -0.000001 -0.000001
0.002930 -0.000002 -0.000002
0.003906 -0.000003 -0.000003
0.004883 -0.000005 -0.000005
0.005859 -0.000007 -0.000007
0.006836 -0.000009 -0.000009
0.007812 -0.000011 -0.000011
0.008789 -0.000014 -0.000014
-中略-
0.090820 0.026869 0.026869
0.091797 0.028082 0.028082
0.092773 0.029335 0.029335
0.093750 0.030629 0.030629
0.094727 0.031964 0.031964
0.095703 0.033343 0.033343
0.096680 0.034765 0.034765
0.097656 0.036232 0.036232
0.098633 0.037744 0.037744
0.099609 0.039302 0.039302
m=3で実行
その他のオプション設定なし
0.000000 1.000000 1.000000
0.000977 0.000000 -0.000000
0.001953 0.000000 -0.000001
0.002930 0.000000 -0.000002
0.003906 0.000000 -0.000003
0.004883 0.000000 -0.000005
0.005859 0.000000 -0.000007
0.006836 0.000000 -0.000009
0.007812 0.000000 -0.000011
0.008789 0.000000 -0.000014
-中略-
0.090820 0.000000 0.026869
0.091797 0.000000 0.028082
0.092773 0.000000 0.029335
0.093750 0.000000 0.030629
0.094727 0.000000 0.031964
0.095703 0.000000 0.033343
0.096680 0.000000 0.034765
0.097656 0.000000 0.036232
0.098633 0.000000 0.037744
0.099609 0.000000 0.039302
df=2.7, dRinv=64*5/3, dRmaxInv=1.0で実行
0.000000 1.000000 1.000000
0.015625 0.000000 -0.000027
0.031250 0.000000 0.000194
0.046875 0.000000 0.001564
0.062500 0.000000 0.005590
0.078125 0.000000 0.014376
0.093750 0.000000 0.030629
0.109375 0.000000 0.057639
0.125000 0.000000 0.099237
0.140625 6.263639 0.159652
0.156250 4.112921 0.243136
0.171875 2.831935 0.353115
-中略-
0.843750 -1.971417 -0.507249
0.859375 0.000000 0.005251
0.875000 1.009738 0.990356
0.890625 1.608352 0.621754
0.906250 1.289093 0.775739
0.921875 1.170360 0.854438
0.937500 -1.052999 -0.949668
0.953125 1.005029 0.994997
0.968750 -3.063165 -0.326460
0.984375 -1.204873 -0.829963
1.000000 -2.392987 -0.417888
m=4で実行
その他のオプション設定なし
0.000000 1.000000 1.000000
0.000977 -4940297.000000 -0.000000
0.001953 -1242119.125000 -0.000001
0.002930 -557351.375000 -0.000002
0.003906 -317780.156250 -0.000003
0.004883 -207004.218750 -0.000005
0.005859 -146954.187500 -0.000007
0.006836 -110884.648438 -0.000009
0.007812 -87629.039062 -0.000011
0.008789 -71859.500000 -0.000014
-中略-
0.090820 37.217903 0.026869
0.091797 35.610458 0.028082
0.092773 34.089443 0.029335
0.093750 32.649300 0.030629
0.094727 31.284903 0.031964
0.095703 29.991486 0.033343
0.096680 28.764643 0.034765
0.097656 27.600285 0.036232
0.098633 26.494612 0.037744
0.099609 25.444090 0.039302
SinWin=(15, 5)で実行
0.000000 1.000000 1.000000
0.000977 -4940297.000000 -0.000000
0.001953 -1242119.125000 -0.000001
0.002930 -557351.375000 -0.000002
0.003906 -317780.156250 -0.000003
0.004883 -207004.218750 -0.000005
0.005859 -146954.187500 -0.000007
0.006836 -110884.648438 -0.000009
0.007812 -87629.039062 -0.000011
0.008789 -71859.500000 -0.000014
-中略-
0.090820 34.284809 0.026869
0.091797 32.579319 0.028082
0.092773 30.965157 0.029335
0.093750 29.436731 0.030629
0.094727 27.988871 0.031964
0.095703 26.616741 0.033343
0.096680 25.315859 0.034765
0.097656 24.082047 0.036232
0.098633 22.911407 0.037744
0.099609 21.800304 0.039302
m=5, -noise, -splusnを指定で実行
df=2.7, dRinv=1024*5/3, dRmaxInv=32で実行
-noiseのファイルの画像
 |
最小 最大 |
-3.42794 (71, 0, 0) 3.56337 (70, 30, 0) |
-splusnのファイルの画像
 |
最小 最大 |
-18651.7 (10, 1, 0) 52942.7 (24, 39, 0) |
出力結果
This mode will ignore -dRmax and -dR options
0.000000 1.000000 1.000000
0.012500 -1.000000 -0.000023
0.025000 1.000000 0.000031
0.037500 1.000000 0.000533
0.050000 1.000000 0.002098
0.062500 1.000000 0.005590
0.075000 1.000000 0.012116
0.087500 1.000000 0.023034
0.100000 1.000000 0.039938
0.112500 1.000000 0.064660
0.125000 1.000000 0.099237
0.137500 1.000000 0.145855
0.150000 1.000000 0.206721
0.162500 1.000000 0.283817
0.175000 1.000000 0.378439
0.187500 1.000000 0.490411
0.200000 1.000000 0.616825
0.212500 1.000000 0.750193
0.225000 1.000000 0.876038
0.237500 1.000000 0.970358
0.250000 1.000000 0.998231
0.262500 1.000000 0.916192
0.275000 1.000000 0.682602
0.287500 1.000000 0.280724
0.300000 -1.000000 -0.244868
0.312500 -1.000000 -0.751460
0.325000 -1.000000 -0.999174
0.337500 -1.000000 -0.750135
0.350000 1.000000 0.004719
0.362500 1.000000 0.815910
0.375000 1.000000 0.906149
0.387500 -1.000000 -0.030004
0.400000 -1.000000 -0.966833
