mrcImage3DPad2
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mrcImage3DPad2とはフィラメントまたは粒子のmrcImage(3D)に対してパディングを行うEosのコマンドである。出力ファイルのzサイズがmrcImage3DPadと異なる。
目次
オプション一覧
メインオプション
オプション | 必須項目/選択項目 | 説明 | デフォルト |
---|---|---|---|
-i | 必須 | 入力ファイル: mrcImage | NULL |
-o | 必須 | 出力ファイル: mrcImage | NULL |
-r | 選択 | 境界の半径(-M 参照) | Nx |
-w | 選択 | スロープの幅(m=1で使用) | 1 |
-v | 選択 | パディング値 | 0 |
-Nx | 選択 | 出力ファイルのNx | 入力ファイルのNx |
-Ny | 選択 | 出力ファイルのNy | 入力ファイルのNy |
-Nz | 選択 | 出力ファイルのNz | 入力ファイルのNz |
-Floating | 選択 | フローティング | |
-c | 選択 | コンフィグファイル設定 | NULL |
-m | 選択 | パディング値の算出方法を設定 | 0 |
-M | 選択 | -r の算出方法を設定 | 0 |
-h | 選択 | ヘルプを表示 |
-m の詳細
モード | 説明 |
---|---|
0 | 平均値でパディングする |
1 | 余弦関数を掛ける |
パディング値は-v が優先される
-M の詳細
モード | 説明 |
---|---|
0 | フィラメント用(半径を軸から算出する) |
1 | 粒子用(半径を中心から算出する) |
実行例
入力ファイルの画像
最小 最大 |
-0.307724 (52, 10, 79) 1.52145 (47, 41, 47) |
オプション必須項目のみの場合
出力結果
Tailer: 0 Program Start TailerNum 0 r: 34
出力画像
最小 最大 |
-0.307724 (52, 10, 79) 1.52145 (47, 41, 47) |
デフォルト設定の場合、画像に変化はない
オプション -Nx, -Ny, -Nz
Nx=50, Ny=50, Nz=75で実行
出力結果
Tailer: 0 Program Start TailerNum 0 r: 34
出力画像
最小 最大 |
-0.295151 (23, 12, 71) 1.52145 (38, 32, 47) |
オプション -r
r=20で実行
出力結果
Tailer: 0 Program Start TailerNum 0 r: 20
出力画像
最小 最大 |
-0.295151 (32, 21, 71) 1.52145 (47, 41, 47) |