mrcImageCorrelation

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mrcImageCorrelationは相関図を作成するEosコマンドである。

オプション一覧

メインオプション

オプション 必須項目/選択項目 説明 デフォルト
-i 必須 入力ファイル設定: mrcImage NULL
-o 選択 出力ファイル設定: mrcImage(相関マップ) NULL
-O 選択 出力ファイル設定: mrcImage(相関マップ2) NULL
-r 必須 参照ファイル設定: mrcImage NULL
-corInfo 選択 相関関係の詳細をファイルに書き込む: ASCII stdout
-a 選択 2つの画像の平均画像ファイル: mrcImage NULL
-s 選択 入力ファイルを参照ファイルに最も近くなるようにシフトする: mrcImage NULL
-refine 選択 改良点を設定 (RefineStep RefineRange RefineMode)→(0.25 3.0 2)

RefineStep:刻み幅の設定
RefineRange:範囲の設定

RefineMode:モードの設定
-c 選択 コンフィグファイル設定 NULL
-m 選択 モード1 0
-M 選択 モード2 0
-h 選択 ヘルプを表示  

モード1の詳細

モード 説明
0 正規相関:FxG*
1 位相相関:FxG*/|FxG*|
2 位相相関:FxG*/sqrt(|FxG*|)
3 標準化された正規相関:FxG*/(|F||G|)
16 (0,0) = 0

モード2の詳細

モード 説明
0 高速フーリエ変換による相関関係。出力はmrcImageファイル
1 正規空間で増える位相関係。出力は実際の値で表示される



実行例

------入力ファイルの画像------

ノイズあり      ノイズなし
B112-mrcImageCorrelation.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

-45.2205

61.1583
1.34228
13.1981

0.164976

A044-mrcImageCorrelation.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

0

39.0578
1.30214
5.13643

0.0642053

------参照ファイルの画像------

B116-mrcImageCorrelation.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

-44.5884

62.2917
1.20602
13.084

0.16355

B060-mrcImageCorrelation.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

0

40.8834
1.30222
5.16838

0.0646047

------オプション -o------

B116.out-mrcImageCorrelation.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

-696.555

2670.19
129.504
439.371

5.49214

A044.out-mrcImageCorrelation.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

-0.000195313

2169.32
135.653
368.225

4.60281

入力画像をどの程度移動すると参照画像に近くなるかが分かる。

------オプション -O------

オプション-Oでは、オプション-refineを設定しなければならない

-refineを1.75 70 0に設定

B116.Out0-mrcImageCorrelation.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

1.23885

1.44004
1.39867
0.0198941

0.000245606

A044.Out0-mrcImageCorrelation.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

0.262565

1.41038
1.31497
0.177727

0.00219416

-refineを1.75 70 1に設定

B116.Out1-mrcImageCorrelation.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

1.45204

1.63609
1.56799
0.0183415

0.000226438

A044.Out1-mrcImageCorrelation.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

0.696388

1.63042
1.51598
0.109251

0.00134878

-refineを1.75 70 2に設定

B116.Out2-mrcImageCorrelation.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

1.71269

1.86756
1.81222
0.0163492

0.000201842

A044.Out2-mrcImageCorrelation.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

1.12474

1.99758
1.77708
0.097391

0.00120236

------オプション -corInfo------

下記のようなデータが格納されたファイルが作成される

オプション-Mが0の場合

A044.out-cM0-mrcImageCorrelation.png

オプション-Mが1の場合

A044.out-cM1-mrcImageCorrelation.png

------オプション -a------

B116.out-a1-mrcImageCorrelation.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

-35.1267

59.0675
1.27415
10.1106

0.126383

A044.Out-a1-mrcImageCorrelation.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

0

38.1336
1.30218
5.09747

0.0637183

------オプション -s------

B116.out-s1-mrcImageCorrelation.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

-44.5884

62.2917
1.20602
13.084

0.16355

A044.Out-s1-mrcImageCorrelation.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

0

39.0578
1.30214
5.13643

0.0642053

------オプション -m------

モード:0

B116.out-mrcImageCorrelation.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

-696.555

2670.19
129.504
439.371

5.49214

A044.out-mrcImageCorrelation.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

-0.000195313

2169.32
135.653
368.225

4.60281

モード:1

B116.out-m1-mrcImageCorrelation.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

-3.67017

3.71466
0.0125
0.999922

0.012499

A044.out-m1-mrcImageCorrelation.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

-9.80742

7.48342
0.0125
0.999922

0.012499

モード:2

B116.out-m2-mrcImageCorrelation.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

-44.7368

62.2468
1.27232
11.938

0.149225

A044.out-m2-mrcImageCorrelation.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

-6.01609

44.7194
1.30218
5.11859

0.0639824

モード:3

B116.out-m3-mrcImageCorrelation.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

-0.0672328

0.257732
0.0125
0.0424089

0.000530111

A044.out-m3-mrcImageCorrelation.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

-1.78814e-08

0.199896
0.0125
0.0339307

0.000424134

モード:16

B116.out-m16-mrcImageCorrelation.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

-826.059

2540.68
-5.7012e-07
439.371

5.49214

A044.out-m16-mrcImageCorrelation.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

-135.653

2033.67
1.28926e-07
368.225

4.60281