mrcSinogramFETcalcSDforNormalize
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mrcSinogramFETcalcSDforNormalizeとはEosのコマンドである。
目次
オプション一覧
メインオプション
| オプション | 必須項目/選択項目 | 説明 | デフォルト |
|---|---|---|---|
| -i | 選択 | 入力ファイル: mrcImage(FET) | NULL |
| -s | 選択 | selectFETfile | 1 |
| -l | 必須 | SDlibraryFile: mrcImage | NULL |
| -o | 選択 | 出力ファイル: mrcImage(SD) | NULL |
| -ow | 選択 | 出力ファイル: mrcImage(Weight) | |
| -c | 選択 | コンフィグファイル設定 | NULL |
| -m | 選択 | モードを設定 | 0 |
| -h | 選択 | ヘルプを表示 |
モードの詳細
| モード | 説明 |
|---|---|
| 0 | SDlibraryFileから読み出して-o, -owへ出力する(必須オプション: -l) |
| 1 | SDlibraryFileを上書きする(必須オプション: -s, -i, -l) |
SDlibraryFileはarray2mrcにて作成できる(サイズ: x=(特徴量の数 + 1), y=6(-ow を使用する場合はy=8), z=0, データ: 全て0.0)
-s の詳細
| モード | 説明 |
|---|---|
| 0 | noise-free refarence FETdata |
| 1 | no-smoothing FET data |
| それ以外 | smoothed FET data |
実行例
入力ファイルのデータ
-i で使用するファイル
ファイル2: ファイル1を平滑化したデータ
ファイル3: ファイル1を平滑化したデータ
-l で使用するファイル
ファイル4: mrcImageMakeDump(m=8)で見た場合
0 0 0 0
0 0 0 0
0 0 0 0
0 0 0 0
0 0 0 0
0 0 0 0
0 0 0 0
0 0 0 0
ファイル5: mrcImageMakeDump(m=8)で見た場合
1 6.10919e-05 0.0512343 0.0529243
1 0.0402937 -0.000261387 2.38748
1 5.77048e-05 0.0515095 0.053126
1 0.0401005 -0.000252081 2.39499
1 2.88663e+08 2.28348e+08 2.43567e+08
1 37006.6 23393.5 24685.6
1 4.11992e-05 0.0337029 0.0439789
1 0.0440661 -0.00141426 2.35982
オプション必須項目のみの場合
-l: ファイル5を使用して実行
-o のデータをmrcImageMakeDump(m=8)で見た場合
2.06095e+08 1.49409e+08 2.0163e+08
-ow のデータをmrcImageMakeDump(m=8)で見た場合
0 2.24369e-10 2.17289e-10
オプション -m
m=1で実行
-l: ファイル4を使用して実行
s=0で実行
-i: ファイル0を使用して実行
-l のデータをmrcImageMakeDump(m=8)で見た場合
0 0 0 0
0 0 0 0
0 0 0 0
0 0 0 0
0 0 0 0
0 0 0 0
1 4.11992e-05 0.0337029 0.0439789
1 0.0440661 -0.00141426 2.35982
s=1で実行
-i: ファイル1を使用して実行
-l のデータをmrcImageMakeDump(m=8)で見た場合
0 0 0 0
0 0 0 0
0 0 0 0
0 0 0 0
1 2.88663e+08 2.28348e+08 2.43567e+08
1 37006.6 23393.5 24685.6
0 0 0 0
0 0 0 0
s=2で実行
-i: ファイル2を使用して実行
-l のデータをmrcImageMakeDump(m=8)で見た場合
0 0 0 0
0 0 0 0
1 5.77048e-05 0.0515095 0.053126
1 0.0401005 -0.000252081 2.39499
0 0 0 0
0 0 0 0
0 0 0 0
0 0 0 0
s=3で実行
-i: ファイル3を使用して実行
-l のデータをmrcImageMakeDump(m=8)で見た場合
1 6.10919e-05 0.0512343 0.0529243
1 0.0402937 -0.000261387 2.38748
0 0 0 0
0 0 0 0
0 0 0 0
0 0 0 0
0 0 0 0
0 0 0 0
