mrcImageCorrelation

mrcImageCorrelationは相関図を作成するEosのコマンドである。

オプション一覧

メインオプション

オプション	必須項目/選択項目	説明	デフォルト
-i	必須	入力ファイル設定: mrcImage	NULL
-o	選択	出力ファイル設定: mrcImage(相関マップ)	NULL
-O	選択	出力ファイル設定: mrcImage(相関マップ2)	NULL
-r	必須	参照ファイル設定: mrcImage	NULL
-corInfo	選択	相関関係の詳細をファイルに書き込む: ASCII	stdout
-a	選択	２つの画像の平均画像ファイル: mrcImage	NULL
-s	選択	入力ファイルを参照ファイルに最も近くなるようにシフトする: mrcImage	NULL
-refine	選択	改良点を設定	(RefineStep RefineRange RefineMode)→(0.25 3.0 2) RefineStep：刻み幅の設定 RefineRange：範囲の設定 RefineMode：モードの設定
-c	選択	コンフィグファイル設定	NULL
-m	選択	モード１	0
-M	選択	モード２	0
-h	選択	ヘルプを表示

モード１の詳細

モード	説明
0	正規相関：FxG*
1	位相相関：FxG*/|FxG*|
2	位相相関：FxG*/sqrt(|FxG*|)
3	標準化された正規相関：FxG*/(|F||G|)
16	(0,0) = 0

モード２の詳細

モード	説明
0	高速フーリエ変換による相関関係。出力はmrcImageファイル
1	正規空間で増える位相関係。出力は実際の値で表示される

実行例

------入力ファイルの画像------

ノイズあり				ノイズなし
	最小 最大 平均値 標準偏差 標準誤差	-45.2205 61.1583 1.34228 13.1981 0.164976			最小 最大 平均値 標準偏差 標準誤差	0 39.0578 1.30214 5.13643 0.0642053

------参照ファイルの画像------

最小 最大 平均値 標準偏差 標準誤差

-44.5884 62.2917 1.20602 13.084 0.16355

最小 最大 平均値 標準偏差 標準誤差

0 40.8834 1.30222 5.16838 0.0646047

------オプション　-o------

最小 最大 平均値 標準偏差 標準誤差

-696.555 2670.19 129.504 439.371 5.49214

最小 最大 平均値 標準偏差 標準誤差

-0.000195313 2169.32 135.653 368.225 4.60281

入力画像をどの程度移動すると参照画像に近くなるかが分かる。

------オプション　-O------

オプション-Oでは、オプション-refineを設定しなければならない

-refineを1.75 70 0に設定

最小 最大 平均値 標準偏差 標準誤差

1.23885 1.44004 1.39867 0.0198941 0.000245606

最小 最大 平均値 標準偏差 標準誤差

0.262565 1.41038 1.31497 0.177727 0.00219416

-refineを1.75 70 1に設定

最小 最大 平均値 標準偏差 標準誤差

1.45204 1.63609 1.56799 0.0183415 0.000226438

最小 最大 平均値 標準偏差 標準誤差

0.696388 1.63042 1.51598 0.109251 0.00134878

-refineを1.75 70 2に設定

最小 最大 平均値 標準偏差 標準誤差

1.71269 1.86756 1.81222 0.0163492 0.000201842

最小 最大 平均値 標準偏差 標準誤差

1.12474 1.99758 1.77708 0.097391 0.00120236

------オプション　-corInfo------

下記のようなデータが格納されたファイルが作成される

オプション-Mが0の場合

オプション-Mが1の場合

------オプション　-a------

最小 最大 平均値 標準偏差 標準誤差

-35.1267 59.0675 1.27415 10.1106 0.126383

最小 最大 平均値 標準偏差 標準誤差

0 38.1336 1.30218 5.09747 0.0637183

------オプション　-s------

最小 最大 平均値 標準偏差 標準誤差

-44.5884 62.2917 1.20602 13.084 0.16355

最小 最大 平均値 標準偏差 標準誤差

0 39.0578 1.30214 5.13643 0.0642053

------オプション　-m------

モード：０

最小 最大 平均値 標準偏差 標準誤差

-696.555 2670.19 129.504 439.371 5.49214

最小 最大 平均値 標準偏差 標準誤差

-0.000195313 2169.32 135.653 368.225 4.60281

モード：１

最小 最大 平均値 標準偏差 標準誤差

-3.67017 3.71466 0.0125 0.999922 0.012499

最小 最大 平均値 標準偏差 標準誤差

-9.80742 7.48342 0.0125 0.999922 0.012499

モード：２

最小 最大 平均値 標準偏差 標準誤差

-44.7368 62.2468 1.27232 11.938 0.149225

最小 最大 平均値 標準偏差 標準誤差

-6.01609 44.7194 1.30218 5.11859 0.0639824

モード：３

最小 最大 平均値 標準偏差 標準誤差

-0.0672328 0.257732 0.0125 0.0424089 0.000530111

最小 最大 平均値 標準偏差 標準誤差

-1.78814e-08 0.199896 0.0125 0.0339307 0.000424134

モード：１６

最小 最大 平均値 標準偏差 標準誤差

-826.059 2540.68 -5.7012e-07 439.371 5.49214

最小 最大 平均値 標準偏差 標準誤差

-135.653 2033.67 1.28926e-07 368.225 4.60281