mrcImageToNAMDConstantForces
提供: Eospedia
mrcImageToNAMDConstantForcesとは３次元画像の微分画像を使って、PDB画像のモデリングを施すEosのコマンドである。
オプション一覧
メインオプション
| オプション | 必須項目/選択項目 | 説明 | デフォルト |
|---|---|---|---|
| -i | 必須 | 入力ファイル: mrcImage | NULL |
| -ip | 必須 | 入力ファイル: PDB | NULL |
| -o | 選択 | 出力: PDB with Constant Force | stdout |
| -w | 選択 | 入力: Weight for Constant Force | 1.0 |
| -s | 選択 | 入力: Scaling Factor for Constant Force | 1.0 |
| -C | 選択 | 入力: Contour[if density>Contour, force=0] | 0.0 |
| -R | 選択 | 入力: RotateMode | 0 |
| -RW | 選択 | 入力: RotateWeight | 0.1 |
| -S | 選択 | 入力: Seed | 0.0 |
| -nowat | 選択 | No force for WAT (water residue) | |
| -c | 選択 | コンフィグファイル設定 | NULL |
| -m | 選択 | モードを設定 | 0 |
| -h | 選択 | ヘルプを表示 |
More Density is lower potential.
モードの詳細
| モード | 説明 |
|---|---|
| 0 |
実行例
入力ファイルの画像
-i のファイルの画像
|
|
最小 最大 |
0 (0, 0, 0) 3500.79 (49, 53, 30) |
-ipのファイルの画像
 |
重心 最大半径 |
6.053012e+00 2.519590e+01 1.189075e+01 3.286664e+01 |
オプション必須項目のみの場合
 |
重心 最大半径 |
3.329278e+01 4.215719e+01 4.546610e+01 1.405992e+03 |
