mrcImageRefCreate

mrcImageRefCreateとは３次元再構成にて使用する参照投影像を作成するEosのコマンドである。

オプション一覧

メインオプション

オプション	必須項目/選択項目	説明	デフォルト
-i	必須	入力ファイル: mrcImage(3D)	NULL
-o	必須	出力ファイル: mrcImage(2Dセット)	NULL
-p	選択	回転の中心: [degree]: (Phi, Omega, Alpha)	(0, 0, 0)
-w	選択	回転の範囲: [±degree]: (Phi, Omega, Alpha)	(360, 10, 10)
-d	選択	回転の間隔: [degree]: (Phi, Omega, Alpha)	(5, 5, 5)
-x	選択	出力ファイルのx長	入力ファイルのx長
-c	選択	コンフィグファイル設定	NULL
-m	選択	モードを設定	0
-h	選択	ヘルプを表示

Phi: Z軸周り, Omega: Y軸周り, Alpha: x軸周り

モードの詳細

モード	説明
0	通常
1	分子間距離を変更せずに倍率を変更

実行例

入力ファイルの画像

xy平面

yz平面

最小 最大 平均値 標準偏差 標準誤差

0 (0, 0, 0) 3500.79 (24, 28, 5) 88.3104 323.414 0.914753

オプション　-w

w=(30, 0, 0)で実行

最小 最大 平均値 標準偏差 標準誤差

-618.193 (35, 39, 6) 37724 (22, 29, 11) 4099.57 5776.94 30.879

z=0(ヘッダ)をmrcImageMakeDumpで見た場合

0 0 0 
1 0 0 
2 0 0 
3 0 5 
4 0 5 
5 0 5 
6 0 30 
7 0 0 
8 0 0 
9 0 0 
10 0 0 
11 0 0 
12 0 0 
13 0 0 
14 0 0 
15 0 0 

-以下略-

w=(0, 15, 0)で実行

最小 最大 平均値 標準偏差 標準誤差

-847.927 (14, 27, 4) 33249 (13, 17, 5) 5834.45 6371.51 59.158

z=0(ヘッダ)をmrcImageMakeDumpで見た場合

0 0 0 
1 0 0 
2 0 0 
3 0 5 
4 0 5 
5 0 5 
6 0 0 
7 0 15 
8 0 0 
9 0 0 
10 0 0 
11 0 0 
12 0 0 
13 0 0 
14 0 0 
15 0 0 

-以下略-

w=(0, 0, 15)で実行

最小 最大 平均値 標準偏差 標準誤差

-1630.77 (24, 32, 7) 29967.2 (28, 19, 1) 4257.55 5978.44 45.3746

z=0(ヘッダ)をmrcImageMakeDumpで見た場合

0 0 0 
1 0 0 
2 0 0 
3 0 5 
4 0 5 
5 0 5 
6 0 0 
7 0 0 
8 0 15 
9 0 0 
10 0 0 
11 0 0 
12 0 0 
13 0 0 
14 0 0 
15 0 0 

-以下略-

オプション　-d

d=(30, 5, 5), w=(180, 0, 0)で実行

最小 最大 平均値 標準偏差 標準誤差

-581.161 (19, 13, 3) 36079.7 (23, 28, 5) 4099.7 5771.83 30.8517

z=0(ヘッダ)をmrcImageMakeDumpで見た場合

0 0 0 
1 0 0 
2 0 0 
3 0 30 
4 0 5 
5 0 5 
6 0 180 
7 0 0 
8 0 0 
9 0 0 
10 0 0 
11 0 0 
12 0 0 
13 0 0 
14 0 0 
15 0 0 

-以下略-

オプション　-p

p=(30, 0, 0), w=(30, 0, 0)で実行

最小 最大 平均値 標準偏差 標準誤差

-586.437 (45, 25, 4) 42135.5 (31, 26, 12) 4099.79 5869.56 31.3741

z=0(ヘッダ)をmrcImageMakeDumpで見た場合

0 0 30 
1 0 0 
2 0 0 
3 0 5 
4 0 5 
5 0 5 
6 0 30 
7 0 0 
8 0 0 
9 0 0 
10 0 0 
11 0 0 
12 0 0 
13 0 0 
14 0 0 
15 0 0 

-以下略-

オプション　-x

x=30, w=(30, 0, 0)で実行

最小 最大 平均値 標準偏差 標準誤差

-618.193 (25, 39, 6) 37724 (12, 29, 11) 6170.05 6385.51 44.0642

z=0(ヘッダ)をmrcImageMakeDumpで見た場合

0 0 0 
1 0 0 
2 0 0 
3 0 5 
4 0 5 
5 0 5 
6 0 30 
7 0 0 
8 0 0 
9 0 0 
10 0 0 
11 0 0 
12 0 0 
13 0 0 
14 0 0 
15 0 0 

-以下略-

オプション　-m

m=1, w=(0, 15, 0)で実行

最小 最大 平均値 標準偏差 標準誤差

-3757.87 (20, 0, 7) 32675.7 (13, 17, 5) 5959.8 6481.03 60.1748

z=0(ヘッダ)をmrcImageMakeDumpで見た場合

0 0 0 
1 0 0 
2 0 0 
3 0 5 
4 0 5 
5 0 5 
6 0 0 
7 0 15 
8 0 0 
9 0 0 
10 0 0 
11 0 0 
12 0 0 
13 0 0 
14 0 0 
15 0 0 

-以下略-