mrcImage3DPad2

mrcImage3DPad2とはフィラメントまたは粒子のmrcImage(3D)に対してパディングを行うEosのコマンドである。出力ファイルのzサイズがmrcImage3DPadと異なる。

オプション一覧

メインオプション

オプション	必須項目/選択項目	説明	デフォルト
-i	必須	入力ファイル: mrcImage	NULL
-o	必須	出力ファイル: mrcImage	NULL
-r	選択	境界の半径(-M 参照)	Nx
-w	選択	スロープの幅(m=1で使用)	1
-v	選択	パディング値	0
-Nx	選択	出力ファイルのNx	入力ファイルのNx
-Ny	選択	出力ファイルのNy	入力ファイルのNy
-Nz	選択	出力ファイルのNz	入力ファイルのNz
-Floating	選択	フローティング
-c	選択	コンフィグファイル設定	NULL
-m	選択	パディング値の算出方法を設定	0
-M	選択	-r の算出方法を設定	0
-h	選択	ヘルプを表示

-m の詳細

モード	説明
0	平均値でパディングする
1	余弦関数を掛ける

パディング値は-v が優先される

-M の詳細

モード	説明
0	フィラメント用(半径を軸から算出する)
1	粒子用(半径を中心から算出する)

実行例

入力ファイルの画像

xy平面

yz平面

最小 最大 平均値 標準偏差 標準誤差

-0.307724 (52, 10, 79) 1.52145 (47, 41, 47) 0.00295664 0.0916201 0.000132783

オプション必須項目のみの場合

出力結果

Tailer: 0
Program Start
TailerNum 0
r: 34 

出力画像

xy平面

yz平面

最小 最大 平均値 標準偏差 標準誤差

-0.307724 (52, 10, 79) 1.52145 (47, 41, 47) 0.00295664 0.0916201 0.000132783

デフォルト設定の場合、画像に変化はない

オプション　-Nx, -Ny, -Nz

Nx=50, Ny=50, Nz=75で実行

出力結果

Tailer: 0
Program Start
TailerNum 0
r: 34 

出力画像

xy平面

yz平面

最小 最大 平均値 標準偏差 標準誤差

-0.295151 (23, 12, 71) 1.52145 (38, 32, 47) 0.0057768 0.106019 0.000212039

オプション　-r

r=20で実行

出力結果

Tailer: 0
Program Start
TailerNum 0
r: 20 

出力画像

xy平面

yz平面

最小 最大 平均値 標準偏差 標準誤差

-0.295151 (32, 21, 71) 1.52145 (47, 41, 47) 0.00236564 0.0675752 9.79351e-05