mrcImageFloating

mrcImageFloatingとはmrcImageをフローティングするEosのコマンドである。

オプション一覧

メインオプション

オプション	必須項目/選択項目	説明	デフォルト
-i	必須	入力ファイル: mrcImage	NULL
-o	必須	出力ファイル: mrcImage	NULL
-v	選択	入力: Value: 実数（平均値として設定する値）	0.0
-rmax	選択	入力: rmax: 実数	rmax=MIN(Nx,Ny[,Nz])
-c	選択	コンフィグファイル設定	NULL
-m	選択	モードを設定	0
-h	選択	ヘルプを表示

モードの詳細

モード	説明
0	All Mean
1	Sphere Surface Mean (rmax)
2	Cylinder Surface Mean (rmax)
3	Edge Pixels

実行例

入力ファイルの画像

最小 最大 平均値 標準偏差 標準誤差

-50.1272 (73, 46, 0) 270.385 (49, 32, 0) 20.9833 49.3141 0.616426

オプション必須項目のみの場合

最小 最大 平均値 標準偏差 標準誤差

-71.1105 (73, 46, 0) 249.402 (49, 32, 0) -3.2678e-07 49.3141 0.616426

デフォルトでは平均値を0としてフローティングする。

オプション -v

v=10で実行

最小 最大 平均値 標準偏差 標準誤差

-61.1105 (73, 46, 0) 259.402 (49, 32, 0) 10 49.3141 0.616426

オプション -m

m=1で実行

その他のオプション変更無しで実行

rmax from caliculate:97.500000
HeaderNx should be odd
HeaderNy should be odd
meanOfSphereSurface 0.00544438 at rmax 97.5[A]

最小 最大 平均値 標準偏差 標準誤差

-50.1326 (73, 46, 0) 270.38 (49, 32, 0) 20.9779 49.3141 0.616426

rmax=20で実行

rmax from option:20.000000
HeaderNx should be odd
HeaderNy should be odd
meanOfSphereSurface 6.12671 at rmax 20[A]

最小 最大 平均値 標準偏差 標準誤差

-56.2539 (73, 46, 0) 264.259 (49, 32, 0) 14.8566 49.3141 0.616426

m=2で実行

その他のオプション変更無しで実行

rmax from caliculate:97.500000
HeaderNx should be odd
HeaderNy should be odd
meanOfCylinderSurface 0.664563 at rmax 97.5[A]

最小 最大 平均値 標準偏差 標準誤差

-50.7917 (73, 46, 0) 269.721 (49, 32, 0) 20.3188 49.3141 0.616426

rmax=20で実行

rmax from option:20.000000
HeaderNx should be odd
HeaderNy should be odd
meanOfCylinderSurface 154.616 at rmax 20[A]

最小 最大 平均値 標準偏差 標準誤差

-204.743 (73, 46, 0) 115.769 (49, 32, 0) -133.633 49.3141 0.616426

m=3で実行

最小 最大 平均値 標準偏差 標準誤差

-49.4715 (73, 46, 0) 271.041 (49, 32, 0) 21.639 49.3141 0.616426