mrcRefHeaderCreate
提供: Eospedia
mrcRefHeaderCreateとは参照投影像にRefヘッダ情報を付加するEosのコマンドである。このRefヘッダとはmrcImage形式ファイルのヘッダとは全く別のもので、mrcImage(Ref)のz=0に格納されている情報を指している。
目次
オプション一覧
メインオプション
| オプション | 必須項目/選択項目 | 説明 | デフォルト |
|---|---|---|---|
| -i | 必須 | 入力ファイル: mrcImage | NULL |
| -o | 必須 | 出力ファイル: mrcImage | NULL |
| -p | 選択 | 中心座標:(Phi[degree], Omega[degree], Alpha[degree]) | (0, 0, 0) |
| -w | 選択 | 幅:(Phi[±degree], Omega[±degree], Alpha[±degree]) | (360, 10, 10) |
| -d | 選択 | 間隔:(Phi[z軸周り], Omega[y軸], Alpha[x軸]) | (5, 5, 5) |
| -sy | 選択 | Start y (m=1のみ使用) | 0 |
| -ey | 選択 | End y (m=1のみ使用, デフォルト: Ny-1) | 0 |
| -refsize | 選択 | 参照データのサイズ | 0 |
| -c | 選択 | コンフィグファイル設定 | NULL |
| -m | 選択 | モードを設定 | 0 |
| -h | 選択 | ヘルプを表示 |
-p: Omega, Alphaは 0 または 180付近でなければならない。
モードの詳細
| モード | 説明 |
|---|---|
| 0 | |
| 1 |
実行例
入力ファイルの画像
|
サイズ モード |
( 56, 27, 326) mrcFloatImage |
オプション必須項目のみの場合
z=0をmrcImageMakeDumpで見た場合
0 0 0 1 0 0 2 0 0 3 0 5 4 0 5 5 0 5 6 0 360 7 0 10 8 0 10 9 0 0 10 0 0 11 0 0 12 0 0 13 0 0 14 0 0 15 0 0 -以下略-
z=156 〜 170の画像
 |
サイズ モード |
( 56, 27, 327) mrcFloatImage |
z=0にRefヘッダが加わるので、画像は1つずつずれる
オプション -p
p=(11, 12, 13)で実行
z=0をmrcImageMakeDumpで見た場合
0 0 11 1 0 12 2 0 13 3 0 5 4 0 5 5 0 5 6 0 360 7 0 10 8 0 10 9 0 0 10 0 0 11 0 0 12 0 0 13 0 0 14 0 0 15 0 0 -以下略-
オプション -w
w=(20, 30, 40)で実行
z=0をmrcImageMakeDumpで見た場合
0 0 0 1 0 0 2 0 0 3 0 5 4 0 5 5 0 5 6 0 20 7 0 30 8 0 40 9 0 0 10 0 0 11 0 0 12 0 0 13 0 0 14 0 0 15 0 0 -以下略-
オプション -d
d=(2, 6, 8)で実行
z=0をmrcImageMakeDumpで見た場合
0 0 0 1 0 0 2 0 0 3 0 2 4 0 6 5 0 8 6 0 360 7 0 10 8 0 10 9 0 0 10 0 0 11 0 0 12 0 0 13 0 0 14 0 0 15 0 0 -以下略-
オプション -m
m=1で実行
その他のオプションなし
z=0をmrcImageMakeDumpで見た場合
0 0 0 1 0 0 2 0 0 3 0 5 4 0 5 5 0 5 6 0 360 7 0 10 8 0 10 9 0 0 10 0 26 11 0 0 12 0 2.44886e+08 13 0 0 14 0 0 15 0 0 -以下略-
sy=7 ,ey=33, refsize=44で実行
z=0をmrcImageMakeDumpで見た場合
0 0 0 1 0 0 2 0 0 3 0 5 4 0 5 5 0 5 6 0 360 7 0 10 8 0 10 9 0 7 10 0 33 11 0 44 12 0 3.72162e+06 13 0 0 14 0 0 15 0 0 -以下略-
