mrcSinogramFET
提供: Eospedia
mrcSinogramFETとはシノグラムの特徴量(幅、歪度、尖度)を算出するEosのコマンドである。
目次
オプション一覧
メインオプション
オプション | 必須項目/選択項目 | 説明 | デフォルト |
---|---|---|---|
-i | 必須 | 入力ファイル: mrcImage(シノグラム) | NULL |
-o | 必須 | 出力ファイル: mrcImage(FET) | NULL |
-ch | 選択 | 出力ファイル: mrcImage(FET)(正規化データ) | NULL |
-sm | 選択 | SmoothingFilter(move range of column smoothing by moving-average) | 1 |
-c | 選択 | コンフィグファイル設定 | NULL |
-m | 選択 | モードを設定 | 0 |
-h | 選択 | ヘルプを表示 |
モードの詳細
モード | 説明 |
---|---|
0 |
出力ファイルのフォーマット
シノグラムの各θ毎に以下の値を出力する
幅 歪度 尖度 . . . . . . . . .
実行例
入力ファイルの画像
![]() |
最小 最大 |
0 (0, 0, 0) 65535 (77, 34, 0) |
オプション必須項目のみの場合
-oのファイルをmrcImageMakeDump(m=8)で見た場合
0.0614942 0.0325917 1.78762 0.0605712 0.0632562 1.93108 0.0639257 0.0789107 1.95908 0.0634946 -0.0737892 2.01836 0.0608277 0.202078 1.89107 0.0542547 0.144344 1.85886 0.0521331 0.10485 1.82517 0.0616536 0.0753629 1.8386 0.0620365 0.00882033 1.76001 0.0609849 -0.178435 1.8612 -中略- 0.0594001 0.0137078 1.69186 0.0641533 -0.0104053 1.8428 0.0666817 -0.0237231 1.73576 0.0679321 0.135993 1.93031 0.0616724 0.0270474 1.75367 0.0614942 -0.0325917 1.78763 0.0605712 -0.0632519 1.93109 0.0639255 -0.0789105 1.95908 0.0634947 0.0737856 2.01836 0.0608276 -0.202075 1.89107 -中略- 0.0577482 -0.05145 1.85321 0.060355 0.0692867 1.93637 0.0553964 0.0399175 1.82433 0.0564827 0.121926 1.75859 0.0580604 -0.00824017 1.65152 0.0594001 -0.0137042 1.69186 0.0640352 0.0111142 1.84374 0.0664901 0.0239018 1.73636 0.0676839 -0.135384 1.93055 0.0616659 -0.0268808 1.75356
-chのファイルをmrcImageMakeDump(m=8)で見た場合
-0.152068 0.261573 -0.50104 -0.224789 0.537886 0.937449 0.0395039 0.678946 1.2182 0.00553877 -0.697009 1.81255 -0.204582 1.78879 0.536229 -0.722448 1.26855 0.213237 -0.889606 0.912684 -0.124537 -0.139506 0.646977 0.01011 -0.109342 0.0473727 -0.777902 -0.192197 -1.63996 0.236728 -中略- -0.546908 -1.13077 -0.792131 -0.42261 0.0421458 -1.86576 -0.31706 0.091413 -1.46124 0.0574377 -0.125866 0.0522004 0.256643 -0.245871 -1.02104 0.355158 1.19331 0.929678 -0.138031 0.211614 -0.841446 -0.152069 -0.325784 -0.501014 -0.224792 -0.602058 0.937471 0.0394892 -0.743156 1.21819 -中略- -0.447208 -0.495713 0.156582 -0.241819 0.592226 0.990494 -0.632502 0.327584 -0.13293 -0.546909 1.06655 -0.792107 -0.422611 -0.106357 -1.86577 -0.317057 -0.155592 -1.46122 0.0481348 0.0680422 0.0616421 0.241547 0.183269 -1.01502 0.335601 -1.25203 0.932057 -0.13854 -0.274324 -0.842582
-o に対して正規化されているのが分かる。
オプション -sm
sm=2で実行
出力ファイルをmrcImageMakeDump(m=8)で見た場合
0.0918657 0.0344836 2.73613 0.0913183 0.0795521 2.8249 0.0925341 0.102712 2.91063 0.0939957 0.0341889 2.95426 0.0924467 0.0957727 2.92026 0.0878268 0.204839 2.84051 0.0834795 0.156225 2.80756 0.087179 0.121735 2.79743 0.0921307 0.0737197 2.76485 0.0917963 -0.0531793 2.77615 -中略- 0.0890158 0.0426021 2.63723 0.0920623 0.0332794 2.73287 0.0957031 0.0145639 2.75482 0.0975925 0.0877632 2.79858 0.0950878 0.113149 2.80753 0.0918689 0.028856 2.73619 0.0913183 -0.0162937 2.8249 0.0925339 -0.0394531 2.91063 0.0939957 0.0290656 2.95426 0.0924467 -0.0325166 2.92026 -中略- 0.0912556 -0.0290791 2.76966 0.0906757 -0.0484107 2.77224 0.0893372 0.0405465 2.86033 0.0881613 0.0862302 2.8459 0.0862251 0.11255 2.75701 0.0875571 0.0884708 2.6706 0.0890158 0.0206559 2.63723 0.0920033 0.0303331 2.73334 0.0955483 0.0491361 2.75559 0.0973726 -0.024113 2.799 0.0949605 -0.0495043 2.8076
-chのファイルをmrcImageMakeDump(m=8)で見た場合
-0.147819 -0.00778411 -0.845133 -0.191689 0.488046 0.274498 -0.0942456 0.74284 1.35589 0.0229111 -0.0110267 1.90633 -0.101244 0.666501 1.47737 -0.471537 1.86642 0.471413 -0.819977 1.33158 0.0557929 -0.523461 0.952127 -0.0719755 -0.126578 0.42388 -0.48294 -0.153379 -0.972225 -0.340396 -中略- -0.599897 -0.929452 -0.581873 -0.493149 -0.664574 -1.6718 -0.376236 0.0815337 -2.09267 -0.132058 -0.0210327 -0.886283 0.159758 -0.226934 -0.6094 0.311195 0.578382 -0.0574679 0.110442 0.857664 0.0554982 -0.147561 -0.0696975 -0.844402 -0.191692 -0.56642 0.274529 -0.0942552 -0.821213 1.3559 0.0229063 -0.0673908 1.90632 -中略- -0.243192 -0.919762 -0.389729 -0.350475 0.0589178 0.721506 -0.444726 0.561517 0.539406 -0.599912 0.851075 -0.581846 -0.49315 0.586167 -1.6718 -0.376234 -0.159912 -2.09267 -0.136788 -0.0534466 -0.880331 0.147347 0.153418 -0.599668 0.293568 -0.652446 -0.0521809 0.100236 -0.931793 0.0562801