mrcImageRefCreate

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mrcImageRefCreateとは3次元再構成にて使用する参照投影像を作成するEosコマンドである。


オプション一覧

メインオプション

オプション 必須項目/選択項目 説明 デフォルト
-i 必須 入力ファイル: mrcImage(3D) NULL
-o 必須 出力ファイル: mrcImage(2Dセット) NULL
-p 選択 回転の中心: [degree]: (Phi, Omega, Alpha) (0, 0, 0)
-w 選択 回転の範囲: [±degree]: (Phi, Omega, Alpha) (360, 10, 10)
-d 選択 回転の間隔: [degree]: (Phi, Omega, Alpha) (5, 5, 5)
-x 選択 出力ファイルのx長 入力ファイルのx長
-c 選択 コンフィグファイル設定 NULL
-m 選択 モードを設定 0
-h 選択 ヘルプを表示  
Phi: Z軸周り, Omega: Y軸周り, Alpha: x軸周り

モードの詳細

モード 説明
0 通常
1 分子間距離を変更せずに倍率を変更


実行例

入力ファイルの画像

Input-121P1.png
xy平面

Input1-121P1.png
yz平面

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

0 (0, 0, 0)

3500.79 (24, 28, 5)
88.3104
323.414

0.914753


オプション -w

w=(30, 0, 0)で実行

Outdata-w-mrcImageRefCreate.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

-618.193 (35, 39, 6)

37724 (22, 29, 11)
4099.57
5776.94

30.879


z=0(ヘッダ)をmrcImageMakeDumpで見た場合
0 0 0 
1 0 0 
2 0 0 
3 0 5 
4 0 5 
5 0 5 
6 0 30 
7 0 0 
8 0 0 
9 0 0 
10 0 0 
11 0 0 
12 0 0 
13 0 0 
14 0 0 
15 0 0 

-以下略-


w=(0, 15, 0)で実行

Outdata1-w-mrcImageRefCreate.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

-847.927 (14, 27, 4)

33249 (13, 17, 5)
5834.45
6371.51

59.158


z=0(ヘッダ)をmrcImageMakeDumpで見た場合
0 0 0 
1 0 0 
2 0 0 
3 0 5 
4 0 5 
5 0 5 
6 0 0 
7 0 15 
8 0 0 
9 0 0 
10 0 0 
11 0 0 
12 0 0 
13 0 0 
14 0 0 
15 0 0 

-以下略-


w=(0, 0, 15)で実行

Outdata2-w-mrcImageRefCreate.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

-1630.77 (24, 32, 7)

29967.2 (28, 19, 1)
4257.55
5978.44

45.3746


z=0(ヘッダ)をmrcImageMakeDumpで見た場合
0 0 0 
1 0 0 
2 0 0 
3 0 5 
4 0 5 
5 0 5 
6 0 0 
7 0 0 
8 0 15 
9 0 0 
10 0 0 
11 0 0 
12 0 0 
13 0 0 
14 0 0 
15 0 0 

-以下略-


オプション -d

d=(30, 5, 5), w=(180, 0, 0)で実行

Outdata-d-mrcImageRefCreate.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

-581.161 (19, 13, 3)

36079.7 (23, 28, 5)
4099.7
5771.83

30.8517


z=0(ヘッダ)をmrcImageMakeDumpで見た場合
0 0 0 
1 0 0 
2 0 0 
3 0 30 
4 0 5 
5 0 5 
6 0 180 
7 0 0 
8 0 0 
9 0 0 
10 0 0 
11 0 0 
12 0 0 
13 0 0 
14 0 0 
15 0 0 

-以下略-


オプション -p

p=(30, 0, 0), w=(30, 0, 0)で実行

Outdata-p-mrcImageRefCreate.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

-586.437 (45, 25, 4)

42135.5 (31, 26, 12)
4099.79
5869.56

31.3741


z=0(ヘッダ)をmrcImageMakeDumpで見た場合
0 0 30 
1 0 0 
2 0 0 
3 0 5 
4 0 5 
5 0 5 
6 0 30 
7 0 0 
8 0 0 
9 0 0 
10 0 0 
11 0 0 
12 0 0 
13 0 0 
14 0 0 
15 0 0 

-以下略-


オプション -x

x=30, w=(30, 0, 0)で実行

Outdata-x-mrcImageRefCreate.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

-618.193 (25, 39, 6)

37724 (12, 29, 11)
6170.05
6385.51

44.0642


z=0(ヘッダ)をmrcImageMakeDumpで見た場合
0 0 0 
1 0 0 
2 0 0 
3 0 5 
4 0 5 
5 0 5 
6 0 30 
7 0 0 
8 0 0 
9 0 0 
10 0 0 
11 0 0 
12 0 0 
13 0 0 
14 0 0 
15 0 0 

-以下略-


オプション -m

m=1, w=(0, 15, 0)で実行

Outdata-m-mrcImageRefCreate.png

最小

最大
平均値
標準偏差

標準誤差

-3757.87 (20, 0, 7)

32675.7 (13, 17, 5)
5959.8
6481.03

60.1748


z=0(ヘッダ)をmrcImageMakeDumpで見た場合
0 0 0 
1 0 0 
2 0 0 
3 0 5 
4 0 5 
5 0 5 
6 0 0 
7 0 15 
8 0 0 
9 0 0 
10 0 0 
11 0 0 
12 0 0 
13 0 0 
14 0 0 
15 0 0 

-以下略-