mrcSinogramFETcalcSDforNormalize

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mrcSinogramFETcalcSDforNormalizeとはEosコマンドである。


オプション一覧

メインオプション

オプション 必須項目/選択項目 説明 デフォルト
-i 選択 入力ファイル: mrcImage(FET) NULL
-s 選択 selectFETfile 1
-l 必須 SDlibraryFile: mrcImage NULL
-o 選択 出力ファイル: mrcImage(SD) NULL
-ow 選択 出力ファイル: mrcImage(Weight)
-c 選択 コンフィグファイル設定 NULL
-m 選択 モードを設定 0
-h 選択 ヘルプを表示  


モードの詳細

モード 説明
0 SDlibraryFileから読み出して-o, -owへ出力する(必須オプション: -l)
1 SDlibraryFileを上書きする(必須オプション: -s, -i, -l)
SDlibraryFileはarray2mrcにて作成できる(サイズ: x=(特徴量の数 + 1), y=6(-ow を使用する場合はy=8), z=0, データ: 全て0.0)


-s の詳細

モード 説明
0 noise-free refarence FETdata
1 no-smoothing FET data
それ以外 smoothed FET data


実行例

入力ファイルのデータ

-i で使用するファイル
ファイル2: ファイル1を平滑化したデータ
ファイル3: ファイル1を平滑化したデータ


-l で使用するファイル
ファイル4: mrcImageMakeDump(m=8)で見た場合
              0               0               0               0 
              0               0               0               0 
              0               0               0               0 
              0               0               0               0 
              0               0               0               0 
              0               0               0               0 
              0               0               0               0 
              0               0               0               0 
ファイル5: mrcImageMakeDump(m=8)で見た場合
              1     6.10919e-05       0.0512343       0.0529243 
              1       0.0402937    -0.000261387         2.38748 
              1     5.77048e-05       0.0515095        0.053126 
              1       0.0401005    -0.000252081         2.39499 
              1     2.88663e+08     2.28348e+08     2.43567e+08 
              1         37006.6         23393.5         24685.6 
              1     4.11992e-05       0.0337029       0.0439789 
              1       0.0440661     -0.00141426         2.35982 


オプション必須項目のみの場合

-l: ファイル5を使用して実行
-o のデータをmrcImageMakeDump(m=8)で見た場合
    2.06095e+08     1.49409e+08      2.0163e+08 


-ow のデータをmrcImageMakeDump(m=8)で見た場合
              0     2.24369e-10     2.17289e-10 


オプション -m

m=1で実行

-l: ファイル4を使用して実行
s=0で実行
-i: ファイル0を使用して実行
-l のデータをmrcImageMakeDump(m=8)で見た場合
              0               0               0               0 
              0               0               0               0 
              0               0               0               0 
              0               0               0               0 
              0               0               0               0 
              0               0               0               0 
              1     4.11992e-05       0.0337029       0.0439789 
              1       0.0440661     -0.00141426         2.35982 


s=1で実行
-i: ファイル1を使用して実行
-l のデータをmrcImageMakeDump(m=8)で見た場合
              0               0               0               0 
              0               0               0               0 
              0               0               0               0 
              0               0               0               0 
              1     2.88663e+08     2.28348e+08     2.43567e+08 
              1         37006.6         23393.5         24685.6 
              0               0               0               0 
              0               0               0               0 


s=2で実行
-i: ファイル2を使用して実行
-l のデータをmrcImageMakeDump(m=8)で見た場合
              0               0               0               0 
              0               0               0               0 
              1     5.77048e-05       0.0515095        0.053126 
              1       0.0401005    -0.000252081         2.39499 
              0               0               0               0 
              0               0               0               0 
              0               0               0               0 
              0               0               0               0 


s=3で実行
-i: ファイル3を使用して実行
-l のデータをmrcImageMakeDump(m=8)で見た場合
              1     6.10919e-05       0.0512343       0.0529243 
              1       0.0402937    -0.000261387         2.38748 
              0               0               0               0 
              0               0               0               0 
              0               0               0               0 
              0               0               0               0 
              0               0               0               0 
              0               0               0               0