mrcImageFilterCreate

mrcImageFilterCreateとはASCIIデータからmrcImage画像を作り出すEosのコマンドである。

オプション一覧

メインオプション

オプション	必須項目/選択項目	説明	デフォルト
-i	選択	入力ファイル: ASCII	stdin
-o	選択	出力ファイル: mrcImage	stdout
-nx	必須	ImageSize: x	512
-ny	選択	ImageSize: y	512
-nz	選択	ImageSize: z	1
-sx	必須	FilterSize: x	3
-sy	選択	FilterSize: y	3
-sz	選択	FilterSize: z	1
-v	選択	Verbose
-c	選択	コンフィグファイル設定	NULL
-M	選択	Filter shape: 未実装	0
-m	選択	モードを設定	2
-h	選択	ヘルプを表示

-m の詳細

モード	説明
2	mrcImageを出力

入力ファイルのフォーマット

x1 y1 z1 weight1
x2 y2 z2 weight2
 .    .    .        .
 .    .    .        .

実行例

入力ファイル

20	20	0	200
20	21	0	200
20	22	0	200
20	23	0	200
20	24	0	200
20	25	0	200

-中略-

20	37	0	200
20	38	0	200
20	39	0	200
21	20	0	200
21	21	0	200
21	22	0	200
21	23	0	200

-中略-

39	37	0	200
39	38	0	200
39	39	0	200
0	0	0	200
1	1	0	200
2	2	0	200
3	3	0	200

-中略-

57	57	0	200
58	58	0	200
59	59	0	200
0	59	0	200
1	58	0	200
2	57	0	200
3	56	0	200

-中略-

17	42	0	200
18	41	0	200
19	40	0	200
40	19	0	200
41	18	0	200
42	17	0	200
43	16	0	200

-中略-

54	5	0	200
55	4	0	200
56	3	0	200
57	2	0	200
58	1	0	200
59	0	0	200

オプション必須項目のみの場合

nx=512, sx=3で実行

最小 最大 平均値 標準偏差 標準誤差

0 (3, 0, 0) 200 (0, 0, 0) 0.674438 11.5945 0.0226455

オプション　-nx, -ny, -nz

nx=60, ny=60, nz=1, sx=3で実行

最小 最大 平均値 標準偏差 標準誤差

0 (3, 0, 0) 200 (0, 0, 0) 48 85.4166 1.42361

オプション　-sx, -sy, -sz

sx=1, sy=2, sz=1, nx=60, ny=60, nz=1で実行

最小 最大 平均値 標準偏差 標準誤差

0 (1, 0, 0) 200 (0, 0, 0) 32.1111 73.4241 1.22374

オプション　-v

v, nx=60, ny=60, nz=1, sx=3で実行

np 480
p 0 20.000000 20.000000 0.000000 200.000000
p 1 20.000000 21.000000 0.000000 200.000000
p 2 20.000000 22.000000 0.000000 200.000000
p 3 20.000000 23.000000 0.000000 200.000000
p 4 20.000000 24.000000 0.000000 200.000000
p 5 20.000000 25.000000 0.000000 200.000000
p 6 20.000000 26.000000 0.000000 200.000000
p 7 20.000000 27.000000 0.000000 200.000000
p 8 20.000000 28.000000 0.000000 200.000000
p 9 20.000000 29.000000 0.000000 200.000000
p 10 20.000000 30.000000 0.000000 200.000000

-中略-

p 470 50.000000 9.000000 0.000000 200.000000
p 471 51.000000 8.000000 0.000000 200.000000
p 472 52.000000 7.000000 0.000000 200.000000
p 473 53.000000 6.000000 0.000000 200.000000
p 474 54.000000 5.000000 0.000000 200.000000
p 475 55.000000 4.000000 0.000000 200.000000
p 476 56.000000 3.000000 0.000000 200.000000
p 477 57.000000 2.000000 0.000000 200.000000
p 478 58.000000 1.000000 0.000000 200.000000
p 479 59.000000 0.000000 0.000000 200.000000
Size 3 3 1
N    60 60 1
Shape Square
outputMode 2

画像に変化はない

オプション　-M

M=1, nx=60, ny=60, nz=1, sx=3で実行

最小 最大 平均値 標準偏差 標準誤差

0 (2, 0, 0) 200 (0, 0, 0) 39.5556 79.6647 1.32775